| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | REL606 | 101,810 | G→A | V202M (GTG→ATG) | ftsW → | integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 101,810 | 0 | G | A | 97.4% | 131.7 / ‑4.3 | 38 | V202M (GTG→ATG) | ftsW | integral membrane protein involved in stabilizing FstZ ring during cell division |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (15/22); total (16/22) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 | |||||||||||
CCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCATTGCCATTA > REL606/101740‑101882 | ccTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGgtgatggtg > 2:614559/1‑76 (MQ=255) gAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGtgttg < 2:1159681/76‑1 (MQ=255) aCCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGttgttt < 2:1020033/76‑1 (MQ=255) ccGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGttgtttg < 1:169884/76‑1 (MQ=255) gATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTtgtg > 1:632052/1‑76 (MQ=255) gATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTtgtg > 1:338040/1‑76 (MQ=255) tGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGAc > 1:855428/1‑76 (MQ=255) gggCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACt < 2:87558/76‑1 (MQ=255) ggCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTa < 1:278849/76‑1 (MQ=255) gATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTg < 2:630741/76‑1 (MQ=255) aTTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTgg > 1:686431/1‑76 (MQ=255) aTTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGGGACTACGCTgg < 1:33192/76‑1 (MQ=255) cTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGa > 2:938585/1‑76 (MQ=255) tgtTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGAtgtt < 2:70296/76‑1 (MQ=255) cAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTcca < 2:646195/76‑2 (MQ=255) cAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCt < 2:304042/76‑1 (MQ=255) aGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTg < 1:538645/76‑1 (MQ=255) gtgtTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGCCGATGTTGTTCCTgg > 1:1004554/1‑76 (MQ=255) gtTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCg > 1:514599/1‑76 (MQ=255) gtTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCg > 1:926425/1‑76 (MQ=255) ttACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCgg < 1:783902/76‑1 (MQ=255) aCTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCgggg > 2:210958/1‑75 (MQ=255) ctgctgGCACAGGCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAg < 2:1007657/76‑1 (MQ=255) gctgGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCg > 1:534895/1‑76 (MQ=255) tgGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGaa < 1:786765/76‑1 (MQ=255) tgGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGaa > 2:909079/1‑76 (MQ=255) tgGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGaa > 1:116486/1‑76 (MQ=255) ggCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGCGCGaaa > 2:29353/1‑76 (MQ=255) cacaGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGANCGAAAtt < 2:972011/76‑1 (MQ=255) acaGCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTTGCCTGGCTATGTTGTTCCTGGCCGGANGGAAATtg > 2:205344/1‑76 (MQ=255) aGCCAGACCTTGGTACGTTGATGGTCTTGTTTGTGACTANGCTGGCGATGTTGTTNCTGGCGAGAGCGAAATtgtg > 2:1205041/1‑76 (MQ=255) gCCAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTgg < 2:468578/76‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGc < 1:956970/76‑1 (MQ=255) ccAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTCGCGGGAGCGAAATTGTGGc < 1:1023596/76‑1 (MQ=255) cAGACCTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCa > 2:936339/1‑76 (MQ=255) ccTTGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTc < 2:855428/76‑1 (MQ=255) ttGGTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCAt < 1:633722/76‑1 (MQ=255) ggTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCATTg < 2:870254/76‑1 (MQ=255) gTACGGTGATGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCATTGc < 1:823144/76‑1 (MQ=255) gtgatggtgTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCATTGCCCTTa > 1:454409/1‑76 (MQ=255) | CCTGAAACCGATGGGCGTGATTCTGGTGTTGGCAGTGTTACTGCTGGCACAGCCAGACCTTGGTACGGTGGTGGTGTTGTTTGTGACTACGCTGGCGATGTTGTTCCTGGCGGGAGCGAAATTGTGGCAGTTCATTGCCATTA > REL606/101740‑101882 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |