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Only 100 of 669 total aligned reads displayed.
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tcagtattaaA‑TAGTATTATTAATTTTAATACTAGACCTACAAAAATTTATAGCTATGCTTTGAGAAAAAGCAAACTTTTTCGTAAAGATATACCTAAAAAATGAGAGAGCGTTATTATTNTAATCGTTAAAATTAAGATAAGAATCtt < 1:5101895/149‑1 (MQ=255) tcagtattaaA‑TAGTATTATTAATTTTAATACTAGACCTACAAAAATTTATAGCTAGGCTTTGAGAAAAAGCAAACTTTTTCGTAAAGATATACCTAAAAAATGAGAGAGCGTTATTATTTTAATCGTTAAAATTAAGATAAGAATCtt < 2:8387306/149‑1 (MQ=39) | AGGGTCAGTATTAGGGTCGGTATTAGGGTCAGTATTAGGGTCGGTATTGAGGTCAGTATTGAGGTTAGTATCGGGGTCAGTATTGAGGTCAGTATTAGGGTTAGTATTAGGGTCGGTATTAGGGTCAGTATTAAGGTCAGTATTAAAGTGATATTATTAATTTTAATACTAGACCTACAAAAATTTATAGCTATGCTTTGAGAAAAAGCAAACTTTTTCGTAAAGATATACCTAAAAAATGAGAGAGCGTTATTATTTTAATCGTTAAAATTAAGATAAGAATCTTT > AM406671/1223408‑1223694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |