| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 8 (0.170) | 57 (1.230) | 42/146 | 0.1 | 89.2% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 6 (0.130) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATG > REL606/1733213‑1733360 | aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga > 2:689761‑M1/76‑76 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga > 2:434169‑M1/76‑76 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga > 2:847764‑M1/76‑76 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:94894‑M1/1‑1 (MQ=255) tggtcagacntttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 1:42845‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttnaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 1:1455386‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 1:1280040‑M1/5‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 2:390879‑M1/5‑1 (MQ=255) tGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTa > 2:83023/1‑76 (MQ=255) gtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtat > 1:985857‑M1/70‑76 (MQ=255) gtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtat > 1:937080‑M1/70‑76 (MQ=255) gAAAGCTGGACAGACCTTTACTNTCACCACTGACTAATNTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGCANCGTAt > 1:27951/1‑76 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 1:475319‑M1/9‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga > 2:577100‑M1/68‑76 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 2:1331857‑M1/9‑1 (MQ=255) cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 2:1331847‑M1/9‑1 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa > 2:847764‑M2/1‑75 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 2:94894‑M2/76‑2 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttancggcaacagcgaaatggttgcgntaacttatcancgtatgaa < 2:1289393‑M1/10‑1 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 2:845271‑M1/66‑76 (MQ=255) tGGTCAGACNTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:42845‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTNACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:1455386‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:1280040‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 2:390879‑M2/76‑6 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt > 1:566966‑M1/62‑76 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 1:985857‑M2/1‑69 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 1:937080‑M2/1‑69 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 1:642319‑M1/60‑76 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa > 2:3691‑M1/60‑76 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 2:1331857‑M2/76‑10 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga > 2:577100‑M2/1‑67 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:502582‑M1/18‑1 (MQ=255) actttcaccactgataaagctattgtcggcaacagcgaaatggttgcggcaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac > 1:1441741‑M1/59‑76 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGATTCact < 1:1400751‑M1/19‑1 (MQ=255) tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCacta < 2:128997‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCacta < 2:709435‑M1/20‑1 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 2:1473131‑M1/56‑76 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt > 1:566966‑M2/1‑61 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa < 1:257714‑M1/24‑1 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 1:642319‑M2/1‑59 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca > 2:3691‑M2/1‑59 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:502582‑M2/76‑19 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAAGCTATTGTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGCAACGTATGaacgtatgaaggtttcac > 1:1441741‑M2/1‑58 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggattcact < 1:1400751‑M2/76‑20 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTGTCACTACTGACct > 1:103560‑M1/50‑76 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 1:601953‑M2/76‑21 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 2:128997‑M2/76‑21 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 2:709435‑M2/76‑21 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 1:217345‑M2/76‑22 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 2:1473131‑M2/1‑55 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact < 2:1500807‑M2/76‑23 (MQ=255) accacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactga < 1:257714‑M2/76‑25 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt < 1:379441‑M1/33‑1 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAGCTGTCTGtt < 1:47453‑M1/34‑1 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtgtcactactgacct > 1:103560‑M2/1‑49 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgcaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCTCTACTGCCCTGTCTGTTGGCa < 2:235163‑M1/38‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa > 1:680405‑M1/39‑76 (MQ=255) gATAAATCTGTTAACGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtc < 1:97100‑M2/76‑31 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:1025445‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac > 1:1289394‑M1/37‑76 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:799264‑M1/41‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt > 1:291501‑M2/1‑43 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 1:379441‑M2/76‑34 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt < 2:1020511‑M2/76‑34 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgagctgtctgtt < 1:47453‑M2/76‑35 (MQ=255) tcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACAcc > 2:1097493‑M1/34‑76 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg > 1:828756‑M2/1‑40 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGCAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttctctactgccctgtctgttggca < 2:235163‑M2/76‑39 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca > 1:680405‑M2/1‑38 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtctctctcctgacctgtctgttggca < 1:1450871‑M2/76‑39 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac > 1:1289394‑M2/1‑36 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:1025445‑M2/76‑41 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 2:1162504‑M1/48‑1 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 1:799264‑M2/76‑42 (MQ=255) cagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTgg < 1:433203‑M1/50‑1 (MQ=255) gcgaaatggttgcggtaacgtctgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGtt > 1:1441389‑M1/25‑76 (MQ=255) gcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGtt > 2:502581‑M1/25‑76 (MQ=255) cgaaatggttgcggtagcgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTATTCGCAACACCGTACTGGTTg < 1:1445940‑M1/53‑1 (MQ=255) gaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGCCTGTTGGTAACACCGTACTGGTTGa > 1:83987‑M1/23‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 2:355468‑M2/1‑30 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg < 1:1103670‑M1/56‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:1162504‑M2/76‑49 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactgg < 1:433203‑M2/76‑51 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg < 1:481149‑M1/59‑1 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg < 1:481136‑M1/59‑1 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 1:1218752‑M1/18‑76 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 1:1218744‑M1/18‑76 (MQ=255) gCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggtt > 2:502581‑M2/1‑24 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAGCGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctattcgcaacaccgtactggttg < 1:1445940‑M2/76‑54 (MQ=255) gAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgcctgttggtaacaccgtactggttga > 1:83987‑M2/1‑22 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 2:896389‑M1/14‑76 (MQ=255) gcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCt > 2:371854‑M1/14‑76 (MQ=255) cggtaacgtatgAACGTATGTAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTg < 1:8898‑M1/64‑1 (MQ=255) aaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacg < 1:1103670‑M2/76‑57 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg < 1:481136‑M2/76‑60 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 1:1218744‑M2/1‑17 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg > 2:987288‑M1/9‑76 (MQ=255) tatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTAt < 2:645063‑M1/72‑1 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgtaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg < 1:8898‑M2/76‑65 (MQ=255) ggTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctga < 2:607910‑M2/76‑66 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATG > REL606/1733213‑1733360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |