Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
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RA | AM406671 | 2,044,751 | G→A | A37V (GCA→GTA) | ftsA ← | cell division protein ftsA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | AM406671 | 2,044,751 | 0 | G | A | 99.9% | 4383.6 / ‑5.2 | 1110 | A37V (GCA→GTA) | ftsA | cell division protein ftsA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base A (552/555); minor base C (1/0); total (553/557) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 |
Only 100 of 1110 total aligned reads displayed.
TTCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTGCGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGATTCAT > AM406671/2044606‑2044896 | ttCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGt > 1:1881785/1‑149 (MQ=255) ttCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATCCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGt > 1:6602671/1‑149 (MQ=255) cGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGttt < 1:3023903/149‑1 (MQ=255) cGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGCTAACTCGATCAATCGTCATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACCTCTCTTCGTAATGCTTGTACTACCTTCTCAATATCTACAAGAACTCCATTTTTAAGGCCATCCGATTTTACGttt < 2:8501308/149‑1 (MQ=255) gggAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCg < 2:3282111/149‑1 (MQ=255) ggAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGa > 1:2831950/1‑149 (MQ=255) gAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGac < 2:1311551/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACAcc < 1:2335705/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACAcc > 2:9268211/1‑149 (MQ=255) tttGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACAcc > 1:4568850/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCa < 1:3169756/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCa < 1:6433285/149‑1 (MQ=255) tGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCaa < 1:5517347/149‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |