Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | REL606 | 2,448,493 | IS186 (–) +6 bp | intergenic (+24/+21) | nupC → / ← yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2448493 = | 1 (0.040) | 36 (1.270) | 27/144 | 0.2 | 97.1% | intergenic (+24/+26) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | 2772854 = | NA (NA) | noncoding (1/1343 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | REL606 | = 2448498 | 0 (0.000) | 32 (1.130) | 26/144 | 0.2 | 100% | intergenic (+29/+21) | nupC/yfeA | nucleoside (except guanosine) transporter/predicted diguanylate cyclase |
? | REL606 | = 2774196 | NA (NA) | noncoding (1343/1343 nt) | IS186 | repeat region |
ATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448565‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > REL606/2772854‑2772931 ATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCC > 2:488382/1‑76 CAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAG > 1:26019/1‑76 AAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGC > 1:280136/1‑76 TATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAA > 2:493412/1‑76 TTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT > 1:47887/1‑76 TTGATTGGTCGCCCGCAGACATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTT < 1:733339/76‑1 GATTGGCCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAA > 1:146171/1‑76 ATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGTGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:89529/76‑1 ATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAG < 1:147898/76‑1 GGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGT < 2:96270/76‑1 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT > 2:920660/1‑76 CGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGT < 2:919356/76‑1 CCCGCAGCTATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTACCTTAAGGGTTGTGG > 2:633207/1‑76 CCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGT > 1:90290/1‑76 CGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCGATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTA > 1:559770/1‑76 AGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTA < 2:507273/76‑1 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:483417/76‑1 GCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTAC < 1:68429/76‑1 CATTAGCTGATTCACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 2:153752/1‑76 CATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 1:651488/1‑76 CATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGC > 2:230409/1‑76 TTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCT < 2:556953/76‑1 TAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTG > 1:578363/1‑76 AACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTT > 1:342729/1‑76 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 1:382117/76‑1 ACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTA < 1:294286/76‑1 CAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAA < 2:47887/76‑1 AAAAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATAATTTAACGTGCCGAT < 2:609047/76‑1 AAACCGGGGAATTATCCCNTAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAGGTGCCGATGA < 1:758615/76‑1 AAACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGA < 2:741057/76‑1 ACCGGGGAATTATCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAAT < 2:90290/76‑1 AATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTC < 1:28606/76‑1 nTTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTGTCA < 1:837457/75‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCA < 1:681565/76‑1 ATTATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCA > 1:907116/1‑76 aaCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTTGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCTGATGAATTACTCTCACGA < 2:873443/74‑1 ATCCCATAAGCGCGAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGA < 2:49810/76‑1 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCATGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGAT < 1:685479/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAATGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTGACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:94729/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 2:943641/76‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATA < 1:168653/76‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAA < 1:485685/76‑1 CATAAGTGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC < 1:869770/76‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > 1:368955/1‑76 ATCTGCAAGGGTATTTGATTGGTCGCCCGCAGCCATTAGCTGATTAACAGGCGTAAAAAAACCGGGGAATTATccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/2448565‑2448493 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAC > REL606/2772854‑2772931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |