| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM406671 | 1,061,785 | A→T | I36N (ATT→AAT) | llmg_1101 ← | putative secreted protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM406671 | 1,061,785 | 0 | A | T | 99.6% | 3200.6 / NA | 842 | I36N (ATT→AAT) | llmg_1101 | putative secreted protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base T (383/454); minor base C (0/3); total (383/459) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 849 total aligned reads displayed.
CTTTGTCAGCCAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAAATGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCAAGAAGAAGGACG > AM406671/1061639‑1061930 | gTCAGCCAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCt < 1:6527797/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCt < 2:326666/149‑1 (MQ=255) cAGCCAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCa < 2:3706450/149‑1 (MQ=255) ccAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACGTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAAtt < 2:6142012/149‑1 (MQ=255) gAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTccc < 1:5505851/149‑1 (MQ=255) aGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGAc > 2:2339998/1‑149 (MQ=255) aGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGAc < 2:7289244/149‑1 (MQ=255) aGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTAAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTGGAAAATTGTCCTCAATTGCCGAc > 2:5928838/1‑149 (MQ=255) ttttGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGaa < 2:5114620/149‑1 (MQ=255) ttGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGaaaa > 1:6675202/1‑149 (MQ=255) tGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAg > 2:1213718/1‑149 (MQ=255) ccATTTGACTTGCTGATGTTGAAGTCTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGtt > 2:5242531/1‑149 (MQ=255) cATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTg < 2:1710625/149‑1 (MQ=255) ttcgcaCTTTCTGATGTTGAACTGTCGGTAGCCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTCGGCCTCTTGCTCAAGTAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGc < 2:4542690/144‑1 (MQ=255) aTTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGc > 2:6333132/1‑149 (MQ=255) aCTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAg < 2:8535976/149‑1 (MQ=255) ttGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGaa < 1:1011774/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGt < 1:937414/149‑1 (MQ=255) tGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAGAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGttt < 2:3467549/149‑1 (MQ=255) gTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTgg < 2:5797612/149‑1 (MQ=255) gTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTgg > 2:9063966/1‑149 (MQ=255) gAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGt > 1:3172949/1‑149 (MQ=255) cTGTCATTAGTCACCGCAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACACCTAAAAGTTGACAATTGTCATCAATTCACGACTGAAAAGTTGCCACAGAAGTTTTTGGAGTGAt > 2:4702570/1‑149 (MQ=255) gTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCa > 2:8851834/1‑149 (MQ=255) agtagtCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTa > 2:719989/1‑149 (MQ=255) tagtCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTaaa > 1:8289213/1‑149 (MQ=255) tagtCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTaaa > 1:2918194/1‑149 (MQ=255) tCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaag > 1:5149978/1‑149 (MQ=255) tCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaag > 2:2173099/1‑149 (MQ=255) ccacAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaagaag > 1:8120348/1‑149 (MQ=255) acaAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaagaagaa > 1:3970810/1‑149 (MQ=255) caAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaagaagaag < 2:279097/149‑1 (MQ=255) caAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaagaagaag > 2:5469529/1‑149 (MQ=255) caAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAaagaagaag > 2:6564564/1‑149 (MQ=255) aaaaaCACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGc < 1:6375477/149‑1 (MQ=255) aaaCACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTa > 1:7041386/1‑149 (MQ=255) aaCACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTaa < 1:4330973/149‑1 (MQ=255) acacCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAg < 1:4761503/149‑1 (MQ=255) acacCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATACACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAg < 2:6747678/149‑1 (MQ=255) cacCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTAGCCCAAGGAGTGGAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGATAAGTCGCCGCCGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAgg > 2:8231582/1‑149 (MQ=255) ccTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGaa < 1:9217345/149‑1 (MQ=255) ccTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGaa < 2:4847433/149‑1 (MQ=255) cTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGaaa > 1:9493671/1‑149 (MQ=255) gCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCATAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGATAAGaaaaaa < 2:4022353/149‑1 (MQ=255) ttGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAg < 1:5681591/149‑1 (MQ=255) tGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAgg > 2:1470559/1‑149 (MQ=255) tGGTTTGATGTGCTACTTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAAGAgg < 2:1360804/149‑1 (MQ=255) ggTTTTATTTGATAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATACACTAATAAAAGTTAAAAATTGTCCTCAATTCCCTACTGACAAGTTACCGCAAAAGTTTTTGGAGTGACCAGTAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAATAggg < 2:4454443/149‑1 (MQ=255) ggTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAggg < 1:9094643/149‑1 (MQ=255) gTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGa < 2:8363763/149‑1 (MQ=255) ttGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGaaa > 1:447759/1‑149 (MQ=255) ttGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGaaa > 2:2878278/1‑149 (MQ=255) gATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAg > 1:7373/1‑149 (MQ=255) aTTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGa > 1:3269766/1‑149 (MQ=255) tctGCTAATTGCCGGCCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATGCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATGCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGAt < 1:3511620/147‑1 (MQ=255) ttGCTAGTTGCCTGGGCACTTGCTCACGGAGTGTAACATTCACGCCTAAAAGTTGAAAATTGGCCTCCATTCCCGAGTGAAAAGTTGACGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCTGTACTAAGAAAAAGAAAAAGAAAAATAGGGAAAAGATa < 2:6866880/149‑1 (MQ=255) ttGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAACAAAGGAAAAATAGGGAAAAGATa < 2:1916681/149‑1 (MQ=255) tGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGCAGCTAAGGAAAAATCGGGAACAGATaa > 2:9401441/1‑149 (MQ=255) cTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAg < 2:7549186/127‑1 (MQ=255) cTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAatt > 1:4624902/1‑149 (MQ=255) cTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAatt < 1:2528211/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAattat > 1:3816703/1‑149 (MQ=255) aaTTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAattat < 2:8671807/149‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGGACTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGAACAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAattat < 2:8073403/149‑1 (MQ=255) aTTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAattatt < 2:385190/149‑1 (MQ=255) tGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTAtttt < 1:3707479/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTAttttt < 1:7759361/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTAttttt < 1:6861064/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTAttttttt < 1:8571187/149‑1 (MQ=255) gggCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTAtttttttt > 1:2251431/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAattat < 2:4292912/140‑1 (MQ=255) gCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTtct < 1:874076/149‑1 (MQ=255) ccTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTtctc < 1:8941118/149‑1 (MQ=255) ctctTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCa < 1:1294017/149‑1 (MQ=255) ctTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATg < 1:6272707/149‑1 (MQ=255) tGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTANAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGAt > 1:5310092/1‑149 (MQ=255) cTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAg > 1:719836/1‑149 (MQ=255) tCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGc > 1:1453609/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCa > 1:6023627/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCa > 1:4128702/1‑149 (MQ=255) aaGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAg > 2:2626030/1‑149 (MQ=255) aaGGAGTGTAACAATCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTAAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAATTTTTGGAGTGATCAATAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAg < 2:7011107/149‑1 (MQ=255) ggAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGAt < 1:1716712/149‑1 (MQ=255) ggAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGAt > 1:4929087/1‑149 (MQ=255) gAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTAAAAAATAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATa < 2:5708588/149‑1 (MQ=255) aGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGAGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGAAAc > 1:7651145/1‑149 (MQ=255) gtgtAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATAcc > 1:189450/1‑149 (MQ=255) ttAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCAACAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAAAAGAAAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATAcccc < 2:3073273/148‑1 (MQ=255) cATTCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACaa < 1:587527/149‑1 (MQ=255) tCACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGa > 1:2047925/1‑149 (MQ=255) cACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCGGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGAt > 2:9197878/1‑149 (MQ=255) cACTCCTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGAt > 2:4977000/1‑149 (MQ=255) cTAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCaa > 2:7876137/1‑149 (MQ=255) tAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCaag > 1:9564010/1‑149 (MQ=255) tAAAAGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCaag < 2:7693913/149‑1 (MQ=255) aaaaGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCaaga > 2:1072130/1‑149 (MQ=255) aaGTTGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCaagaag < 2:7959011/149‑1 (MQ=255) tGAAAATTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCAAGAAGAAgg > 1:266571/1‑149 (MQ=255) aaaatTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCAAGAAGAAGGAc > 1:748775/1‑149 (MQ=255) aaaatTGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCAAGAAGAAGGAc > 2:2524518/1‑149 (MQ=255) | CTTTGTCAGCCAGAAAGGTTTTTGCCATTTGACTTGCTGATGTTGAACTGTCAGTAGTCACCACAAAAACACCTGCTTTGGTTTGATTTGCTAATTGCTGGGCCTCTTGCTCAAGGAGTGTAACATTCACTCCTAAAAGTTGAAAAATGTCCTCAATTCCCGACTGAAAAGTTGCCGCAGAAGTTTTTGGAGTGATCAGTAAAAAGAAGAAGCTAAGGAAAAATAGGGAAAAGATAATTATTTTTTTTCTCATGATAGCAGATACCCCACAATGATTCCAAGAAGAAGGACG > AM406671/1061639‑1061930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |