| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 1,875,483 | 0 | G | C | 25.7% | 175.2 / 45.2 | 70 | intergenic (+156/‑28) | yeaB/sdaA | predicted NUDIX hydrolase/L‑serine deaminase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (22/30); new base C (18/0); total (40/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.10e-06 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCT > REL606/1875408‑1875558 | tAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAg > 1:1004153/1‑76 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTCCACTATCAGATGTTATTAGTTAGTTTCTTGGAGtt > 1:309470/1‑75 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTc > 1:472520/1‑76 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTc > 1:451394/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:878613/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:500074/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAg > 1:437462/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAg < 1:628312/76‑1 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGCAACTCCAg > 1:1266977/1‑76 (MQ=255) aTGTGAATAGTTAAGCCAGTCTCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGCACTCCAGt > 1:1264974/1‑76 (MQ=255) aTGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGt > 2:600983/1‑76 (MQ=255) aTGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGt > 2:420965/1‑76 (MQ=255) tgtgAATAGTTANGCCAGTCGCTGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTc > 1:12819/1‑76 (MQ=255) tgtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTATTTCGTTACTGGAACTCCAGTc > 1:972944/1‑76 (MQ=255) tgtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTc > 1:271179/1‑76 (MQ=255) tgtgAAGAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTc < 1:1299969/76‑1 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:842276/1‑76 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:369696/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAc < 2:821867/76‑1 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:893012/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:1069553/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAATCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGTACTCCAGTCAcc > 1:1309476/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCACTTACACTATGCGCTGTTNTTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGCCAcc > 1:133954/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCATCTTACACTATGCGCTGTTATCAGTTCGTTACTGGAACTCCAGCCAcc > 1:1413445/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCt < 1:1016860/76‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTAAGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:136459/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTGCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCt < 1:1227398/76‑1 (MQ=255) aTAGTTAAGNCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCtt > 1:36429/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCtt > 1:538782/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCtt > 1:1003686/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTCCGTTACTGGANCTCCAGTCAcatg > 1:192160/1‑73 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTTGTTCGTTACTGGTACTCCAGTCACTTTGt > 1:357612/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGt > 1:830986/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGt > 1:646809/1‑76 (MQ=255) gTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTGACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGGTACTGCAACTCCAGTCACCTTGta > 1:1349178/1‑75 (MQ=255) ttAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCCTGtaa > 1:704551/1‑74 (MQ=255) tAAGCCAGTNGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAg > 1:34325/1‑76 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAg > 1:575919/1‑76 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:1056217/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:855213/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:842243/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGGCACCTTGtaat > 1:224046/1‑73 (MQ=255) aGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGa > 1:1049076/1‑76 (MQ=255) aGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGa < 1:906927/76‑1 (MQ=255) cAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGta > 2:942419/1‑76 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTTCAGTCACCTTGTCAGGAGtat < 1:256748/76‑1 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat < 2:107964/76‑1 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat > 2:571230/1‑76 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat < 1:425239/76‑1 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat > 1:906017/1‑76 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat < 1:1121768/76‑1 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTATTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat > 1:99392/1‑76 (MQ=255) agcgTTCCCTCTTNCACTATGCGCAGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGt < 1:185102/75‑1 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 2:469067/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGNTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGNCAGGAGTATTNTCGTGAtt > 2:1190409/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGNTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGNCAGGAGTAATNTCGTGAtt > 2:1190392/1‑76 (MQ=255) tCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTa < 1:624057/76‑1 (MQ=255) cccTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAg > 1:726784/1‑76 (MQ=255) cccTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAg > 1:439683/1‑76 (MQ=255) ctctTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTc < 1:1238320/76‑1 (MQ=255) tctTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCt < 1:600983/76‑1 (MQ=255) ttACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAt < 2:905631/76‑1 (MQ=255) ttACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAt < 1:963325/76‑1 (MQ=255) tACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAtt < 2:315536/76‑1 (MQ=255) cacTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCg < 1:1374659/76‑1 (MQ=255) acTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGa < 1:368650/76‑1 (MQ=255) cTATGCGCTGTTATTAGTGCGCTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGAc < 1:1343879/76‑1 (MQ=255) tATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGTTTAGTCTATTCGACa > 2:46169/1‑76 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 1:1072972/76‑1 (MQ=255) tGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTaa < 2:843466/76‑1 (MQ=255) tGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTaa < 2:726929/76‑1 (MQ=255) ttattaGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAgg > 2:342464/1‑76 (MQ=255) attaGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTg > 1:454928/1‑76 (MQ=255) aGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTgggg < 1:710954/76‑1 (MQ=255) aGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTgggg < 2:1018901/76‑1 (MQ=255) tCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAtt < 1:743401/76‑1 (MQ=255) tCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAtt > 2:633377/1‑76 (MQ=255) cGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTg < 1:446683/76‑1 (MQ=255) gTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTgg > 1:1099767/1‑76 (MQ=255) cTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTccc > 2:1166061/1‑76 (MQ=255) ggAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTc < 1:934090/76‑1 (MQ=255) ggAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTc < 2:1085879/76‑1 (MQ=255) aGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATc < 1:1176745/76‑1 (MQ=255) gTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCt < 2:1317268/76‑1 (MQ=255) | TAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCT > REL606/1875408‑1875558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |