Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ REL606 761475–761513 761753–761647 135–279 97 [90] [93] 96 [lysT]–[lysW] [lysT],valT,[lysW]

GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT  >  REL606/761726‑761829
                            |                                                                           
ggTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCcaccac                              <  2:5784293/76‑1 (MQ=31)
 gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACt                             >  2:779859/1‑76 (MQ=32)
 gTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACt                             >  1:4106017/1‑76 (MQ=32)
  tCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTa                            >  1:4942195/1‑76 (MQ=34)
  tCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTa                            >  1:588479/1‑76 (MQ=34)
   cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTat                           >  1:4272255/1‑75 (MQ=21)
   cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTat                           >  1:7492534/1‑75 (MQ=21)
   cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTaa                           >  1:4611791/1‑76 (MQ=35)
   cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTaa                           >  1:4015757/1‑76 (MQ=35)
   cGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTaa                           <  1:3567605/76‑1 (MQ=35)
    gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTTAt                          >  1:2561743/1‑76 (MQ=17)
    gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAt                          >  1:6521140/1‑76 (MQ=38)
    gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAt                          >  1:6435938/1‑76 (MQ=38)
    gTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAt                          <  1:1252450/76‑1 (MQ=38)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  1:3199514/76‑1 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  1:769869/76‑1 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  1:669361/76‑1 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  2:1373566/76‑1 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  1:3784330/76‑1 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         >  2:4611416/1‑76 (MQ=39)
     ttAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAtt                         <  2:5442168/76‑1 (MQ=39)
      tAGCTCAGTTGGTAGAGCATTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTa                        <  2:3749902/76‑1 (MQ=255)
      tAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCACCACTAATTa                        <  2:988056/76‑1 (MQ=255)
       aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTAc                       >  2:2253182/1‑76 (MQ=255)
       aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTAc                       <  2:6498345/76‑1 (MQ=255)
       aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTAc                       <  2:266256/76‑1 (MQ=255)
       aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTAc                       >  2:1242198/1‑76 (MQ=255)
       aGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTAc                       <  1:1511845/76‑1 (MQ=255)
        gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACg                      >  2:1005837/1‑76 (MQ=255)
        gCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACg                      >  1:7174357/1‑76 (MQ=255)
         cTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACgg                     <  2:2906918/76‑1 (MQ=255)
         cTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACgg                     <  2:2169438/76‑1 (MQ=255)
          tCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGt                    <  1:7615987/76‑1 (MQ=255)
          tCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGt                    <  2:6800922/76‑1 (MQ=255)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGCCCCACCACTAATTACGGTg                   <  2:2691834/76‑1 (MQ=255)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCcaccac                              >  1:2617302/1‑65 (MQ=31)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTg                   >  2:7381881/1‑76 (MQ=255)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTg                   <  2:465094/76‑1 (MQ=255)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATAACGTTg                   >  2:1848657/1‑76 (MQ=255)
           cAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGCCCCACCACTAATTACGGTg                   <  2:1604767/76‑1 (MQ=255)
            aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTgg                  <  2:2535467/76‑1 (MQ=255)
            aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTgg                  <  2:4418154/76‑1 (MQ=255)
            aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTgg                  >  2:3368975/1‑76 (MQ=255)
            aGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTgg                  <  2:1545258/76‑1 (MQ=255)
             gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTggg                 >  1:7671442/1‑76 (MQ=255)
             gTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTggg                 <  2:6608578/76‑1 (MQ=255)
              ttGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGt                <  2:5145753/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  1:7826574/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  2:1335795/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  1:7658016/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               >  2:3406259/1‑76 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTCCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  2:6863690/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATGGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  2:4893165/76‑1 (MQ=255)
               tGGTAGAGCAGGTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGCCCCACCACTAATTACGGTGGGtt               <  2:2483588/76‑1 (MQ=17)
                ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTc              <  2:3135781/76‑1 (MQ=255)
                ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTc              <  2:7499420/76‑1 (MQ=255)
                ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTc              <  1:7016221/76‑1 (MQ=255)
                ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTc              <  2:580001/76‑1 (MQ=255)
                ggTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGCCCCACCACTAATTACGGTGGGTTc              <  1:3432545/76‑1 (MQ=255)
                 gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCg             <  1:5817833/76‑1 (MQ=255)
                 gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACAACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCg             <  2:4556734/76‑1 (MQ=255)
                 gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCCAGTCCTACACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCg             <  2:519159/76‑1 (MQ=18)
                 gTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGCCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCg             <  1:658503/76‑1 (MQ=255)
                  tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTccg            >  1:3014779/1‑74 (MQ=255)
                  tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCgg            <  2:3439957/76‑1 (MQ=255)
                  tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCgg            <  2:3509785/76‑1 (MQ=255)
                  tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCgg            >  1:4061055/1‑76 (MQ=255)
                  tAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGGTCgg            >  1:666139/1‑76 (MQ=255)
                   agagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGt           <  2:4232642/76‑1 (MQ=255)
                   agagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCggg           >  2:1056096/1‑75 (MQ=255)
                    gagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTg          <  2:2403392/76‑1 (MQ=255)
                    gagCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCgggg          >  1:3653495/1‑74 (MQ=255)
                     agCATTTGCTTTTTAATCAATTGGTGGGAGTTTCAAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTgg         <  1:4447282/76‑1 (MQ=18)
                     agCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTgg         <  1:6645159/76‑1 (MQ=255)
                      gCAGTTGATTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        <  2:2086111/76‑1 (MQ=255)
                      gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGTTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        <  1:2752653/76‑1 (MQ=255)
                      gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        <  1:2651595/76‑1 (MQ=255)
                      gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        >  1:1909417/1‑76 (MQ=255)
                      gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        <  2:3553642/76‑1 (MQ=255)
                      gCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCAAATCCTGCCCGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGa        <  2:4179099/76‑1 (MQ=255)
                       cAGTTGATTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGaa       <  2:6295971/76‑1 (MQ=255)
                       cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGaa       <  2:1265189/76‑1 (MQ=255)
                       cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGaa       <  2:601523/76‑1 (MQ=255)
                       cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGGTCGGAggga       >  1:4372857/1‑74 (MQ=17)
                       cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCGCGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGaa       <  2:6194275/76‑1 (MQ=21)
                       cAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCGCCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGaa       <  2:1788224/76‑1 (MQ=21)
                         gTTGATTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCAAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagt     <  1:4420052/76‑1 (MQ=255)
                         gTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagt     <  1:7801156/76‑1 (MQ=255)
                         gTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagt     <  2:817432/76‑1 (MQ=255)
                          ttGACTTTTAATCAATTGGTCGCGGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagta    <  2:331826/76‑1 (MQ=255)
                           tGATTTTTAATCAGTTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagtag   <  2:6682575/76‑1 (MQ=255)
                           tGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAt                          >  1:905165/1‑53 (MQ=40)
                           tGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAACCCTGCACGCCCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagtag   <  2:4205526/76‑1 (MQ=255)
                            gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAAt                          >  1:3032462/1‑52 (MQ=40)
                            gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt  <  1:3473914/76‑1 (MQ=255)
                            gACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAagtagt  <  1:1394737/76‑1 (MQ=255)
                            |                                                                           
GGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCACTAATTACGGTGGGTTCGGTGGAAGTAGT  >  REL606/761726‑761829

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: