| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 4 (0.130) | 29 (1.010) | 26/146 | 0.2 | 92.2% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 1 (0.030) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
AAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTT > REL606/1733221‑1733366 | nagCTGGTCAGACCTTTACTTNCACCACNGATAATTCTGTTATCGGGAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa > 1:805847‑M2/2‑75 (MQ=255)cagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga < 1:483844‑M1/9‑1 (MQ=255) agacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatgaa < 1:649075‑M1/10‑1 (MQ=255) aGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaa > 1:398517‑M2/1‑74 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:443191‑M2/76‑5 (MQ=255) tttactttcaccactgataaatctgatatcggcancagcgaaatggttgcgntgacgtatgAACGTATNAAGGttt < 2:856292‑M1/15‑1 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 2:363692‑M2/1‑69 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatn < 1:845701‑M2/76‑9 (MQ=255) tactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCa < 2:719861‑M1/17‑1 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga < 1:483844‑M2/76‑10 (MQ=255) aGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaa < 1:649075‑M2/76‑11 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 1:719861‑M1/56‑76 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac < 2:704827‑M1/21‑1 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 2:18841‑M1/55‑76 (MQ=255) tttACTTTCACCACTGATAAATCTGATATCGGCANCAGCGAAATGGTTGCGNTGACGTATGaacgtatnaaggttt < 2:856292‑M2/76‑16 (MQ=255) tACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttca < 2:719861‑M2/76‑18 (MQ=255) ccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 1:227837‑M1/25‑1 (MQ=255) 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aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 2:410433‑M1/48‑1 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACATGTCTGTTGGCAACACCGTACt > 1:509557‑M1/29‑76 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaantttgactactgacctgtctgttggcaacacc > 1:78884‑M2/1‑33 (MQ=255) ngcAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt > 1:842273‑M2/2‑31 (MQ=255) ggCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgt > 2:122622‑M2/1‑31 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg < 2:89474‑M1/53‑1 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 1:587952‑M2/76‑47 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac < 1:43275‑M2/76‑48 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:966488‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:204652‑M1/55‑1 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:410433‑M2/76‑49 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 1:797508‑M2/76‑49 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacatgtctgttggcaacaccgtact > 1:509557‑M2/1‑28 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAGGGTTTAACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg < 1:850270‑M1/59‑1 (MQ=255) gcttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 2:102717‑M1/18‑76 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg < 2:89474‑M2/76‑54 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 2:966488‑M2/76‑56 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 2:204652‑M2/76‑56 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgagggtttaactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg < 1:850270‑M2/76‑60 (MQ=255) gcttgcGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 2:102717‑M2/3‑17 (MQ=255) acgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACATCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCgg > 1:89474‑M1/8‑76 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 2:194355‑M1/1‑76 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTAACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:10268‑M1/1‑76 (MQ=255) acgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacatcgtactggttgacgatggtctgatcgg > 1:89474‑M2/1‑7 (MQ=255) ACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTTTCTGTTNGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAg > 1:778529‑M1/1‑76 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:23341/76‑1 (MQ=255) | AAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTT > REL606/1733221‑1733366 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |