| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2039202 = | 108 (0.460) | 4 (0.020) | 4/130 | 19.8 | 3.8% | coding (493/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA |
| ? | REL606 | 2039549 = | 109 (0.540) | coding (146/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAA > REL606/2039474‑2039624 | tCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGt > 1:7255434/1‑76 (MQ=255) tCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGt > 1:3173742/1‑76 (MQ=255) cATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTa < 1:4580921/76‑1 (MQ=255) cATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTa > 2:3325396/1‑76 (MQ=255) tatCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTaaa > 2:4824158/1‑76 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt < 1:4396386/76‑1 (MQ=255) atCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAAt < 2:4136221/76‑1 (MQ=255) tCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATg > 2:4843112/1‑76 (MQ=255) atatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTGATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTa < 2:2470714/76‑1 (MQ=255) atatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTa > 1:5788785/1‑76 (MQ=255) atatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTa > 1:6171623/1‑76 (MQ=255) atatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTa < 2:7196015/76‑1 (MQ=255) tatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAt < 1:4901793/76‑1 (MQ=255) tatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAt < 1:1475218/76‑1 (MQ=255) tatTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAt > 2:165480/1‑76 (MQ=255) atTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAtt < 1:3999048/76‑1 (MQ=255) ttttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTAttt < 1:5033507/76‑1 (MQ=255) tttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTg < 2:6145599/76‑1 (MQ=255) tttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTg > 1:4385401/1‑76 (MQ=255) ttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTgg < 1:1251923/76‑1 (MQ=255) ttCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTgg < 1:1676024/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc < 1:2941664/76‑1 (MQ=255) cAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTc < 1:3797682/76‑1 (MQ=255) aaGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCtt < 2:4117638/76‑1 (MQ=255) aGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCttt < 2:2353313/76‑1 (MQ=255) gtgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTta < 2:5522952/76‑1 (MQ=255) gtgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTta < 2:4432513/76‑1 (MQ=255) gtgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTta < 2:6606779/76‑1 (MQ=255) tgtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtat < 1:1889178/76‑1 (MQ=255) gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 2:6756481/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat < 1:1681036/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat < 1:844168/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat > 1:5906507/1‑76 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt < 2:751058/76‑1 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt < 2:585329/76‑1 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt > 2:824729/1‑76 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt < 1:487057/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt < 2:1752425/76‑1 (MQ=255) gATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAttt > 1:737336/1‑76 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTa > 1:5826963/1‑76 (MQ=255) atatAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTa < 1:6514373/76‑1 (MQ=255) tataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAg > 2:3677127/1‑76 (MQ=255) tataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAg > 1:909444/1‑76 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:7090658/76‑1 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:2541963/76‑1 (MQ=255) ataACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGa < 1:1725911/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 1:6201322/76‑1 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt > 1:1926799/1‑76 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt > 2:2579555/1‑76 (MQ=255) cGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt < 1:2235472/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGACTCttt < 2:3868201/76‑1 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt > 2:5410903/1‑76 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt > 2:7011811/1‑76 (MQ=255) aTCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCtttt > 1:1984421/1‑76 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt < 2:4232464/76‑1 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTg > 2:6354098/1‑76 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTg > 1:3964999/1‑76 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt > 2:5471822/1‑76 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt < 2:1956889/76‑1 (MQ=255) ggAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTa < 2:434319/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 2:5198254/76‑1 (MQ=255) gCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTta < 1:3910651/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 2:370919/76‑1 (MQ=255) cGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAg > 1:736129/1‑76 (MQ=255) gTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGa < 1:554177/76‑1 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt > 1:1178649/1‑76 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt < 1:1388746/76‑1 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt > 2:3808757/1‑76 (MQ=255) tAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAttt > 2:1024836/1‑76 (MQ=255) tAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAttt < 2:5747102/76‑1 (MQ=255) tAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAttt < 1:3090952/76‑1 (MQ=255) aaTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTta > 2:6732720/1‑76 (MQ=255) aaTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTta > 1:2347129/1‑76 (MQ=255) aTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTtat < 1:6182726/76‑1 (MQ=255) tGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTtata < 1:4747614/76‑1 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa < 1:6896694/76‑1 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa > 2:2307573/1‑76 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa > 1:5119204/1‑76 (MQ=255) tCCATTAAAAATAAAAGTAAATGCTATTGGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaaa < 1:7341729/76‑1 (MQ=255) cATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACa < 2:472355/76‑1 (MQ=255) aTCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACaa > 2:4167309/1‑76 (MQ=255) aTCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACaa < 2:6247113/76‑1 (MQ=255) tCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAt < 1:2377195/76‑1 (MQ=255) cAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAtt > 2:6858211/1‑76 (MQ=255) cAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAtt > 1:4097886/1‑76 (MQ=255) aaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAttt > 2:5407063/1‑76 (MQ=255) aaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAttt < 2:240968/76‑1 (MQ=255) aaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAttt < 2:3263046/76‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAtttt < 1:2973580/76‑1 (MQ=255) aTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCAt > 2:5750632/1‑76 (MQ=255) tAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATg > 2:1951696/1‑76 (MQ=255) tAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATg < 2:4946004/76‑1 (MQ=255) tAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATg > 1:2509520/1‑76 (MQ=255) tAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATg < 2:2330445/76‑1 (MQ=255) tAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATg < 2:2405370/76‑1 (MQ=255) aaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGAc > 1:3685149/1‑76 (MQ=255) aaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGAc > 2:3503874/1‑76 (MQ=255) aaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACt > 1:7008183/1‑76 (MQ=255) aaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACt < 1:3439826/76‑1 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaa < 2:2884536/76‑1 (MQ=255) | TTCATATCGATATTTTCAAAGTGTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAA > REL606/2039474‑2039624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |