| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 796221 = | 211 (0.860) | 3 (0.010) | 3/128 | 17.8 | 1.4% | coding (109/993 nt) | ECB_00737 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 796406 = | 235 (1.130) | intergenic (‑77/‑349) | ECB_00737/ECB_00738 | hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
AGGAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAAGC > REL606/796146‑796296 | aGGAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCt > 1:4758308/1‑76 (MQ=255)aGGAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCt > 2:7301509/1‑76 (MQ=255)aGGAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCt < 2:2671114/76‑1 (MQ=255) gAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTaa > 1:939369/1‑76 (MQ=255) aCCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATg < 2:4326834/76‑1 (MQ=255) tAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGttt > 1:1417311/1‑76 (MQ=255) tAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGttt < 1:7270145/76‑1 (MQ=255) aGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGtttt < 1:119059/76‑1 (MQ=255) aGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGtttt > 1:7606487/1‑76 (MQ=255) aGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGtttt < 1:2708414/76‑1 (MQ=255) aGTAATTATAAGTAAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGtttt < 1:6828990/76‑1 (MQ=255) gTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTtta < 2:2775830/76‑1 (MQ=255) gTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTtta < 1:3235463/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTttatt > 2:6280844/1‑76 (MQ=255) aaTTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTttatt < 1:5850253/76‑1 (MQ=255) aaTTATAAGTCAAAAAAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTttatt > 1:3900825/1‑76 (MQ=255) ttATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaa > 1:2628524/1‑76 (MQ=255) ttATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaa < 1:2215672/76‑1 (MQ=255) ttATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaa > 2:501409/1‑76 (MQ=255) ttATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaa > 1:4001051/1‑76 (MQ=255) tataAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaat > 1:1730985/1‑76 (MQ=255) ataAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaata > 2:3799324/1‑76 (MQ=255) taAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATtaataa > 2:6039272/1‑76 (MQ=255) aaGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAg > 2:1341309/1‑76 (MQ=255) aaGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAg > 1:8024318/1‑76 (MQ=255) caaaacaaaaCCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGctct > 2:8043779/1‑76 (MQ=255) caaaacaaaaCCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGctct > 1:3067909/1‑76 (MQ=255) aaaacaaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCtctc > 1:4058469/1‑76 (MQ=255) aacaaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCa > 2:7650409/1‑76 (MQ=255) aacaaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCa < 2:5534435/76‑1 (MQ=255) aacaaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCa < 1:4193272/76‑1 (MQ=255) acaaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaa < 2:4399845/76‑1 (MQ=255) caaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATGCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaaa < 1:5054370/76‑1 (MQ=255) caaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaaa > 2:6114979/1‑76 (MQ=255) caaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaaa > 1:3402744/1‑76 (MQ=255) caaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaaa < 2:119619/76‑1 (MQ=255) aaaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCaaaa > 1:6466422/1‑76 (MQ=255) aaacCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAAt < 2:1713427/76‑1 (MQ=255) aGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACg < 2:7821815/76‑1 (MQ=255) aGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACg < 2:5334541/76‑1 (MQ=255) aaaGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACggg > 1:1659159/1‑76 (MQ=255) aaGCATGAAGAAGATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACgggg < 2:3229992/76‑1 (MQ=255) aGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGa < 1:2078487/76‑1 (MQ=255) gCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGAc < 1:5339081/76‑1 (MQ=255) tGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGActct < 2:4784128/76‑1 (MQ=255) tGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGActct > 2:7675430/1‑76 (MQ=255) gaagaaAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACtctc > 2:2930195/1‑76 (MQ=255) gaagaaAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACtctc < 2:5232765/76‑1 (MQ=255) gaaAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATg < 2:2104232/76‑1 (MQ=255) gaaAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATg > 1:7218713/1‑76 (MQ=255) aaaaTACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGt > 2:1276377/1‑76 (MQ=255) aaaaTACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGt > 2:3423172/1‑76 (MQ=255) aaaTACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGtt > 2:6720018/1‑76 (MQ=255) atccTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCACTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTaa < 1:7404978/73‑1 (MQ=255) tACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAt > 2:7898614/1‑76 (MQ=255) tACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAt < 1:6223790/76‑1 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtg < 2:7054719/76‑1 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtg < 2:4242183/76‑1 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtg < 2:5560254/76‑1 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtg > 2:5444949/1‑76 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtg > 1:7538709/1‑76 (MQ=255) aCTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAACAAGCTCTCCAAAATTAACAGGGACTCTCATGTTAAtg < 2:7729463/76‑1 (MQ=255) tCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCAt < 2:7779376/67‑1 (MQ=255) tCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCAt > 1:7779376/1‑67 (MQ=255) tCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtgtg < 1:6913483/76‑1 (MQ=255) tCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtgtg < 2:4050082/76‑1 (MQ=255) tCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAAtgtg < 1:7231251/76‑1 (MQ=255) cATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGa > 1:3430276/1‑76 (MQ=255) aTGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaa < 2:698017/76‑1 (MQ=255) aTGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaa > 1:578209/1‑76 (MQ=255) tGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaaa < 1:3802816/76‑1 (MQ=255) gCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaaaa > 1:4883857/1‑76 (MQ=255) gCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaaaa > 1:5534574/1‑76 (MQ=255) gCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaaaa > 1:4392630/1‑76 (MQ=255) gCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGaaaa > 2:2858079/1‑76 (MQ=255) cAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAAt < 2:5957324/76‑1 (MQ=255) aaTGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATa > 2:7544092/1‑76 (MQ=255) aaTGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATa > 1:1058563/1‑76 (MQ=255) aaTGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATa < 1:7476990/76‑1 (MQ=255) aTGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATaa < 1:4514748/76‑1 (MQ=255) aCGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAaca < 2:2058579/76‑1 (MQ=255) cGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAacac < 1:2533959/76‑1 (MQ=255) gCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAAcaca < 2:4488855/76‑1 (MQ=255) gCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAAcaca < 2:2341437/76‑1 (MQ=255) ccATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACAt > 2:5806212/1‑76 (MQ=255) cATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATa < 1:2909822/76‑1 (MQ=255) cATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATa > 2:1476184/1‑76 (MQ=255) cATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATa < 2:6962698/76‑1 (MQ=255) aTTGCTAATGGGTTTATTAAGAAGCTCTCCAAAAGTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATaa < 2:6875547/76‑1 (MQ=255) tGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATaaaa > 1:1626151/1‑76 (MQ=255) tGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATaaaa < 2:1143911/76‑1 (MQ=255) gCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATaaaaa > 1:6293283/1‑76 (MQ=255) gCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATaaaaa < 1:7898614/76‑1 (MQ=255) cTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAag < 1:7976512/76‑1 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc > 2:3609014/1‑76 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc > 2:3655076/1‑76 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc > 1:2132390/1‑76 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc > 2:1410984/1‑76 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc < 2:7964076/76‑1 (MQ=255) tAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAagc < 1:2121384/76‑1 (MQ=255) | AGGAACCATAGTAATTATAAGTCAAAACAAAACCAGAAAGCATGAAGAAAATACTCATGCCAATGACGCCATTGCTAATGGTTTTATTAATAAGCTCTCCAAAATTAACGGGGACTCTCATGTTAATGTGAAAAATAAACACATAAAAAGC > REL606/796146‑796296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |