| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 6 (0.140) | 50 (1.210) | 40/146 | 0.1 | 91.0% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.100) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 | aaaGCTGGTAAGTCCTTTACTTTTACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAANGGTTGCGGTAACGTATg < 1:173624/76‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 1:1030280‑M1/9‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 2:834295‑M1/9‑1 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 2:1191672‑M1/66‑76 (MQ=255) gCTGGTCAGAACTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaac < 1:1270514‑M2/76‑4 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:1004019‑M2/76‑5 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:473650‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 2:237930‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt > 2:73901‑M2/1‑71 (MQ=255) ggTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgta < 2:759489‑M2/76‑7 (MQ=255) ggTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgta > 2:528816‑M2/1‑70 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 2:834295‑M2/76‑10 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 1:1030280‑M2/76‑10 (MQ=255) gACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag > 2:1191672‑M2/1‑65 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 2:920769‑M1/19‑1 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact > 1:812765‑M1/58‑76 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 1:693971‑M1/19‑1 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACATATGAAGGTTTCactac > 1:1326826‑M1/56‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:599017‑M1/55‑76 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 1:812765‑M2/1‑57 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 1:693971‑M2/76‑20 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 2:920769‑M2/76‑20 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg < 2:909760‑M1/28‑1 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacatatgaaggtttcactac > 1:1326826‑M2/1‑55 (MQ=255) taataaatctgttatcggcaacagcgagatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt < 1:153691‑M1/29‑1 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:599017‑M2/1‑54 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGATGGTTTCACTACTGACctgtctg < 2:116413‑M1/32‑1 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 1:305500‑M1/45‑76 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 2:87668‑M1/45‑76 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:147484‑M1/34‑1 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:323369‑M1/34‑1 (MQ=255) tctgttatctgcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg > 1:614356‑M1/41‑76 (MQ=255) cTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg < 2:909760‑M2/76‑29 (MQ=255) taataAATCTGTTATCGGCAACAGCGAGATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgt < 1:153691‑M2/74‑30 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:735537‑M1/39‑1 (MQ=255) 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atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac > 2:610802‑M1/35‑76 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 2:1256279‑M1/42‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt < 2:323369‑M2/76‑35 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt < 2:147484‑M2/76‑35 (MQ=255) tcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACAcc < 1:119468‑M1/43‑1 (MQ=255) tCTGTTATCTGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg > 1:614356‑M2/1‑40 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 1:834513‑M1/31‑76 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 1:325034‑M1/46‑1 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 1:554792‑M1/31‑76 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 1:735537‑M2/76‑40 (MQ=255) ttNTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcnac > 2:1098881‑M2/1‑36 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAACTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactgctgacctgtctgttggcaac < 1:1327622‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 1:941722‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:784691‑M2/76‑41 (MQ=255) tATCGGCAACATCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca > 1:578677‑M2/1‑35 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca > 1:319014‑M2/1‑35 (MQ=255) acagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTg > 1:357190‑M1/28‑76 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac > 2:610802‑M2/1‑34 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 2:1256279‑M2/76‑43 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacacc < 1:119468‑M2/76‑44 (MQ=255) cgaaatggtcgcggtaacgtatgTACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGNCAACACCGTACTGGTTg > 1:165987‑M1/24‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 1:325034‑M2/76‑47 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 1:834513‑M2/1‑30 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 1:554792‑M2/1‑30 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 1:581261‑M1/55‑1 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg > 1:357190‑M2/1‑27 (MQ=255) tggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGAt > 1:1128106‑M1/19‑76 (MQ=255) 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gTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatgg < 2:1034185‑M2/76‑61 (MQ=255) ttGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt < 2:480383‑M2/76‑62 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 2:258560‑M1/70‑1 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg > 2:292505‑M2/1‑12 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg > 2:341556‑M1/4‑76 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATgg < 2:1270159‑M1/74‑1 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaccccgtactggttgacgatggtctgat > 2:315113‑M2/1‑10 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc > 1:975580‑M2/1‑9 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 2:1215093‑M2/76‑68 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa < 1:315381‑M1/75‑1 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa < 2:1105368‑M1/76‑1 (MQ=255) cgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggt < 2:258560‑M2/76‑71 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 2:1102395/76‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:816005/76‑1 (MQ=255) tATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTa < 2:861746/76‑1 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg > 2:341556‑M2/1‑3 (MQ=255) tgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatgg < 2:1270159‑M2/76‑75 (MQ=255) tGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTAcc < 1:1123970/76‑1 (MQ=255) gaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatgga < 1:315381‑M2/76‑76 (MQ=255) | AAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733220‑1733370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |