| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 4097453 = | 87 (0.310) | 250 (0.890) | 85/148 | 0.3 | 70.4% | coding (120/846 nt) | glpF | glycerol facilitator |
| ? | REL606 | = 4097477 | 124 (0.440) | coding (96/846 nt) | glpF | glycerol facilitator | |||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
CCTCGGTACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/4097528‑4097453‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCCATCTA < REL606/4097477‑4097403 CCTCGGTACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 2:7795299/76‑1 CGGTACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAA < 1:783493/76‑1 CGGTACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAA < 1:5560025/76‑1 TACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGT > 2:1381405/1‑76 ACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTC < 2:3934385/76‑1 CCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCG > 1:9128726/1‑76 CCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCG < 2:2122693/76‑1 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCCGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGGCGC > 2:2935801/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:3050847/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:1469612/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:22847/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:2679364/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:3861265/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:8276447/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:8853163/1‑76 CGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCCCTGGGGCGGCTTTTGGTAAAAGTCGC > 2:512852/1‑76 GGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCT > 1:7450716/1‑76 GGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGGCTTTTGGTAAAAGGCGCT > 1:8889412/1‑76 GGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTG < 2:4618661/76‑1 TTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGT < 2:176712/76‑1 TGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTG < 2:1282/76‑1 GTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGggg > 1:4907761/1‑73 GTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGGGC > 1:3768926/1‑76 GTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAA < 1:2325351/64‑1 TTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCG < 2:5888230/76‑1 ATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCT > 1:4879338/1‑76 TTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTT > 1:1754978/1‑76 TTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTT < 2:2202281/76‑1 TTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTT < 2:3672611/76‑1 TTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTT < 2:1722960/76‑1 TTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTT < 2:4052441/76‑1 TTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTT < 1:665420/76‑1 TTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTT < 2:4193774/76‑1 TCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTG < 2:6539454/76‑1 TCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTG > 1:9313524/1‑76 TCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGGGCGTGTTTTG > 1:449589/1‑76 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 2:6644488/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 2:9072870/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 2:9494435/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:98835/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:1039542/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:4735654/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:503681/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:5170812/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:4388318/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:720272/76‑1 TTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT < 1:6304485/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGTGTCTTTTGGTC < 2:8618301/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTC < 2:4662321/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTC < 2:2512788/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTC < 2:4167820/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTC < 2:5175537/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTC < 2:7392020/76‑1 TCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGCGCGTCTTTTGGTC > 2:4417868/1‑76 CGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTta > 1:3275389/1‑74 GGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAG < 2:928342/76‑1 GTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCCGT > 2:9130526/1‑76 GTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGT < 1:8995632/76‑1 GTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGGGCGTCTTTTGGTCAGg > 1:5995734/1‑75 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:3623633/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:3273407/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:6179345/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:6041611/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC > 2:7076238/1‑76 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:8982480/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:5739105/76‑1 TGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATC < 2:5621343/76‑1 CGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAG < 2:8762226/76‑1 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ACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTG > 2:6698164/1‑76 ACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTG > 1:8982842/1‑76 TAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGG < 1:3142491/76‑1 AAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGGAATCAGTGTCATTTGTGG > 2:7508009/1‑76 TCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGG > 2:7027548/1‑76 TCGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGG < 1:6166815/76‑1 CGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGG < 1:9056467/76‑1 CGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGG < 1:3223017/76‑1 CGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGG > 2:5286818/1‑76 CGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGG > 1:4478202/1‑76 CGCTGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGG > 1:7139792/1‑76 TGGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGT < 2:721194/76‑1 GGTGCGTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGgg > 1:3394325/1‑74 GTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAAT < 1:2645555/76‑1 GTCTTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCACTGGGGAATCAGGGTCATTTGGGGACTGGGTGTGGCAAT > 2:3435329/1‑76 TTTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGC > 1:8671638/1‑76 TTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCC > 1:223996/1‑76 TTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCC > 1:3514490/1‑76 TTTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCC > 1:8069431/1‑76 TTGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGGGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCCA > 1:4020250/1‑76 TGGTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCCAT > 2:7065397/1‑76 TAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCCATCTA < 2:6358955/76‑1 CCTCGGTACCGGGTTGTTGATTTTCTTCGGTGTGGGTTGCGTTGCAGCACTAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/4097528‑4097453‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tAAAAGTCGCTGGTGCGTCTTTTGGTCAGTGGGAAATCAGTGTCATTTGGGGACTGGGGGTGGCAATGGCCATCTA < REL606/4097477‑4097403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |