| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 3021002 | 250 (0.790) | 6 (0.020) | 5/136 | 20.3 | 2.8% | coding (482/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | = 3021158 | 192 (0.670) | coding (326/933 nt) | ECB_02820 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
AAGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATAT > REL606/3020927‑3021077 | aaGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAg < 2:108020/76‑1 (MQ=255)aaGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAg < 2:4907419/76‑1 (MQ=255) aGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGc < 2:8831223/76‑1 (MQ=255) gTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCa > 2:3872556/1‑76 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc < 2:9572604/76‑1 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc < 1:5205306/76‑1 (MQ=255) tAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATc > 2:3190370/1‑76 (MQ=255) aCTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTa > 1:6454748/1‑76 (MQ=255) cttcttCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTaa < 1:2988011/76‑1 (MQ=255) cttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGt > 1:1803076/1‑76 (MQ=255) ttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGtt < 1:7461626/76‑1 (MQ=255) ttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGtt < 2:3469835/76‑1 (MQ=255) ttcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGtt < 2:73303/76‑1 (MQ=255) tcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTa > 1:4590305/1‑76 (MQ=255) tcACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTa > 1:1182626/1‑76 (MQ=255) cACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaa > 1:9370530/1‑76 (MQ=255) aCTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaa < 1:1952694/76‑1 (MQ=255) cTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaaa < 2:5055908/76‑1 (MQ=255) cTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTaaaa < 2:3965016/76‑1 (MQ=255) tattatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAAc < 2:2562857/76‑1 (MQ=255) tattatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAAc > 1:9407724/1‑76 (MQ=255) attatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACa < 1:1588250/76‑1 (MQ=255) attatAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACa > 2:1399285/1‑76 (MQ=255) ttatAGACTCTTAATAAGTCTCTATCATTCAACTTCCTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAATGTTAAAAccg > 1:8879058/1‑74 (MQ=255) tataGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAgg > 2:6643970/1‑76 (MQ=255) taGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCa > 2:1607455/1‑76 (MQ=255) gACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCAtt < 1:9183897/76‑1 (MQ=255) gACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCAtt > 1:9849323/1‑76 (MQ=255) aCTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTg > 1:9657502/1‑76 (MQ=255) ctctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGt < 1:8085518/76‑1 (MQ=255) ctctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGt < 1:5295622/76‑1 (MQ=255) tctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTa > 2:7544413/1‑76 (MQ=255) tctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTa < 1:1291917/76‑1 (MQ=255) tctTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTa > 2:2145787/1‑76 (MQ=255) ttAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACt > 2:2883716/1‑76 (MQ=255) ttAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACt > 2:2635324/1‑76 (MQ=255) ttAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACt > 2:8570335/1‑76 (MQ=255) taataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTa > 2:294458/1‑76 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 2:909008/1‑76 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 2:7195213/1‑76 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 1:1541694/1‑76 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 2:7983127/1‑76 (MQ=255) aataaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTaa > 2:5501200/1‑76 (MQ=255) taaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAaca > 1:4760468/1‑76 (MQ=255) taaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAaca < 2:6303145/76‑1 (MQ=255) aaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAacac < 1:7018103/76‑1 (MQ=255) aaGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAacac > 1:8794133/1‑76 (MQ=255) aGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACg < 1:651001/76‑1 (MQ=255) aGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACg < 1:2619034/76‑1 (MQ=255) tctcTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAg < 1:3096481/76‑1 (MQ=255) ctctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGt > 2:9775694/1‑76 (MQ=255) ctACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtat < 2:3530468/76‑1 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 1:7740752/1‑76 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 1:3870759/1‑76 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 2:8313495/1‑76 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 1:2105270/1‑76 (MQ=255) tACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatt > 1:5685516/1‑76 (MQ=255) aCCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtatta > 2:6777052/1‑76 (MQ=255) ccATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtattat < 1:1613280/76‑1 (MQ=255) ccATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGtattat < 2:1213087/76‑1 (MQ=255) cATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATtata > 1:2284706/1‑76 (MQ=255) cATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATtata > 1:10196056/1‑76 (MQ=255) cATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATtata < 2:8176554/76‑1 (MQ=255) ttCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATg < 2:7028008/76‑1 (MQ=255) ttCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATg > 2:3748865/1‑76 (MQ=255) tCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATgg > 1:49832/1‑76 (MQ=255) cAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGt > 1:2067129/1‑76 (MQ=255) cAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGt > 1:7313605/1‑76 (MQ=255) cAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGt < 2:9618928/76‑1 (MQ=255) aaCTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTc < 2:4083326/76‑1 (MQ=255) aaCTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTc > 1:848990/1‑76 (MQ=255) acttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCt < 1:5055707/76‑1 (MQ=255) cttacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTa > 1:2193784/1‑76 (MQ=255) tacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATc < 1:39510/76‑1 (MQ=255) tacttCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATc < 1:8313495/76‑1 (MQ=255) cttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATa < 1:6868144/76‑1 (MQ=255) cttACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATa < 1:4227539/76‑1 (MQ=255) aCTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtt > 1:5534737/1‑76 (MQ=255) cTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACttt > 1:9287787/1‑76 (MQ=255) cTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACttt > 2:603814/1‑76 (MQ=255) tATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACtttt < 2:4556191/76‑1 (MQ=255) aTTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTg > 2:1810302/1‑76 (MQ=255) tAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTa < 2:6093594/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaa < 2:6371412/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaa < 2:5892530/76‑1 (MQ=255) aaaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaa > 2:9030006/1‑76 (MQ=255) aaTATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTaaa > 1:3660794/1‑76 (MQ=255) atatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAt > 2:9246094/1‑76 (MQ=255) tatTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAtt < 2:4511118/76‑1 (MQ=255) atTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAAttt > 2:7748480/1‑76 (MQ=255) tttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtc < 1:3387339/76‑1 (MQ=255) ttAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtca > 1:2424823/1‑76 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat < 1:10007020/76‑1 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat > 1:4385257/1‑76 (MQ=255) tAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcat > 1:5741248/1‑76 (MQ=255) aGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcata > 1:2875100/1‑76 (MQ=255) aGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcata > 2:2229233/1‑76 (MQ=255) aGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcata > 2:1782556/1‑76 (MQ=255) gCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatat < 1:1362398/76‑1 (MQ=255) gCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTtcatat < 2:10035721/76‑1 (MQ=255) | AAGTTAACTTCTTCACTATTATAGACTCTTAATAAGTCTCTACCATTCAACTTACTTCTTACTATTAAATATTTAGCATCTAAGGTTAAAACAGGCATTGTACTAACACGAGTATTATATGGTCTATCGAATACTTTTGTAAATTTCATAT > REL606/3020927‑3021077 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |