| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 11 (0.290) | 47 (1.270) | 38/146 | 0.1 | 86.5% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.110) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 | aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:398350/76‑1 (MQ=255)aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:286591/1‑76 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa > 2:759340‑M2/1‑75 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa > 2:1100749‑M1/67‑76 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 2:269401‑M1/10‑1 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatcngttatcggcaacagcgcaatngntgcggtaacgtatgaacgtatgaa > 2:1172756‑M1/67‑76 (MQ=255) aGCTGGTCNGACGTTTACTTTCACTACTGATAAAGATGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaa > 2:201661‑M2/1‑74 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATTGTTGCGGTAACGTATGaac > 1:1031742‑M2/1‑73 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac > 1:472060‑M2/1‑73 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg > 2:255700‑M2/1‑72 (MQ=255) cctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGt < 1:878563‑M1/13‑1 (MQ=255) cctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGt > 1:351260‑M1/64‑76 (MQ=255) tttactttnaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACTTATGGAGGttt < 1:1162730‑M1/15‑1 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtancgtatgAATGNATGCAGGttt > 2:1194007‑M1/62‑76 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt < 1:480810‑M1/15‑1 (MQ=255) tttactttcaccacngataaatctgttatcggcaacagcgaagtggttgcggtaacgtatgAATGTATGAAGGttt > 1:1044198‑M1/62‑76 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 2:900012‑M2/1‑69 (MQ=255) 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aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACGGACctgtctgt > 1:69119‑M1/44‑76 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt > 2:1057936‑M1/43‑76 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:849240‑M2/1‑49 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg < 2:1090167‑M1/36‑1 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc > 1:435818‑M2/1‑46 (MQ=255) gATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc > 2:467640‑M2/1‑46 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtgtgAACGNATGAAGGTTTCACTACTGNCCNGTCTGTTGGCaa < 1:987307‑M1/39‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 2:1083132‑M1/39‑1 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 1:964902‑M1/38‑76 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactacggacctgtctgt > 1:69119‑M2/1‑43 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 1:238295‑M1/42‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt > 2:1057936‑M2/1‑42 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg < 2:1090167‑M2/76‑37 (MQ=255) cggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCg > 1:336543‑M1/33‑76 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt < 1:972229‑M1/45‑1 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTGTGaacgnatgaaggtttcactactgnccngtctgttggcaa < 1:987307‑M2/76‑40 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 1:964902‑M2/1‑37 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 2:1083132‑M2/76‑40 (MQ=255) 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ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg < 1:631861‑M1/59‑1 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 2:607519‑M1/18‑76 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTCACCTATTaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctctcggaaacaccgtactggt < 1:60296‑M2/76‑52 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg < 1:1077236‑M1/60‑1 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg < 1:584387‑M1/60‑1 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc < 2:1004849‑M1/62‑1 (MQ=255) gAAATGGTTACGATATCGGATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcgacaccgtactggttga > 1:13765‑M2/1‑22 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 2:1077236‑M1/14‑76 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacttatntaggtttcactactgacctctntgctggcaacaccgtactggttgac < 1:172254‑M2/76‑56 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 1:555026‑M2/76‑56 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac > 1:538088‑M2/1‑21 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg < 1:355714‑M2/76‑57 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt < 1:269915‑M1/66‑1 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc < 1:509236‑M1/67‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 2:607519‑M2/1‑17 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg < 1:631861‑M2/76‑60 (MQ=255) gTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatgg < 1:584387‑M2/76‑61 (MQ=255) gTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatgg < 1:1077236‑M2/76‑61 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 2:436483‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg > 1:701323‑M1/9‑76 (MQ=255) tGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtc < 2:1004849‑M2/76‑63 (MQ=255) gCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtct > 2:1077236‑M2/1‑13 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg > 2:889164‑M1/4‑76 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat < 1:269915‑M2/76‑67 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:509236‑M2/76‑68 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa < 2:515795‑M1/75‑1 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa < 2:340975‑M1/75‑1 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 2:436483‑M2/76‑69 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg > 1:701323‑M2/1‑8 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 2:692710/76‑1 (MQ=255) tATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACGGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtca < 1:1010857/76‑3 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg > 2:889164‑M2/1‑3 (MQ=255) aTGTAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAc < 1:580902/76‑1 (MQ=255) aTGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAc < 2:502648/76‑1 (MQ=255) gaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatgga < 2:515795‑M2/76‑76 (MQ=255) gaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatgga < 2:340975‑M2/76‑76 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |