| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 10 (0.160) | 65 (1.070) | 48/146 | 0.2 | 87.4% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 9 (0.150) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGA > REL606/1733213‑1733362 | ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa > 1:426359/1‑76 (MQ=255)ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 1:109556/76‑1 (MQ=255) gtggtcagacctttactttcaccactgagaaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg > 1:320279‑M1/73‑76 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctattatcgncaacagcgaaatggttgcngtnacgtatgaacgt < 1:1666673‑M1/5‑1 (MQ=255) ctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt < 2:844927/76‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAGACCTTTACTCTCACNACNGGNAACTCTGNTATCGGTAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTAt < 1:1768964/76‑1 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:1865221/1‑76 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 1:1077075‑M1/10‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac > 1:1153719‑M2/1‑73 (MQ=255) acctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacatcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAgg > 1:757860‑M1/65‑76 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:1149487‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTATTATCGNCAACAGCGAAATGGTTGCNGTNACGTATGaacgt < 1:1666673‑M2/76‑6 (MQ=255) cctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaaggtatgAACGTATGAAGGt > 1:961052‑M1/64‑76 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:248977‑M2/76‑9 (MQ=255) tcctttcaccactgataaatctgtaatcnccaacagcgatatggttgcagnaatgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 1:297703‑M1/17‑1 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 2:264107‑M1/17‑1 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 1:883552‑M1/17‑1 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac > 1:1719918‑M1/59‑76 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 1:1077075‑M2/76‑11 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact > 2:386965‑M1/58‑76 (MQ=255) aCCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACATCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagg > 1:757860‑M2/1‑64 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 2:814834‑M1/56‑76 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac < 2:1565802‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac < 1:220031‑M1/21‑1 (MQ=255) ccTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAAGGTATGaacgtatgaaggt > 1:961052‑M2/1‑63 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:837876‑M1/55‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 2:1486604‑M1/22‑1 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt < 1:492089‑M2/76‑16 (MQ=255) tccttTCACCACTGATAAATCTGTAATCNCCAACAGCGATATGGTTGCAGNAATGTATGaacgtatgaaggtttca < 1:297703‑M2/74‑18 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 1:883552‑M2/76‑18 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 2:264107‑M2/76‑18 (MQ=255) cactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAcc > 2:1603998‑M1/51‑76 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 2:386965‑M2/1‑57 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACct < 2:914345‑M1/27‑1 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg < 2:1605028‑M1/28‑1 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 1:220031‑M2/76‑22 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 2:1565802‑M2/76‑22 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:837876‑M2/1‑54 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtgacctatgAACGNATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 1:1783685‑M1/45‑76 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 2:1589823‑M1/45‑76 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACcggtctg > 2:1952044‑M1/45‑76 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:1738075‑M1/34‑1 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg < 1:591892‑M1/35‑1 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg < 2:1605028‑M2/76‑29 (MQ=255) ctgttatcggctacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 1:115127‑M1/37‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 1:1439988‑M1/38‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 2:482372‑M1/39‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGGTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGcac < 2:66575‑M1/39‑2 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:793185‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:422335‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac > 1:796502‑M1/37‑76 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTGACCTATGaacgnatgaaggtttcactactgacctgtctg > 1:1783685‑M2/1‑44 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg > 1:842538‑M2/1‑44 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg < 1:138823‑M2/76‑33 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg > 2:1589823‑M2/1‑44 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgaccggtctg > 2:1952044‑M2/1‑44 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTTTGTTGGAAaca < 2:1353213‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:1094077‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 2:1790098‑M1/41‑1 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTAACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 2:1353236‑M1/41‑1 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac > 2:1821541‑M1/35‑76 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttg < 1:591892‑M2/76‑36 (MQ=255) cTGTTATCGGCTACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc < 1:115127‑M2/76‑38 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca < 1:1439988‑M2/76‑39 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 2:245065‑M1/46‑1 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagggttcactactgacctgtctgttggcac < 2:66575‑M2/76‑40 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:793185‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac > 1:796502‑M2/1‑36 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtttgttggaaaca < 2:1353213‑M2/76‑42 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 2:1790098‑M2/76‑42 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtatcgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCCGTCAGTTGGCAACACCGTACTGGt > 2:107415‑M1/26‑76 (MQ=255) gcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGtt > 1:1076588‑M1/25‑76 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg < 2:1556067‑M1/53‑1 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 2:1149486‑M1/24‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 2:245065‑M2/76‑47 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 1:1074006‑M1/55‑1 (MQ=255) tggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGATCTGTATGTTGGCAACACCGTACTGGTTGacgtt < 2:1570914‑M1/58‑3 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactgg < 2:1099048‑M2/76‑51 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTATCGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacccgtcagttggcaacaccgtactggt > 2:107415‑M2/1‑25 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg < 2:1535457‑M1/60‑1 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggtt > 1:628644‑M2/1‑24 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 2:1149486‑M2/1‑23 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc > 2:426358‑M1/15‑76 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 2:702146‑M1/14‑76 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 2:1464592‑M1/14‑76 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 1:1074006‑M2/76‑56 (MQ=255) cggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTg > 1:422336‑M1/13‑76 (MQ=255) cggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTg < 1:1101742‑M1/64‑1 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc < 1:1303522‑M1/67‑1 (MQ=255) gTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatgg < 2:1535457‑M2/76‑61 (MQ=255) tGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtc > 2:426358‑M2/1‑14 (MQ=255) gCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtct > 2:1464592‑M2/1‑13 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg > 1:807271‑M2/1‑12 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg > 1:422336‑M2/1‑12 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg < 1:1101742‑M2/76‑65 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc > 1:777799‑M2/1‑9 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:1303522‑M2/76‑68 (MQ=255) tAACGTAGTAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGGAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa < 2:1991171/76‑1 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCNACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa > 1:1993096‑M1/2‑76 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa > 2:1038629‑M1/2‑76 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGA > REL606/1733213‑1733362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |