| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 20123 | 317 (1.290) | 4 (0.020) | 3/138 | 18.4 | 1.5% | coding (495/960 nt) | ECB_00020 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 20373 | 242 (1.070) | coding (245/960 nt) | ECB_00020 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/20043‑20123‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaagTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCAT < REL606/20373‑20299 CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAAT < 2:213973/76‑1CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAAT < 2:3953403/76‑1CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAAT > 2:6950152/1‑76CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAAT > 2:5601638/1‑76 GTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATATTT > 1:8165425/1‑76 GTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATT < 2:4583063/76‑1 GTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATT < 1:3759522/76‑1 GTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATT < 1:3808815/76‑1 TCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTA < 2:5410356/76‑1 CCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAA < 2:5064101/76‑1 CCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAA > 2:6422461/1‑76 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACATGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 2:2831557/76‑1 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 2:2322891/76‑1 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 2:3476889/76‑1 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 1:3663386/76‑1 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA > 1:3454652/1‑76 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 1:7756151/76‑1 CAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAA < 1:7189757/76‑1 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 2:61334/1‑76 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG < 2:8009037/76‑1 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG < 2:797727/76‑1 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 2:3600169/1‑76 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 2:4175768/1‑76 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 1:3130467/1‑76 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 2:6677101/1‑76 AGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG > 1:4613680/1‑76 TCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCC > 2:3323439/1‑76 CCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGAC > 2:790264/1‑76 CCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGAC > 2:2739307/1‑76 AGTATTTAAATTATAATTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAA > 2:3826919/1‑76 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA < 1:1459887/76‑1 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA > 2:3130467/1‑76 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA > 1:5474708/1‑76 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA < 1:5733703/76‑1 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA < 1:7099720/76‑1 TTAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAA < 2:2265620/76‑1 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG > 1:5594637/1‑76 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG > 2:6774893/1‑76 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG > 2:6984522/1‑76 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG < 2:7186247/76‑1 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG < 1:5262527/76‑1 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG < 1:2907498/76‑1 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG > 1:6172415/1‑76 TAAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAG < 2:3751444/76‑1 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT > 2:907478/1‑76 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT > 1:2704916/1‑76 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT > 1:7807271/1‑76 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT < 2:4270936/76‑1 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT > 1:7016770/1‑76 AAAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGT > 1:3971717/1‑76 AAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTC > 1:3913427/1‑76 AAGTCGGAAGTCGTCATTATATTATGAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTC < 2:3815263/76‑1 AGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCA < 2:2475758/76‑1 AGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCA > 2:4790489/1‑76 AGTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCA < 2:3468004/76‑1 GTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCgac > 1:5155901/1‑65 GTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCgac < 2:5155901/68‑4 GTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCAT < 1:4103015/76‑1 GTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCAT > 2:59236/1‑76 GTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCAT < 1:1251162/76‑1 CGTCCAGTGTCGATGGATTGATCTTCAAAACCACAGGTCATTAAATTTACCTGTAAAATAGTATTTAAATTATAATTAAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > REL606/20043‑20123‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttaaagTCGGAAGTCGTCATTATATTATTAATTTCCCCTTTGAATATGACGGTAAAAAAATAGAGCTTCCAGGGAAGTCAT < REL606/20373‑20299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |