| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1419093 = | 235 (1.090) | 6 (0.030) | 4/136 | 20.6 | 2.9% | coding (432/1458 nt) | trkG | potassium transporter subunit |
| ? | REL606 | 1419377 = | 188 (0.960) | coding (716/1458 nt) | trkG | potassium transporter subunit | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
TTTGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGTTATTAG > REL606/1419302‑1419452 | tttGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTa > 2:1739776/1‑76 (MQ=255)tttGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTa < 1:6071776/76‑1 (MQ=255) ttGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAt < 2:1075982/76‑1 (MQ=255) ttGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAt < 2:5623240/76‑1 (MQ=255) ttGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAt < 1:1984482/76‑1 (MQ=255) tGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAtt < 1:4643480/76‑1 (MQ=255) tGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAtt > 2:1539655/1‑76 (MQ=255) gTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTAttt < 2:6638608/76‑1 (MQ=255) tCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTg < 2:4195407/76‑1 (MQ=255) tCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTg > 2:216175/1‑76 (MQ=255) cACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTgg < 1:2342981/76‑1 (MQ=255) cACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTgg > 1:1859044/1‑76 (MQ=255) cACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTgg < 2:3208748/76‑1 (MQ=255) aCGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGt < 1:2020339/76‑1 (MQ=255) aCGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGt < 2:5098918/76‑1 (MQ=255) cGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGtt < 1:2614550/76‑1 (MQ=255) gggATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTg < 1:2723125/76‑1 (MQ=255) gggATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTg < 1:2932404/76‑1 (MQ=255) gggATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTg < 1:648358/76‑1 (MQ=255) gggATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTg > 2:5585426/1‑76 (MQ=255) gggATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTg < 1:3693496/76‑1 (MQ=255) gATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAg > 2:1133819/1‑76 (MQ=255) gATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAg < 1:4203580/76‑1 (MQ=255) aTTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGc > 2:52303/1‑76 (MQ=255) aTTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGc > 2:2287559/1‑76 (MQ=255) aTTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGc > 1:6305121/1‑76 (MQ=255) tttCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCt > 2:6554933/1‑76 (MQ=255) tttCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCt > 2:3378223/1‑76 (MQ=255) ttCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtg < 2:3808736/76‑1 (MQ=255) ttCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtg < 1:4891912/76‑1 (MQ=255) ttCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtg > 1:5156739/1‑76 (MQ=255) tCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtgg > 1:934197/1‑76 (MQ=255) ccACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtggt < 1:6922329/76‑1 (MQ=255) ccACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtggt > 2:1345700/1‑76 (MQ=255) ccACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGAGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtggt < 1:956980/76‑1 (MQ=255) cacgGTTTCGTTTGGTGGTTTCTCAACGCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCtggtg < 1:1910068/76‑1 (MQ=255) caGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGc > 2:1575171/1‑76 (MQ=255) aGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCt > 1:4852773/1‑76 (MQ=255) gTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTg < 2:1418237/76‑1 (MQ=255) gTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTg < 2:2438226/76‑1 (MQ=255) cGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTc < 2:3617921/76‑1 (MQ=255) cGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTc < 2:3322302/76‑1 (MQ=255) cTTTGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCtt < 1:2523787/76‑1 (MQ=255) cTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCtt < 2:1907102/76‑1 (MQ=255) ttGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTtttt > 1:3588469/1‑76 (MQ=255) ttGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCttt > 1:3477164/1‑76 (MQ=255) ttGGTGGTTTCTAAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCttt < 1:5794188/76‑1 (MQ=255) tggtggTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTtttttt > 1:2992707/1‑76 (MQ=255) ggtggtTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCttttt > 1:1237211/1‑76 (MQ=255) tggtTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTcc < 2:4266506/76‑1 (MQ=255) tggtTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTcc < 2:6481515/76‑1 (MQ=255) tggtTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTcc < 2:2346350/76‑1 (MQ=255) gtTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCt < 2:2965059/76‑1 (MQ=255) gtTTCTCAACTCATAGCGAGAGAATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTACTTTTTCCCt > 1:5236526/1‑76 (MQ=255) tttCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTg < 1:6950341/76‑1 (MQ=255) tttCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTg < 1:4462899/76‑1 (MQ=255) ctcAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTa < 2:4812324/76‑1 (MQ=255) ctcAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTa > 1:1351772/1‑76 (MQ=255) tcAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTTCCTGCttt > 1:1321535/1‑74 (MQ=255) catcTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATc < 1:2938568/73‑1 (MQ=255) aaCTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCg < 1:2586628/76‑1 (MQ=255) aCTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCgg < 2:6931033/76‑1 (MQ=255) aCTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTATCgg > 1:6856925/1‑76 (MQ=255) cTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTTCCTGCTATCCGc > 1:427957/1‑76 (MQ=255) tCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATTGGCt > 1:5101907/1‑76 (MQ=255) cATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTTCCTGCTATCGGCtt > 2:4300607/1‑76 (MQ=255) cATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTATCGGCtt > 2:5066526/1‑76 (MQ=255) tAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTc < 1:4327565/76‑1 (MQ=255) aGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCa < 1:915733/76‑1 (MQ=255) aGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCa < 2:2564090/76‑1 (MQ=255) aGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCa < 2:4455542/76‑1 (MQ=255) gCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCaa < 1:3768092/76‑1 (MQ=255) cGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTATTGGCTTTTAAc > 2:6903039/1‑76 (MQ=255) gagaGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACt < 2:2916480/76‑1 (MQ=255) gagTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTc < 2:3043203/76‑1 (MQ=255) gagTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTc < 1:5221920/76‑1 (MQ=255) aTCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCActc > 1:6162608/1‑76 (MQ=255) aTCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTATTGGCTTTTCACTTCActc > 1:5524823/1‑76 (MQ=255) tCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCActct < 1:636556/76‑1 (MQ=255) cGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCCCTCtt > 2:4722485/1‑76 (MQ=255) cGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCtt < 2:6116684/76‑1 (MQ=255) cGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCtt < 2:4046358/76‑1 (MQ=255) cGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCtt < 1:5836629/76‑1 (MQ=255) gATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTg > 2:6029749/1‑76 (MQ=255) gATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTg < 2:6336910/76‑1 (MQ=255) gATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTg < 1:1007838/76‑1 (MQ=255) gATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTg < 2:6747722/76‑1 (MQ=255) atatTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTgg > 1:1310038/1‑76 (MQ=255) atatTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGGTCTTTTTCCCTGCTATCTGCTTTCCACCTCCCTCTTTgg > 2:3274994/1‑76 (MQ=255) atTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTTAACTTCACTCTTTGGta > 1:6693318/1‑76 (MQ=255) tttAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGtata > 2:908018/1‑76 (MQ=255) tttAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGtata > 2:4414706/1‑76 (MQ=255) tttAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGtata < 2:3883040/76‑1 (MQ=255) aataaCTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTg < 1:589733/76‑1 (MQ=255) aataaCTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTg < 1:3946739/76‑1 (MQ=255) ataaCTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTTGTATATTGt > 2:4906658/1‑76 (MQ=255) taaCTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGtt < 1:4049902/76‑1 (MQ=255) aaCTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGtta > 1:5583636/1‑76 (MQ=255) cTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGttatt > 1:1654781/1‑76 (MQ=255) tATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGttatta > 2:3491071/1‑76 (MQ=255) | TTTGTCACGGGATTTCCACAGTTTCGCTTGGTGGTTTCTCAACTCATAGCGAGAGTATCGGATATTTTAATAACTATTTGGTTGAGCTGGTGGCTGGTTCTTTTTCCCTGCTATCGGCTTTCAACTTCACTCTTTGGTATATTGTTATTAG > REL606/1419302‑1419452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |