| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 8 (0.180) | 45 (1.010) | 36/146 | 0.2 | 88.4% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.090) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 | aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:1084887‑M1/1‑1 (MQ=255) tctcTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTaa > 1:1186907/1‑76 (MQ=255) tctcTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTaa > 2:312829/1‑76 (MQ=255) agctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaa > 2:917219‑M1/75‑76 (MQ=255) gctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaac < 1:633418‑M1/3‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 1:196812‑M1/4‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 1:1012457‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 2:283055‑M1/5‑1 (MQ=255) nggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 1:134079‑M1/5‑1 (MQ=255) tGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTa > 2:831993/1‑76 (MQ=255) tGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTa < 2:806157/76‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTAt > 2:1235482/1‑76 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg > 1:787726‑M1/69‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:948246/76‑1 (MQ=255) aaaGCAGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:1280840/1‑76 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcaaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 1:26879‑M1/9‑1 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 2:1084887‑M2/76‑2 (MQ=255) aGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaa > 2:917219‑M2/1‑74 (MQ=255) gCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 1:633418‑M2/76‑4 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:196812‑M2/76‑5 (MQ=255) cTGGGCAGACCTTTACTATCACCGCAGATAAATCTGTTANCGGCATCAGCGAAATNGTTGCGATAACGTATGaacg > 2:1473458/1‑74 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:1012457‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 2:283055‑M2/76‑6 (MQ=255) nggtCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:134079‑M2/75‑6 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:384383‑M1/16‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:1067330‑M1/61‑76 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:787726‑M2/1‑68 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 1:854153‑M1/60‑76 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCAAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 1:26879‑M2/76‑10 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 2:965534‑M1/19‑1 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 2:1242253‑M1/23‑1 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:1067330‑M2/1‑60 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:384383‑M2/76‑17 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa > 1:200355‑M1/53‑76 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa > 2:699984‑M1/53‑76 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:854153‑M2/1‑59 (MQ=255) ccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatcgtngcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 1:1438201‑M1/25‑1 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 2:965534‑M2/76‑20 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcagcagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTAAGAAGGTTTCACTACTGACct > 2:120206‑M1/50‑76 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACct < 1:810690‑M1/27‑1 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg > 2:520579‑M1/49‑76 (MQ=255) tgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt < 2:187269‑M1/29‑1 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1242253‑M2/76‑24 (MQ=255) ataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct < 1:621180‑M1/31‑1 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga > 1:200355‑M2/1‑52 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga > 2:699984‑M2/1‑52 (MQ=255) ccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATCGTNGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 1:1438201‑M2/76‑26 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt > 2:1012455‑M1/43‑76 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt > 2:270620‑M1/43‑76 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgtaatggttgcggtaaagtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTg > 2:1174721‑M1/42‑76 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAGCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtaagaaggtttcactactgacct > 2:120206‑M2/1‑49 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct < 1:810690‑M2/76‑28 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg < 1:1313536‑M1/36‑1 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg > 2:520579‑M2/1‑48 (MQ=255) tGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgt < 2:187269‑M2/76‑30 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc > 1:698016‑M1/40‑76 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct < 1:621180‑M2/76‑32 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:824192‑M1/41‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt > 2:1012455‑M2/1‑42 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt > 2:270620‑M2/1‑42 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGTAATGGTTGCGGTAAAGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttg > 2:1174721‑M2/1‑41 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg < 1:1313536‑M2/76‑37 (MQ=255) ggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt < 1:295685‑M1/45‑1 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc > 1:698016‑M2/1‑39 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 1:936050‑M1/46‑1 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 2:751899‑M1/31‑76 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 1:1186245‑M1/31‑76 (MQ=255) caacagcgaaatgattgcggnaacgtatgAGCGTATNAAGGTTTCACTACTGTCCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc > 2:1470780‑M1/30‑76 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 2:901459‑M1/48‑1 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 1:824192‑M2/76‑42 (MQ=255) ggCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt < 1:295685‑M2/76‑46 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 2:542184‑M1/24‑76 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa < 1:317538‑M1/54‑1 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa > 2:957372‑M1/23‑76 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGa < 1:938953‑M1/54‑1 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtaagAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTAGTAAGACCGTACTGGTTGa < 1:75376‑M1/54‑1 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 1:936050‑M2/76‑47 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 2:751899‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 1:1186245‑M2/1‑30 (MQ=255) cAACAGCGAAATGATTGCGGNAACGTATGagcgtatnaaggtttcactactgtcctgtctgttggcaacaccgtac > 2:1470780‑M2/1‑29 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:1095566‑M1/55‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:901459‑M2/76‑49 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg > 1:354177‑M1/17‑76 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 2:542184‑M2/1‑23 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga < 1:317538‑M2/76‑55 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga < 1:938953‑M2/76‑55 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttga > 2:957372‑M2/1‑22 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTAAGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttagtaagaccgtactggttga < 1:75376‑M2/76‑55 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 2:1095566‑M2/76‑56 (MQ=255) ggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGa > 2:583861‑M1/12‑76 (MQ=255) gTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatgg > 1:354177‑M2/1‑16 (MQ=255) aacntatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 1:1335544‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 1:314229‑M1/68‑1 (MQ=255) ggTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctga > 2:583861‑M2/1‑11 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg < 1:872623‑M1/73‑1 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg < 2:187220‑M1/73‑1 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGCTGGCAANACCGTACTGGTTGACGATNGTNTGATCGGTATgg < 1:1214977‑M1/74‑1 (MQ=255) aacntatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 1:1335544‑M2/76‑69 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 1:314229‑M2/76‑69 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:847053‑M1/1‑76 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |