| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | REL606 | 1,305,796 | IS1 (+) +9 bp | coding (436‑444/1461 nt) | cls ← | cardiolipin synthetase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1193615 = | NA (NA) | 263 (1.130) | 105/150 | 0.2 | 97.9% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | = 1305804 | 5 (0.020) | coding (436/1461 nt) | cls | cardiolipin synthetase | |||||
| * | ? | REL606 | 1305796 = | 5 (0.020) | 285 (1.220) | 104/150 | 0.2 | 98.0% | coding (444/1461 nt) | cls | cardiolipin synthetase |
| ? | REL606 | = 1323488 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 285 total aligned reads displayed.
ATGACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1305870‑1305796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < REL606/1323488‑1323414 ATGACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGG > 2:6956721/1‑76 GACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGT > 1:466461/1‑76 GACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGT < 1:7477531/76‑1 GACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGT > 1:3613236/1‑76 gCCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTA < 1:7051776/75‑1 ACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTA < 2:455539/76‑1 ACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTA < 2:2408767/76‑1 ACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTA < 1:7110373/76‑1 CCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAA < 2:5031119/76‑1 GAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATG < 1:7681004/76‑1 GAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATG < 2:4465596/76‑1 GAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATG > 1:2852791/1‑76 AGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGA > 1:2543262/1‑76 CAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTC > 2:6061932/1‑76 AGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCC < 2:3805838/76‑1 AGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCC > 2:6405339/1‑76 GATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCA < 2:2086839/76‑1 ATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAA > 1:1989524/1‑76 ATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAA > 2:5197152/1‑76 TGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAAC > 1:6873988/1‑76 TGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAAC > 2:791716/1‑76 GATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACT > 1:607078/1‑76 GATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACT < 2:2978557/76‑1 GATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACT > 2:2316866/1‑76 ATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTT < 1:2267558/76‑1 TGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:393535/76‑1 TGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATT < 1:5180007/76‑1 TGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATT < 2:3930303/76‑1 GATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTG < 2:5237192/76‑1 GATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTG > 2:3568376/1‑76 GATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTG < 1:1230184/76‑1 ATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 2:6656483/76‑1 ATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 1:5880056/1‑76 TGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT > 2:859104/1‑76 TGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:4530417/76‑1 TGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 2:6540128/76‑1 GCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGACGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:3097192/76‑1 CAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAG > 1:6209272/1‑76 AGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 1:635189/1‑76 AGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGT > 2:1356725/1‑76 GGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG < 1:7181211/76‑1 GCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT > 1:4451908/1‑76 GCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGT < 1:7243889/76‑1 CGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:3779805/76‑1 GTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:4892955/76‑1 TAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:2191263/76‑1 TAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:1919987/76‑1 TAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA > 1:1376258/1‑76 AATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTAT > 2:5547733/1‑76 GCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:2480334/76‑1 GCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCA < 1:1139496/76‑1 GACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGA > 1:4212429/1‑76 ACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 2:7186093/1‑76 CATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATA < 2:328347/76‑1 ATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 1:1152765/76‑1 ATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 1:3649762/76‑1 TCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:509165/1‑76 TCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAT > 1:2828380/1‑76 CCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATG > 1:2127116/1‑76 AGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATTATGgg < 1:4809644/76‑3 GCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:7588610/76‑1 GCGCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:5081549/76‑1 GCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC > 1:5005466/1‑76 GCGCCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAC < 2:7434273/76‑1 CCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 1:4386429/1‑76 CCATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:2663197/76‑1 CATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 2:6805137/76‑1 ATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 1:860320/1‑76 ATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 1:5374178/1‑76 ATAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGT > 1:5539235/1‑76 TAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC < 2:7108098/76‑1 TAATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 2:1518250/1‑76 TAATATTGAGATGGAGGGTAATGACTCGAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 1:3995047/1‑76 AATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 1:4261070/1‑76 ATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT < 2:3055813/76‑1 ATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:6575573/1‑76 ATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 1:7400668/1‑76 ATATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAT > 2:7592128/1‑76 TATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 2:6157654/76‑1 TATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 2:4755523/76‑1 TATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATG < 1:5948283/76‑1 ATTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC > 1:3357543/1‑76 TTGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCA < 2:7266327/76‑1 TGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 1:4026356/1‑76 TGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 1:3685510/1‑76 TGAGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAG > 1:3488939/1‑76 AGATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATGGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCT > 1:1685427/1‑76 GATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC > 2:6732711/1‑76 GATGGTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC < 2:1689967/76‑1 TGGTGGCTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 2:1092843/76‑1 TGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG > 2:2925257/1‑76 TGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG > 2:2627873/1‑76 TGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG < 2:5435204/76‑1 TGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCG < 2:204248/76‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 2:6256448/1‑76 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 2:4295951/1‑76 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < 2:4623545/76‑1 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 2:2791608/1‑76 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA > 1:6812281/1‑76 GGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < 2:1861539/76‑1 ATGACCGAGTCAGATGATGTGATGCAGGCGTTAATCCGCGACATCCAGCTCGCGCGCCATAATATTGAGATGGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/1305870‑1305796‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < REL606/1323488‑1323414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |