Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | AM406671 | 2,044,751 | G→A | A37V (GCA→GTA) | ftsA ← | cell division protein ftsA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | AM406671 | 2,044,751 | 0 | G | A | 99.6% | 3896.6 / NA | 983 | A37V (GCA→GTA) | ftsA | cell division protein ftsA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (549/428); minor base C (3/1); total (553/430) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 983 total aligned reads displayed.
TTTCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTGCGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGATTCAT > AM406671/2044605‑2044896 | tCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGtt < 2:9042005/149‑1 (MQ=255) cGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGttt > 2:2151270/1‑149 (MQ=255) aGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTcc > 1:6852363/1‑149 (MQ=255) gAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGac > 1:5953690/1‑149 (MQ=255) gAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGac > 2:7149800/1‑149 (MQ=255) aaTTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGaca > 1:3675441/1‑149 (MQ=255) gCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAAt > 2:4243555/1‑149 (MQ=255) ggAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATtat > 1:4074817/1‑149 (MQ=255) gAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATtata > 1:3395512/1‑149 (MQ=255) aTGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCAATTTTTAAGGCCATTGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATAtt > 2:2468469/1‑149 (MQ=255) cTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCAt > 2:8448917/1‑149 (MQ=255) tCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCAtt < 1:7477511/149‑1 (MQ=255) aCGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTc > 1:5852008/1‑149 (MQ=255) cGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCa > 1:4621937/1‑149 (MQ=255) gTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCAc < 2:1483985/149‑1 (MQ=255) ttAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCAcc > 2:3061791/1‑149 (MQ=255) ttAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCAcc > 1:1203221/1‑149 (MQ=255) tAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCt > 1:9160599/1‑149 (MQ=255) aTTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTga > 1:7750529/1‑149 (MQ=255) aTTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTga > 2:4399851/1‑149 (MQ=255) aTTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTga > 1:857263/1‑149 (MQ=255) aTTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTga > 2:2734627/1‑149 (MQ=255) ttCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTgag < 1:6741039/149‑1 (MQ=255) gATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACg > 1:4243907/1‑149 (MQ=255) gATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACg > 2:7814160/1‑149 (MQ=255) cAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTAt > 1:3033981/1‑149 (MQ=255) aTCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTTATGCTTGTGCTCCCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTTCGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAACCGTATTc > 2:1268644/1‑149 (MQ=255) aTCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTc > 1:1716345/1‑149 (MQ=255) tCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCa < 1:959593/149‑1 (MQ=255) cGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAg < 1:4825159/149‑1 (MQ=255) cGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAg > 1:618644/1‑149 (MQ=255) tGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGca < 2:2874731/149‑1 (MQ=255) gATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGcaa > 2:3967774/1‑149 (MQ=255) aTTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGAGGTATTCAGcaac > 2:5456945/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGcaaca > 1:4367941/1‑149 (MQ=255) ttCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGcaaca > 1:350128/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCATAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGcaacaa < 1:886437/149‑1 (MQ=255) ggCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCa > 1:1894383/1‑149 (MQ=255) gcgcGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCAc > 1:3799202/1‑149 (MQ=255) cgcgTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCAcc > 2:9154923/1‑149 (MQ=255) cgTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCtt < 1:6374274/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCttt > 1:1022705/1‑149 (MQ=255) tcttcAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTAt > 2:6771042/1‑149 (MQ=255) tcttcAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTAt > 2:3287407/1‑149 (MQ=255) tcttcAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTAt < 2:1129280/149‑1 (MQ=255) tcAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATtgt < 2:2013359/149‑1 (MQ=255) agcagcATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTgtgt < 2:8897962/149‑1 (MQ=255) agcagcATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTgtgt > 2:4119867/1‑149 (MQ=255) agcaTTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTg < 1:8119834/149‑1 (MQ=255) gcaTTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGt > 1:8976598/1‑149 (MQ=255) aTTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTcc < 1:7308561/149‑1 (MQ=255) aTTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTcc > 1:3917818/1‑149 (MQ=255) tttACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTccc > 2:7939200/1‑149 (MQ=255) tACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGa > 2:7260738/1‑149 (MQ=255) aCAGCTTTTCGTAATACTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGat < 2:6072649/149‑1 (MQ=255) cAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGata > 1:2275391/1‑149 (MQ=255) aGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGatat < 1:1581258/149‑1 (MQ=255) cTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCt < 2:8162629/149‑1 (MQ=255) tCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGc > 1:8387443/1‑149 (MQ=255) tCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGc > 1:7147574/1‑149 (MQ=255) cGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGtt < 1:7608112/131‑1 (MQ=255) tGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGtat > 1:791487/1‑149 (MQ=255) gCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGCTTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACCCCTGtata > 1:545866/1‑149 (MQ=255) gtgCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGt < 2:3804803/149‑1 (MQ=255) tACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCAc < 1:6976947/149‑1 (MQ=255) tACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGGCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCAc < 2:6466974/149‑1 (MQ=255) aCCTTCTCAATATCTACAATCATTCCATTTTTAAGGCCATCCGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTCTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACt < 2:476500/149‑1 (MQ=255) ccTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACtt < 2:761309/149‑1 (MQ=255) ccTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACtt > 1:564149/1‑149 (MQ=255) cTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACttt > 1:2785744/1‑149 (MQ=255) tcAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGc > 2:2330012/1‑149 (MQ=255) tcAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGc > 2:4944564/1‑149 (MQ=255) cAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTCTCCGACAACAATTATATTCATTTCACCTGCGACGTATTCAGGGACAAGCACCTTTATTGGGTGTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTggac > 2:6628924/1‑147 (MQ=255) aaTATCTACAATAATTCCATTTTTTTTTTTTTTTTATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCTCTTTTGGCCa > 2:3648363/1‑149 (MQ=255) aaTATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCa > 2:4617849/1‑149 (MQ=255) atatCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCAt > 1:1088012/1‑149 (MQ=255) tCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATaaa > 2:6389878/1‑149 (MQ=255) tACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAg > 2:1845414/1‑149 (MQ=255) cAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCg > 2:743803/1‑149 (MQ=255) ataatTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGAc < 1:244749/149‑1 (MQ=255) ataatTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGAc > 2:3405873/1‑149 (MQ=255) atTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACATTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTcc < 2:5325467/149‑1 (MQ=255) ttCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTAACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCt > 2:5056296/1‑149 (MQ=255) aTTTTTAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTcc < 1:5209206/149‑1 (MQ=255) aTTTTTAACGCCATCTGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCATTTTTTTTTTTAATGATACGGCGACCCCCGAGATCTACACCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTcc < 2:5849181/149‑1 (MQ=255) tttttAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTccc > 2:1716924/1‑149 (MQ=255) ttttAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCt > 2:85153/1‑149 (MQ=255) ttAAGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTca > 1:3244848/1‑149 (MQ=255) aaGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTcaca > 1:6089515/1‑149 (MQ=255) aaGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTcaca > 1:8676270/1‑149 (MQ=255) aGGCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTcacac > 1:499283/1‑149 (MQ=255) ggCCATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTcacaca < 2:6924901/149‑1 (MQ=255) ccATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATc < 1:2602822/149‑1 (MQ=255) ccATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATc < 1:6481540/149‑1 (MQ=255) cATCGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCa > 2:6227499/1‑149 (MQ=255) cGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGa > 1:8787098/1‑149 (MQ=255) cGGATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGa > 2:568128/1‑149 (MQ=255) gATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGAtt > 1:4160217/1‑149 (MQ=255) gATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGAtt < 1:1391752/149‑1 (MQ=255) gATTTTACGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGAtt < 2:8672907/149‑1 (MQ=255) | TTTCGAGGGAATTTGCTGGAATGCTCACGTTAATTCGATCAATCGTGATTCCGGCGCGTTCTTCAGCAGCATTTACAGCTTTTCGTAATGCTTGTGCTACCTTCTCAATATCTACAATAATTCCATTTTTAAGGCCATCGGATTTTGCGTTTCCGACACCAATTATATTCATTTCACCTGAGACGTATTCAGCAACAAGCACCTTTATTGTGTTTGTCCCGATATCTACGCCTGTATAAAGTCCACTTTTGGCCATAAAAGCGACTCCTTTCCCTCACACATCACGATTCAT > AM406671/2044605‑2044896 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |