| Predicted mutation | ||||||
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| RA | AM406671 | 1,891,450 | C→A | W87L (TGG→TTG) | llmg_1911 ← | conserved hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | AM406671 | 1,891,450 | 0 | C | A | 99.9% | 3951.5 / NA | 986 | W87L (TGG→TTG) | llmg_1911 | conserved hypothetical protein |
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Only 100 of 1006 total aligned reads displayed.
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aTTCCTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCaaaaaa < 1:5950379/149‑1 (MQ=255) aTTCCTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCaaaaaa < 1:4114128/149‑1 (MQ=255) ttCCTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAg > 1:8106725/1‑149 (MQ=255) ccTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGa > 1:1764657/1‑149 (MQ=255) ccTATTGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGa > 1:1515332/1‑149 (MQ=255) aTTGTCATGGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCTCCCACAAAAAAAGTAGGGGGAAAAAGGATaa > 2:7167480/1‑149 (MQ=255) ttGTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAg > 1:833898/1‑149 (MQ=255) gTCATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAgcg > 1:9132366/1‑149 (MQ=255) cATTGGTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCCGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGcc > 2:6877354/1‑149 (MQ=255) gTATCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCAAt > 2:4073751/1‑149 (MQ=255) gTATCAATAATAACATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCAAAAGTAGTACTTTTTGTTGTACTTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAAGAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGCCAAAAAATGATAAGCGCCCCAAt < 2:373123/149‑1 (MQ=255) aTCAATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGCAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGTCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCAATCg > 1:937742/1‑149 (MQ=255) | ACAGATAAACCCAGTCAATTAGTAAAAATGCCAAAACAACAATAGGCAATAAAAGATTACCAATGGATTTTGACTCTCTTCGCCACATTTTAATCGTTAAAACAACAATACTAATGGGAACAACAATTCCTATTGTCATTGGTATCCATAATAATATTATAAAAGCTTCGGCAAAAAGTAGCCAAAGTAGTACTTTTTGTTGTAATTCTGTCAAGGCTAATCCAGAACCAATAATTCCATTTATCGTCACCCACAAAAAAAGTAGGGCAAAAAAGGATAAGCGCCCCAATCG > AM406671/1891304‑1891595 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |