| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | REL606 | 1,136,082 | T→G | intergenic (‑23/+51) | dinI ← / ← pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydroorotase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 1,136,082 | 0 | T | G | 99.5% | 930.8 / ‑4.8 | 213 | intergenic (‑23/+51) | dinI/pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydroorotase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base G (98/114); total (98/115) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
AGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGT > REL606/1136009‑1136154 | aGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACggg > 1:4700268/1‑76 (MQ=255)aGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACggg < 2:3611128/76‑1 (MQ=255) gcccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGtt < 2:5477613/75‑1 (MQ=255) ccccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGtt < 1:5124719/76‑1 (MQ=255) ccccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGtt < 2:2592553/76‑1 (MQ=255) cAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttatt > 1:4812858/1‑76 (MQ=255) cAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttatt < 2:1691274/76‑1 (MQ=255) aGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttattt < 2:2714469/76‑1 (MQ=255) aGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttattt > 1:6785005/1‑76 (MQ=255) gCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttattta < 2:5607786/76‑1 (MQ=255) cTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttatttat > 1:809901/1‑76 (MQ=255) cTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGttatttat < 2:609112/76‑1 (MQ=255) tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTtata < 1:2681580/76‑1 (MQ=255) tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTCCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTtata > 1:4134103/1‑76 (MQ=255) ggCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAAGTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATAc < 2:7495888/76‑1 (MQ=255) gCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACa > 2:1217918/1‑76 (MQ=255) cAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAg < 1:2512001/76‑1 (MQ=255) cAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAg > 2:5401144/1‑76 (MQ=255) aaTGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAgg > 1:6378049/1‑76 (MQ=255) tGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCTCCCTGTTGAATATTAGGGTTATTTATACAGGTa < 2:3081448/76‑1 (MQ=255) tGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTa < 2:2940983/76‑1 (MQ=255) ggAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaa > 1:127209/1‑76 (MQ=255) ggAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaa > 1:6596204/1‑76 (MQ=255) ggAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaa < 1:1580976/76‑1 (MQ=255) gagaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaaa < 1:6841996/76‑1 (MQ=255) agaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaaaa > 2:74732/1‑76 (MQ=255) agaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTaaaa > 2:7431076/1‑76 (MQ=255) gaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAAt < 2:1280942/76‑1 (MQ=255) gaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAAt < 2:579411/76‑1 (MQ=255) aaGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATa < 1:3689235/76‑1 (MQ=255) aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATaa < 1:5078151/76‑1 (MQ=255) aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATaa < 2:6623285/76‑1 (MQ=255) aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATaa > 2:464409/1‑76 (MQ=255) aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATaa < 2:2366198/76‑1 (MQ=255) gTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAAc < 2:2348273/76‑1 (MQ=255) ttttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAAcc < 1:5926844/76‑1 (MQ=255) tttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCt > 1:6430693/1‑76 (MQ=255) tttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCt < 2:243084/76‑1 (MQ=255) tCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTaa < 2:6584261/76‑1 (MQ=255) tCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTaa > 1:3510363/1‑76 (MQ=255) tCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTaa > 1:3234545/1‑76 (MQ=255) cGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt > 2:1065512/1‑76 (MQ=255) cGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt > 1:194708/1‑76 (MQ=255) cTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGa < 2:1900079/76‑1 (MQ=255) cTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGa > 2:1777022/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac < 1:3025020/76‑1 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 1:1391800/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 2:7226130/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 2:1109379/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 1:113272/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac < 1:5691889/76‑1 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 1:3891116/1‑76 (MQ=255) tATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGATATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGac > 1:2130712/1‑76 (MQ=255) tGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGacaa > 1:1790990/1‑76 (MQ=255) 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> 1:7067909/1‑76 (MQ=255) cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCt < 1:2021614/76‑1 (MQ=255) cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCt < 2:6532026/76‑1 (MQ=255) aaTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTa < 2:3397207/76‑1 (MQ=255) aaTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTa < 2:5651650/76‑1 (MQ=255) aTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTAc > 1:5628823/1‑76 (MQ=255) gCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAtt < 2:4581356/76‑1 (MQ=255) cATAATAGCCTCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttt > 2:6777311/1‑76 (MQ=255) cATAATAGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttt > 1:6480161/1‑76 (MQ=255) taataGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttttt < 2:5309072/76‑1 (MQ=255) taataGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttttt > 1:5815666/1‑76 (MQ=255) ataGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTAt > 2:4679643/1‑76 (MQ=255) taGCCCCCTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTAtt > 2:1986250/1‑76 (MQ=255) cccccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGtt > 2:4759231/1‑76 (MQ=255) ccccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt > 2:6202478/1‑76 (MQ=255) ccccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt < 1:4386820/76‑1 (MQ=255) ccccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt > 1:3827160/1‑76 (MQ=255) ccccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt < 2:1634558/76‑1 (MQ=255) cccTGTTGAATATACGGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTa < 2:559588/76‑1 (MQ=255) 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AGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGT > REL606/1136009‑1136154 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |