| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3582336 | 356 (1.130) | 9 (0.030) | 7/140 | 20.7 | 2.8% | coding (356/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3582485 | 289 (0.980) | coding (505/1224 nt) | yhiS | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3582257‑3582336‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aataaAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATGA < REL606/3582485‑3582411 AGTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTA < 2:4928518/76‑1AGTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTA > 2:3454224/1‑76AGTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTA < 2:10223207/76‑1 GTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAA < 1:7274110/76‑1 GTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAA < 2:10159349/76‑1 GTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAA > 1:1885025/1‑76 GTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAA < 2:329866/76‑1 GTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAA > 1:127983/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT < 1:3542042/76‑1 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 1:839742/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT < 1:6301172/76‑1 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 1:56656/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 1:3571105/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 2:8151700/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 2:8471998/1‑76 TCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAAT > 2:9987578/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 2:1092582/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 2:2562355/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 2:4415725/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 2:5374870/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:904292/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:8673939/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:7298410/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 1:1831689/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 1:16760/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:4858272/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:5549378/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 1:6056528/1‑76 CTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA < 1:7206007/76‑1 CTTATTACTAACATTGAAACCATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATA > 1:2864936/1‑76 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:8132330/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:5277334/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA > 1:1784508/1‑76 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:7181798/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:10216385/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:1711511/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 2:8393349/76‑1 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA > 1:7417210/1‑76 TTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA < 1:1417971/76‑1 CAATCAATACTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCC > 2:9914253/1‑76 ATCAATACTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTC > 2:7353176/1‑76 TACTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTA > 2:2480239/1‑76 TACTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTA > 2:5923925/1‑76 TACTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTA > 2:10260762/1‑76 CTTAATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACG > 2:3459147/1‑76 TTAATCAGATTAATAAAATTAGAATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTTCGC > 2:309033/1‑76 ATCAGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAA > 2:5226174/1‑76 AGATTAATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTT > 2:8633505/1‑76 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT < 2:7466448/76‑1 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT < 1:1366930/76‑1 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT < 2:385671/76‑1 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT < 1:2068553/76‑1 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT > 2:10250747/1‑76 AATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGGATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTT > 1:1810149/1‑76 ATAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTA > 2:8622029/1‑76 TAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTAT < 2:1406522/76‑1 TAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTAT < 1:5411664/76‑1 TAAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTAT < 1:910734/76‑1 AAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATG > 2:7769244/1‑76 AAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATG > 1:232646/1‑76 AAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATG > 2:1784508/1‑76 AAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATG < 2:8478162/76‑1 AAAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATG > 1:9030524/1‑76 AAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATGA < 2:5098104/76‑1 AAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATGA > 2:7175819/1‑76 AAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATGA < 2:3552691/76‑1 AGTCTTATTACTAACATTGAAACGATAAGTTCGACACAACTTACGCAACAGACACAATCAATACTTAATCAGATTAATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/3582257‑3582336‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aataaAATTAGTATCTGAAAACATGGTTTGGACACTGAATGTTATGGGTATTCCCTCTTCTACGCTAATTTTAGTTATGA < REL606/3582485‑3582411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |