Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 1733288 = | 36 (0.130) | 299 (1.130) | 116/146 | 0.1 | 90.2% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
? | REL606 | = 1733295 | 30 (0.110) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
Only 100 of 629 total aligned reads displayed.
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 | tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg > 1:5030930‑M1/69‑76 (MQ=255) aGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaa > 1:1578342‑M2/1‑74 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 2:6331095‑M1/66‑76 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 2:7821662‑M2/76‑5 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg > 2:4990514‑M2/1‑72 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGtt < 1:460967‑M1/14‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 2:4425356‑M1/16‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:7727582‑M1/61‑76 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:5440909‑M1/16‑1 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:5121288‑M2/1‑68 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 1:2618553‑M1/17‑1 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 1:8791010‑M1/60‑76 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 2:6918946‑M1/18‑1 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 2:1797512‑M1/18‑1 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa > 1:3712686‑M2/1‑66 (MQ=255) tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCacta < 1:4173836‑M1/20‑1 (MQ=255) aCCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagg > 2:2886962‑M2/1‑64 (MQ=255) 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accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa < 1:2511893‑M1/24‑1 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:3553805‑M2/1‑59 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 2:3780532‑M2/76‑20 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 1:1381863‑M2/76‑20 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 1:1959116‑M2/76‑21 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg > 2:1030512‑M1/49‑76 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 2:1936311‑M2/76‑22 (MQ=255) tgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt > 1:3481677‑M1/48‑76 (MQ=255) tgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt < 1:8491120‑M1/29‑1 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 1:8151883‑M1/30‑1 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 2:5561329‑M1/30‑1 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 1:7107943‑M1/30‑1 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:2829301‑M2/76‑24 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGGAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:280286‑M2/76‑24 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga < 1:2665963‑M2/76‑25 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga < 1:3020549‑M2/76‑25 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg > 2:931752‑M1/42‑76 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGGTTCACTACTTACCTGTCTGTTg < 2:2756772‑M1/35‑1 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:2250213‑M2/1‑49 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg < 2:2201699‑M1/36‑1 (MQ=255) tctgtgatcggcaacagcgaaagggttgctgtaacgtatgAACGTAGGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg > 2:8505980‑M1/41‑76 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg > 2:3990122‑M2/1‑48 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 2:3446415‑M1/38‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa > 1:1704891‑M1/39‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:7625388‑M1/39‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:6235853‑M1/39‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:4199835‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatagttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac > 2:4692443‑M1/37‑76 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 2:8121861‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:7020346‑M1/41‑1 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 1:5969463‑M1/42‑1 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 2:8783884‑M1/31‑76 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 2:7203807‑M2/1‑37 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgctggcaa < 2:5252909‑M2/76‑40 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 1:8233133‑M2/76‑41 (MQ=255) cagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTgg < 1:892933‑M1/50‑1 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 2:2322941‑M2/76‑43 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 2:2422390‑M2/76‑43 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 1:6761994‑M2/76‑43 (MQ=255) ggCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt > 1:7751635‑M2/1‑31 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 2:8364077‑M1/24‑76 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa > 1:5912166‑M1/23‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 2:113734‑M2/1‑30 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg < 1:1090476‑M1/56‑1 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggt > 1:7283914‑M2/1‑25 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggt < 2:7499781‑M2/76‑52 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 1:6140842‑M1/14‑76 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg > 1:1923921‑M2/1‑20 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg < 1:4464351‑M2/76‑57 (MQ=255) aTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgagga < 2:6773909‑M2/76‑58 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt < 2:4336189‑M1/66‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg < 2:3198325‑M2/76‑60 (MQ=255) tGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtc < 1:3885956‑M2/76‑63 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 2:5949161‑M1/70‑1 (MQ=255) 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gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 1:666091‑M2/1‑10 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat < 1:2828119‑M2/76‑67 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc > 1:3208341‑M2/1‑9 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:2197230‑M2/76‑68 (MQ=255) cGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGt > 1:6533131/1‑76 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:338276/76‑1 (MQ=255) gggAAGCTTTCACCACTGACCGGTCTGTGGGCAACACCGTACTGGGGGACGATAGACGGATCGGGAAAGAAGGTAc < 2:5828063/74‑1 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 1:2039581‑M2/76‑74 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggcctgatcggtatg < 1:4024257‑M2/76‑74 (MQ=255) aTGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAc < 2:1404321/76‑1 (MQ=255) tgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtttgatcggtttgg < 2:8561566‑M2/76‑75 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |