| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 12 (0.270) | 52 (1.190) | 35/146 | 0.3 | 86.9% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.090) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 | ttCTNTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTCTCGTCACTGANAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 1:169695/76‑1 (MQ=255)ttCTCTGAAAGCTGGTCTGACNTTTAANTTCTCCAGTGATAGATCTGTNATGGGCAACAGAGATAGGGTTGCGGTa > 1:1383876/1‑76 (MQ=255)ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 2:791218/76‑1 (MQ=255)ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 2:1132226/76‑1 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:676315‑M1/1‑1 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:20825‑M1/1‑1 (MQ=255) ctctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCCGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAAc < 2:522684/76‑1 (MQ=255) tctGNAAGCTGGTCAGACCTTTAGTTTCACCTGTGATAANTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACg < 1:171532/76‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 1:279734‑M1/4‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccacagataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 2:811524‑M1/5‑1 (MQ=255) ctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt < 1:1033891/76‑1 (MQ=255) ctGAAAGCTGGTCAGACCNTTACTTTCACCACTGATAAAGCTGTTAGCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt > 1:1358501/1‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:1000424/1‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:318322/76‑1 (MQ=255) cagCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCACCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 2:676301‑M2/75‑2 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 2:20825‑M2/76‑2 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 2:676315‑M2/76‑2 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 2:1126596‑M1/66‑76 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:279734‑M2/76‑5 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGaagggt < 2:535656‑M1/14‑3 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGtt > 2:1376506‑M1/63‑76 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt > 2:640073‑M1/62‑76 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGttt < 2:642033‑M1/15‑1 (MQ=255) gACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag > 2:1126596‑M2/1‑65 (MQ=255) cTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtt > 2:1376506‑M2/1‑62 (MQ=255) cTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagggt < 2:535656‑M2/76‑15 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt < 2:642033‑M2/76‑16 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggttt > 2:640073‑M2/1‑61 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 2:1424715‑M1/23‑1 (MQ=255) ccactgataattctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 1:1320441‑M1/25‑1 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACct < 1:1106294‑M1/27‑1 (MQ=255) tgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt > 2:683145‑M1/48‑76 (MQ=255) ntaaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCNCTACTGACctgtct < 2:208280‑M1/31‑1 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 2:1424715‑M2/76‑24 (MQ=255) ataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct > 1:969997‑M1/46‑76 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg > 1:368298‑M1/45‑76 (MQ=255) ccacTGATAATTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 1:1320441‑M2/76‑26 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 2:921420‑M1/34‑1 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct < 1:1106294‑M2/76‑28 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacct > 1:463639‑M2/1‑49 (MQ=255) tgatgaGTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgt > 2:1358501‑M2/1‑47 (MQ=255) tGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgt > 2:683145‑M2/1‑47 (MQ=255) ntaAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcnctactgacctgtct < 2:208280‑M2/75‑32 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa < 1:630570‑M1/39‑1 (MQ=255) aTAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct > 1:969997‑M2/1‑45 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 1:1236789‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:894379‑M1/40‑1 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg > 1:241196‑M2/1‑44 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg > 1:368298‑M2/1‑44 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggatnnggtaacgtatnNTCGTATGAGGGTTTTACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 1:1284119‑M1/36‑76 (MQ=255) gagcggcaacagcgaaagggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca > 1:430593‑M1/36‑76 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 2:817724‑M1/42‑1 (MQ=255) atcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAacac < 2:375487‑M1/42‑1 (MQ=255) ggcaacagcgaaaaggttgcggtcacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGt > 1:1218515‑M1/32‑76 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa > 2:229629‑M1/31‑76 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 1:630570‑M2/76‑40 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 1:1320328‑M2/76‑40 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 1:1236789‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:894379‑M2/76‑41 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 2:62967‑M1/48‑1 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 1:244757‑M1/48‑1 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca > 1:430570‑M2/1‑35 (MQ=255) gagcggcAACAGCGAAAGGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca > 1:430593‑M2/4‑35 (MQ=255) acagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTg < 2:490126‑M1/49‑1 (MQ=255) cagcgaaatggttgcggtaacgtataAACGTGTGAAGGTGNNACTACTGACCNNTATGTTGGCAACACCGTACTgg < 1:1286282‑M1/50‑1 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 2:375487‑M2/76‑43 (MQ=255) aTCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacac < 2:817724‑M2/76‑43 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTGTGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGAACTGGt < 1:1307705‑M1/51‑1 (MQ=255) agcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGt < 1:438689‑M1/51‑1 (MQ=255) ggCAACAGCGAAAAGGTTGCGGTCACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt > 1:1218515‑M2/1‑31 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta > 1:805016‑M2/1‑30 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg > 1:387356‑M1/21‑76 (MQ=255) aatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACg > 1:1189865‑M1/21‑76 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:62967‑M2/76‑49 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:62984‑M2/76‑49 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 1:244757‑M2/76‑49 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATAaacgtgtgaaggtgnnactactgaccnntatgttggcaacaccgtactgg < 1:1286282‑M2/76‑51 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtgtgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgaactggt < 1:1307705‑M2/76‑52 (MQ=255) aGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggt < 1:438689‑M2/76‑52 (MQ=255) gttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATgg < 2:750852‑M1/60‑1 (MQ=255) 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ttGCGGTAACGTNTGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt < 1:15771‑M2/76‑62 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 1:1110653‑M1/70‑1 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa < 1:407475‑M1/71‑1 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa < 2:385076‑M1/71‑1 (MQ=255) ggTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctga > 1:669311‑M2/1‑11 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATgg > 2:438689‑M1/3‑76 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactganctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 2:1212935‑M2/76‑68 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 2:749456‑M2/76‑68 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 1:339498‑M2/76‑69 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:1318982‑M1/1‑76 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCGGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:811524‑M1/1‑76 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |