| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 1609962 | 213 (0.890) | 3 (0.010) | 3/128 | 18.1 | 1.8% | coding (12/174 nt) | gnsB | predicted protein |
| ? | REL606 | = 1610346 | 143 (0.700) | intergenic (‑45/+103) | ynfN/ECB_01516 | predicted protein/putative cold‑shock protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
GTGTTGTTTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGCA > REL606/1610271‑1610421 | gtgtTGTTTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTc < 2:4648833/76‑1 (MQ=255)gtgtTGTTTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTc < 1:3513303/76‑1 (MQ=255) tgttgtTTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCa < 2:1910177/76‑1 (MQ=255) gttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCag < 1:4429652/76‑1 (MQ=255) gttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCag < 1:5563922/76‑1 (MQ=255) gttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCag < 2:3421080/76‑1 (MQ=255) gttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCag < 1:6607203/76‑1 (MQ=255) gttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCag < 1:7448460/76‑1 (MQ=255) ttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCaga > 2:1621139/1‑76 (MQ=255) ttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCaga > 2:7514506/1‑76 (MQ=255) ttgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCaga > 2:1249167/1‑76 (MQ=255) tgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCagag > 1:2493399/1‑76 (MQ=255) tgttTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCagag < 2:4184274/76‑1 (MQ=255) tttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGtt > 2:6875484/1‑76 (MQ=255) tttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGtt > 1:6141230/1‑76 (MQ=255) tttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGtt > 2:3763668/1‑76 (MQ=255) tttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGtt < 1:1490845/76‑1 (MQ=255) ttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGTACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTa < 2:736839/76‑1 (MQ=255) ttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTa < 2:1065093/76‑1 (MQ=255) ttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTa < 1:7894327/76‑1 (MQ=255) ttCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGATGTTAACTCCGGTCACCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTa < 1:3918397/76‑1 (MQ=255) tCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaa < 1:1100037/76‑1 (MQ=255) tCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaa < 2:5547479/76‑1 (MQ=255) tCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaa < 1:1001138/76‑1 (MQ=255) gCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaa < 1:4084371/76‑1 (MQ=255) gCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaa < 2:3944135/76‑1 (MQ=255) ccATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaaa < 1:3328927/76‑1 (MQ=255) ccATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaaa < 2:6084815/76‑1 (MQ=255) cATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaaaa < 2:1560755/76‑1 (MQ=255) cATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTaaaaaa < 2:587835/76‑1 (MQ=255) ttGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAAc > 1:907222/1‑76 (MQ=255) tGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACt > 2:733465/1‑76 (MQ=255) gATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtat < 1:767192/76‑1 (MQ=255) gATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtat > 1:3655757/1‑76 (MQ=255) gATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtat > 2:3219528/1‑76 (MQ=255) tatTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtatta < 1:736597/76‑1 (MQ=255) tatTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtatta < 1:3448154/76‑1 (MQ=255) tatTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGCTCAGAGTTAAAAAAAACtatta < 2:4683028/76‑1 (MQ=255) atTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACtattat > 1:7743141/1‑76 (MQ=255) tCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTAttt > 1:4675054/1‑76 (MQ=255) cACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTAtttt < 2:1822771/76‑1 (MQ=255) gCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTAttttttt > 1:2992673/1‑76 (MQ=255) cATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTc < 2:5563108/76‑1 (MQ=255) cATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTc < 1:5184496/76‑1 (MQ=255) atgatgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCa > 1:1802798/1‑76 (MQ=255) atgatgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCa < 2:1324727/76‑1 (MQ=255) tgatgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCAt < 1:7210456/76‑1 (MQ=255) tgatgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCAt > 1:121290/1‑76 (MQ=255) gatgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTT‑AAAAAAACTATTATTTTTTTCATaa < 1:4270206/76‑1 (MQ=255) atgGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATaa < 2:789322/76‑1 (MQ=255) ggTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATg < 1:1996644/76‑1 (MQ=255) ggTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATg < 1:275696/76‑1 (MQ=255) tgtTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGtt < 1:611790/76‑1 (MQ=255) gtTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTa < 2:3154981/76‑1 (MQ=255) gtTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTa < 2:3550768/76‑1 (MQ=255) gtTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTa < 1:3131012/76‑1 (MQ=255) ttAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTAc < 2:3653471/76‑1 (MQ=255) ttAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTAc > 1:7564207/1‑76 (MQ=255) tcaCTCCGGTCATCCCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATCATGTTAcg > 2:506674/3‑75 (MQ=255) aCTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGt > 1:4933001/1‑76 (MQ=255) aCTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGt > 2:651458/1‑76 (MQ=255) aCTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGt < 1:7800779/76‑1 (MQ=255) cTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTa < 2:33543/76‑1 (MQ=255) tCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTaa < 1:2436270/76‑1 (MQ=255) cGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAata > 2:4091592/1‑76 (MQ=255) cGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGCTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAata > 2:5902103/1‑76 (MQ=255) ggTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAatat < 1:3219528/76‑1 (MQ=255) ggTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAatat > 2:5125868/1‑76 (MQ=255) gTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATAtg > 2:2926752/1‑76 (MQ=255) tcatcaCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATAtgt < 2:2264575/76‑1 (MQ=255) tcatcaCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATAtgt > 1:2334069/1‑76 (MQ=255) tcatcaCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATAtgt > 1:7986112/1‑76 (MQ=255) tcaCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAg < 1:7936162/76‑1 (MQ=255) tcaCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAg < 1:6787582/76‑1 (MQ=255) caCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGt < 2:6617326/76‑1 (MQ=255) caCTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGt < 1:7858020/76‑1 (MQ=255) ggCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATcc > 1:6867810/1‑76 (MQ=255) gCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCa < 1:7197926/76‑1 (MQ=255) cACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCAt < 2:1003675/76‑1 (MQ=255) aCTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATc < 2:279507/76‑1 (MQ=255) aCTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATc > 1:3792509/1‑76 (MQ=255) aCTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATc < 1:4515551/76‑1 (MQ=255) aCTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATc < 1:5691326/76‑1 (MQ=255) tACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGa < 2:6223014/76‑1 (MQ=255) ccATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACt > 2:7282513/1‑76 (MQ=255) ccATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACt < 1:7183408/76‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTa < 1:652031/76‑1 (MQ=255) cATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTa > 1:3042460/1‑76 (MQ=255) agtGCTGGTTCAGAGTAAAAAAAAACTATTATTTTTTTCAAAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAg < 2:3525904/74‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAg < 2:2198003/76‑1 (MQ=255) aTTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAg > 1:1780085/1‑76 (MQ=255) ttGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGa > 2:4374425/1‑76 (MQ=255) cTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGacac < 2:428164/76‑1 (MQ=255) gatCAGAGTTAAACAAAAATATTATTTTTTTCCTAATGTTACCGTAATATGTGCGTATCCATCACCTATACACTac > 2:4026482/3‑75 (MQ=255) gTTCAGAGTAAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTaa < 2:6021103/76‑1 (MQ=255) ttCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAg > 1:4233730/1‑76 (MQ=255) tCAGATTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGc < 2:4997716/76‑1 (MQ=255) tCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGc < 2:2493399/76‑1 (MQ=255) tCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGc > 1:6015078/1‑76 (MQ=255) cAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGCa > 2:5764637/1‑76 (MQ=255) | GTGTTGTTTCGCCATTTGGATATTCACGCATGATGGTGTTAACTCCGGTCATCACTGGCACTACCATTGCTGGTTCAGAGTTAAAAAAAACTATTATTTTTTTCATAATGTTACCGTAATATGTGAGTATCCATCGACTAGACACTAAGCA > REL606/1610271‑1610421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |