| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | AM406671 | 912,718 | T→A | N79K (AAT→AAA) | llmg_0944 → | putative secreted protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | AM406671 | 912,718 | 0 | T | A | 99.8% | 4253.8 / NA | 1071 | N79K (AAT→AAA) | llmg_0944 | putative secreted protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (545/523); minor base C (1/1); total (547/524) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 1074 total aligned reads displayed.
ATTGTTTTTGGTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCTAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAATTTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCTTTTACTTGCAA > AM406671/912572‑912863 | tttttGGTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAAt > 1:9734972/1‑149 (MQ=255) tGGTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATgaga < 1:763066/149‑1 (MQ=255) ggTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGaa < 1:6623954/149‑1 (MQ=255) ggTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGaa < 2:6127169/149‑1 (MQ=255) gTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAAt > 1:10060692/1‑149 (MQ=255) aTTGTAATGATAGGACGACACCTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTCCGGCTACTCCGTAAGCTATTGCAAGCAAATTAAATTAGAATTc > 2:5082230/1‑149 (MQ=255) tAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGAt < 1:5227849/149‑1 (MQ=255) tAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGAt < 2:7895948/149‑1 (MQ=255) aTGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATAc > 2:2503974/1‑149 (MQ=255) aTGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTGAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATAc > 2:6824701/1‑149 (MQ=255) gATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCAANCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCa > 1:6325223/1‑149 (MQ=255) aGGACGACACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCa < 1:5839336/149‑1 (MQ=255) acgacACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAaga > 1:172598/1‑149 (MQ=255) acgacACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAaga < 2:774993/149‑1 (MQ=255) cgacACGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAagag < 1:2382721/149‑1 (MQ=255) cacGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCa > 2:9180055/1‑149 (MQ=255) aacGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCGAATTAAATGAGAATTCGGATCCCATCAAGAGTCa < 2:5294292/148‑1 (MQ=255) acGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCaa > 2:10948949/1‑149 (MQ=255) acGTTATTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCaa > 2:8673103/1‑149 (MQ=255) aTTTCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCa > 2:10426116/1‑149 (MQ=255) tttCTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAg > 1:9905110/1‑149 (MQ=255) cTAGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGa < 2:10198607/149‑1 (MQ=255) aGTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGAtt > 1:8271383/1‑149 (MQ=255) gtcaaaCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTa < 1:10301563/145‑1 (MQ=255) gTCAAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTa > 2:4499516/1‑149 (MQ=255) tcaaaCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTaa < 2:1435828/146‑1 (MQ=255) tcaaaCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTaa < 1:9567415/146‑1 (MQ=255) aaCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAggg < 1:8402392/141‑1 (MQ=255) aaCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCa > 1:6912963/1‑149 (MQ=255) aCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATTAAGAGTCAATGTCAGGGATTAATCaa > 2:4715063/1‑149 (MQ=255) aCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCaa < 1:8970763/149‑1 (MQ=255) aCAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCaa < 1:8069994/149‑1 (MQ=255) cAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAAt > 2:6353731/1‑149 (MQ=255) cAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAAt < 2:8053122/149‑1 (MQ=255) aGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAAtt < 2:3829959/149‑1 (MQ=255) taataTTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCgg > 1:8843890/1‑149 (MQ=255) aataTTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGc > 2:1873353/1‑149 (MQ=255) aataTTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGc > 1:408221/1‑149 (MQ=255) atatTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCa > 2:849321/1‑149 (MQ=255) tatTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCaa < 2:27150/149‑1 (MQ=255) atTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCaaa > 2:3552551/1‑149 (MQ=255) atTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCaaa > 1:5082625/1‑149 (MQ=255) atTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCaaa > 2:5500748/1‑149 (MQ=255) ttGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCaaaa > 2:290641/1‑149 (MQ=255) tGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAg < 1:7375251/149‑1 (MQ=255) aaaTTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAg > 2:6594242/1‑149 (MQ=255) aaaTTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAg < 2:3179310/149‑1 (MQ=255) aaTTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGt > 1:6447578/1‑149 (MQ=255) aTTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTa < 1:2540476/149‑1 (MQ=255) ttATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACt > 1:11194255/1‑149 (MQ=255) aGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCaa < 2:5748527/149‑1 (MQ=255) aaTCTCAAAACTTAACGGTTGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAGGCGACGAGTACTGACTCAAAg > 1:10978990/1‑149 (MQ=255) aaTCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAg > 1:1514850/1‑149 (MQ=255) aaTCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAg > 1:5705893/1‑149 (MQ=255) tctcAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCt < 1:3098946/149‑1 (MQ=255) aaaCTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCt < 2:1272285/149‑1 (MQ=255) aaaCTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCt < 1:6029600/149‑1 (MQ=255) aCTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCtat < 2:7058446/149‑1 (MQ=255) aCTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATACGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCtat < 2:9382613/149‑1 (MQ=255) cTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCtata < 2:4874425/149‑1 (MQ=255) cTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCtata > 2:4150760/1‑149 (MQ=255) ttAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATAc > 2:8974323/1‑149 (MQ=255) ttAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATAc > 1:8655172/1‑149 (MQ=255) tAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACt > 2:9120594/1‑149 (MQ=255) aaCGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACtt > 1:715366/1‑149 (MQ=255) aaCGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACtt < 1:8494594/149‑1 (MQ=255) cGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTa > 1:2785407/1‑149 (MQ=255) ggAAGCAGCGGATCAAATTGGGTCCGCTACGCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTATATGAGAAGTCGGACACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGAGTAATCAATTCGGCAACAACGACGAGTACTGACTCAAAGCTGCACTACACGTTAg > 2:3383235/1‑149 (MQ=255) gATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGa < 1:4272294/149‑1 (MQ=255) gATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGa < 1:4446147/149‑1 (MQ=255) aTGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGaa < 1:5332418/149‑1 (MQ=255) gCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtc > 1:190654/1‑149 (MQ=255) cAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtct > 1:10852608/1‑149 (MQ=255) aGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtctt < 1:10457956/149‑1 (MQ=255) gCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtcttc > 2:739563/1‑149 (MQ=255) gCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtcttc > 2:2089507/1‑149 (MQ=255) cGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAAtcttct < 2:5951832/149‑1 (MQ=255) ggATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTa < 1:9346448/149‑1 (MQ=255) ggATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTa < 2:1643952/149‑1 (MQ=255) gATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTaa < 2:8280906/149‑1 (MQ=255) aTCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAg > 1:4926878/1‑149 (MQ=255) aTCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAg > 1:1149222/1‑149 (MQ=255) tCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGc > 2:1063610/1‑149 (MQ=255) tCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGc > 2:10817908/1‑149 (MQ=255) cAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCt < 1:2126510/149‑1 (MQ=255) aaTTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTta > 1:5548173/1‑149 (MQ=255) aaTTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTAAATATCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACGTTAGAATCTTCTAAGCTta > 1:3523085/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATaaa < 1:4717997/149‑1 (MQ=255) ggCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCaa > 1:7876135/1‑149 (MQ=255) ggCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCaa > 1:6135197/1‑149 (MQ=255) tACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTAAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCg < 1:335660/149‑1 (MQ=255) cTCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGt > 2:1750141/1‑148 (MQ=255) tCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGCATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGAATCAAAGCTGACATATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTg > 2:4290391/1‑149 (MQ=255) tCCGTCAGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTg < 2:11093434/149‑1 (MQ=255) aGCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGccc > 2:2394290/1‑149 (MQ=255) gCTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCt < 1:1386388/149‑1 (MQ=255) cTATTGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCtt < 2:11237516/149‑1 (MQ=255) ttGCAAGCAAATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCTTTTa > 1:3693087/1‑149 (MQ=255) gcaagcaaATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCTTTTACt > 2:9611582/1‑149 (MQ=255) gcaaATTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCTTTTACTTGCa > 2:10323819/1‑149 (MQ=255) | ATTGTTTTTGGTATTGTAATGATAGGACGACACGTTATTTCTAGTCTAACAGATAATATTGCAGCAAAATTTATACCAGAATCTCAAAACTTAACGGATGCAGCGGATCAAATTGGTTCGGCTACTCCGTCAGCTATTGCAAGCAATTTAAATGAGAATTCGGATACCATCAAGAGTCAATCTCAGGGATTAATCAATTCGGCAAAAGCGACGAGTACTGACTCAAAGCTGACCTATACTTTAGAATCTTCTAAGCTTAATAAAGCAACCGTTGGTGCCCTTTTACTTGCAA > AM406671/912572‑912863 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |