| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2916695 = | 277 (1.130) | 4 (0.020) | 3/136 | 18.3 | 1.5% | intergenic (‑10/‑426) | ygfT/ygfU | fused predicted oxidoreductase: Fe‑S subunit/nucleotide‑binding subunit/predicted transporter |
| ? | REL606 | 2916914 = | 287 (1.290) | intergenic (‑229/‑207) | ygfT/ygfU | fused predicted oxidoreductase: Fe‑S subunit/nucleotide‑binding subunit/predicted transporter | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2916776‑2916695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatgaaaTATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATG > REL606/2916914‑2916988 ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 1:1334185/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 1:1678768/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 2:7044654/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA > 2:6575443/1‑76ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 1:1889497/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA > 1:2383476/1‑76ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA > 2:1705799/1‑76ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 2:5593843/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 2:4330743/76‑1ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAA < 2:1891528/76‑1 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGGGAAATTTGAGAAGACATAACTCATCAAA > 2:1696884/1‑76 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA < 1:6799440/76‑1 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA < 1:6100624/76‑1 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA < 1:10147/76‑1 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA > 2:27863/1‑76 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA < 2:3336245/76‑1 TAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAA < 2:3782073/76‑1 AATTAAAACGGTTATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAAT > 2:2854005/1‑76 AATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAAT < 1:3784966/76‑1 AATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAAT < 2:3203612/76‑1 AATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAAT > 2:5666822/1‑76 AATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAAT > 1:5513755/1‑76 ATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATG < 2:4076809/76‑1 ATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATG < 2:6481181/76‑1 ATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATG < 1:886564/76‑1 ATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATG > 1:1489687/1‑76 ATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATG < 1:7040012/76‑1 TTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGA > 2:5208886/1‑76 TTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGA < 2:1811008/76‑1 TTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGA < 1:4132434/76‑1 TTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGA > 1:258451/1‑76 TTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGA < 1:1750043/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:3279925/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 2:2927343/1‑76 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:4684382/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:3313932/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 2:1964613/1‑76 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 1:5173901/1‑76 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 2:1760383/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:1801187/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 2:7754199/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:2967933/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 1:6090608/1‑76 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA < 1:7616494/76‑1 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 2:5170452/1‑76 TAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAA > 1:2474209/1‑76 AAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAA > 2:4558788/1‑76 AAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAA > 1:615278/1‑76 AAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAA > 1:3900652/1‑76 GCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAATATCAATATGA < 2:3458595/76‑1 TAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAATATCAATATGAGAAAAT < 2:4849825/76‑1 TAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAATATCAATATGAGAAAAT < 2:2224079/76‑1 ATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAATATCAATATGAGAAAATTA < 2:7240131/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:2456085/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:67021/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:6085230/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:2903689/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:687560/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG > 1:5308617/1‑76 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:7427025/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG > 1:7559147/1‑76 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:815441/76‑1 AATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACG < 2:85633/76‑1 ATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGA < 2:1492678/76‑1 ATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGA < 1:27113/76‑1 ATGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCGTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGc > 2:1920563/1‑75 TGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGAT > 2:1118793/1‑76 TGAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGAT < 2:849527/76‑1 GAAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATT < 1:4072103/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:897557/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:7885476/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:6497178/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:617669/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA > 2:4223012/1‑76 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:2809848/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA > 1:5386170/1‑76 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 2:1678768/76‑1 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA > 1:729343/1‑76 AAATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTA < 1:6975119/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTTCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT < 2:6667558/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT < 1:2597463/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT < 2:6633899/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT < 2:2324246/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT > 1:5256075/1‑76 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT < 1:7044654/76‑1 AATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTAT > 1:6812478/1‑76 ATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATG < 2:3968007/76‑1 ATATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATG < 1:7762212/76‑1 ATAATTAAAACGGTCATGCTACCTAATATATGCCCGTTTATTGCATCGCGAAATTTGAGAAGACATAACTCATTAAATGAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2916776‑2916695‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatgaaaTATCAATATGAGAAAATTACAGATAATTCCATTGTCAGGTTCTCTTCTCATTTTCGTGGTTTAACCACGATTATG > REL606/2916914‑2916988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |