New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 402458 = | 208 (0.940) | 3 (0.020) | 3/118 | 17.2 | 1.8% | coding (582/1104 nt) | ribD | fused diaminohydroxyphosphoribosylaminopyrimidine deaminase and 5‑amino‑6‑(5‑phosphoribosylamino) uracil reductase |
? | REL606 | = 3276096 | 161 (0.930) | coding (587/978 nt) | yrbG | predicted calcium/sodium:proton antiporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
GTGGATCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGCTCTAT > REL606/402383‑402533 | gTGGATCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCagcagc < 1:5580159/76‑1 (MQ=255) gTGGATCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCagcagc < 1:5636524/76‑1 (MQ=255) gATCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGcc > 2:1117831/1‑76 (MQ=255) tCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCAc < 1:423667/76‑1 (MQ=255) aCTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTACCCAGCAGCGCCACgg > 2:420543/1‑76 (MQ=255) cTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGt < 1:1408782/76‑1 (MQ=255) cTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGt > 1:693232/1‑76 (MQ=255) cTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGt > 2:6388658/1‑76 (MQ=255) ttCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTg > 2:769595/1‑76 (MQ=255) ttCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTg < 2:2357281/76‑1 (MQ=255) ttCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTg < 1:3959971/76‑1 (MQ=255) tgcGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGATg < 2:5320684/74‑1 (MQ=255) tCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGc > 2:5967076/1‑76 (MQ=255) tCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGc > 2:107832/1‑76 (MQ=255) cGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCt > 1:3853913/1‑76 (MQ=255) gCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTg > 2:6062824/1‑76 (MQ=255) gCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTg > 1:6091414/1‑76 (MQ=255) gCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTg < 2:4082237/76‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTg > 2:6727953/1‑76 (MQ=255) ccccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTgg < 2:5146161/76‑1 (MQ=255) ccccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTgg < 2:3245476/76‑1 (MQ=255) ccccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTgg > 1:6809096/1‑76 (MQ=255) cgcAGGCGCGGCGTGAGGTACAACTACTGGGCGCGCAAGGGCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGc < 2:3235746/74‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGc < 1:6133550/76‑1 (MQ=255) cccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGc < 2:2610249/76‑1 (MQ=255) cccAGGAGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGc > 2:3335826/1‑76 (MQ=255) cccAAGCGCGGCGTGATTAACAAATTCTGCGCGCGCAGAGACATGCCATATCACCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGc > 2:7045733/1‑76 (MQ=255) ccAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCg > 2:4882997/1‑76 (MQ=255) cAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCgg < 1:7041535/76‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGga < 2:5695954/76‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGga < 2:354640/76‑1 (MQ=255) aGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGga < 2:6681074/76‑1 (MQ=255) ggCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGgat > 2:1478130/1‑76 (MQ=255) ggCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGgat < 2:6536093/76‑1 (MQ=255) gcgcGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGgatg < 2:3113408/76‑1 (MQ=255) cgcgGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGgatga < 2:4653036/76‑1 (MQ=255) cgcgGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGgatga < 1:1740915/76‑1 (MQ=255) gcgTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCt > 1:2499220/1‑76 (MQ=255) gcgTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCt < 2:7090232/76‑1 (MQ=255) cgTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTg < 2:1278971/76‑1 (MQ=255) cgTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTg < 2:341963/76‑1 (MQ=255) tGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGcc > 1:5157515/1‑76 (MQ=255) tGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGcc < 2:1906049/76‑1 (MQ=255) tGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGcc > 1:1626999/1‑76 (MQ=255) tGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGcc > 1:5475456/1‑76 (MQ=255) gATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGGCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCt > 2:5557680/1‑76 (MQ=255) gATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCt < 1:3633699/76‑1 (MQ=255) aTGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCtt > 2:2829019/1‑76 (MQ=255) aTGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCtt < 1:6522942/76‑1 (MQ=255) tGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTa > 1:5026815/1‑76 (MQ=255) tGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTa > 1:3640845/1‑76 (MQ=255) tGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTa < 2:2928573/76‑1 (MQ=255) tGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTa < 1:100185/76‑1 (MQ=255) tACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAAc > 2:3640956/1‑76 (MQ=255) aaCTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGt < 1:3797213/76‑1 (MQ=255) actactGCGCGCGCAAAGTCATCCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGCCGGATGATCCTGCCTTAACGGTg < 2:2530949/76‑1 (MQ=255) tactGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCg < 2:2298188/76‑1 (MQ=255) actGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGt > 1:4132759/1‑76 (MQ=255) actGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGt > 1:337576/1‑76 (MQ=255) cgcgcgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTg < 2:72842/75‑1 (MQ=255) gcgcgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTgg > 2:116036/1‑76 (MQ=255) gcgcgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTgg > 2:6105717/1‑76 (MQ=255) gcgcgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTgg > 2:2254389/1‑76 (MQ=255) cgcgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGt < 2:898560/76‑1 (MQ=255) cgcgcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCt > 2:4278931/1‑76 (MQ=255) gcAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGaa < 1:7115582/76‑1 (MQ=255) cAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAAc > 1:1231814/1‑76 (MQ=255) cAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAAc < 2:447117/76‑1 (MQ=255) aaaGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACt > 2:5784995/1‑76 (MQ=255) aaaGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACt > 1:5483969/1‑76 (MQ=255) aGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTgg < 1:1221612/76‑1 (MQ=255) aGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTgg < 1:5720261/76‑1 (MQ=255) cATGTCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATg < 2:1770565/76‑1 (MQ=255) aTGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGa > 1:2284081/1‑76 (MQ=255) aTGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGa < 1:202107/76‑1 (MQ=255) gCCATTTTAGCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAAc < 1:6348407/76‑1 (MQ=255) gCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAAc > 1:528686/1‑76 (MQ=255) ccATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACa < 1:6371538/76‑1 (MQ=255) cATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACaa < 1:4249768/76‑1 (MQ=255) cATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACaa < 1:5901108/76‑1 (MQ=255) cATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACaa < 1:523637/76‑1 (MQ=255) aTTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACaaa > 1:4927026/1‑76 (MQ=255) ttAACCAGCAGCGCCATGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTc > 2:4593023/1‑76 (MQ=255) ttAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTc > 2:103490/1‑76 (MQ=255) ttAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTc < 1:2700325/76‑1 (MQ=255) tAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCa < 2:1585085/76‑1 (MQ=255) aaCCAGCGGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAg < 1:5705513/76‑1 (MQ=255) aaCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAg > 1:2175385/1‑76 (MQ=255) aCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAgg < 2:3309239/76‑1 (MQ=255) aCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAgg > 2:1551857/1‑76 (MQ=255) aCCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAgg < 1:732986/76‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCGCGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGgc < 1:4695166/76‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGgc < 1:1365819/76‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGgc < 1:3925692/76‑1 (MQ=255) agcagcGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGgcgc > 2:6511633/1‑76 (MQ=255) cagcGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGctc < 2:5919684/76‑1 (MQ=255) agcGCCACGGTGCTGACGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCTTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGctct < 2:2547328/76‑1 (MQ=255) gcgcCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGCTCTa < 2:1060514/76‑1 (MQ=255) cgcCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGCTCTAt < 1:6432043/76‑1 (MQ=255) cgcCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGCTCTAt < 2:4643365/76‑1 (MQ=255) | GTGGATCACTTCGCCCCAGGCGCGGCGTGATGTACAACTACTGCGCGCGCAAAGTCATGCCATTTTAACCAGCAGCGCCACGGTGCTGGCGGATGATCCTGCCTTAACGGTGCGTTGGTCTGAACTGGATGAACAAACTCAGGCGCTCTAT > REL606/402383‑402533 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |