Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	REL606	2,849	T→G	F17C (TTT→TGT)	thrB →	homoserine kinase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	REL606	2,849	0	T	G	100.0%	86.7 / NA	23	F17C (TTT→TGT)	thrB	homoserine kinase
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base T (0/0);  new base G (10/13);  total (10/13)

TCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGT  >  REL606/2778‑2912                                                                        |                                                                tcATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGAt                                                             >  1:339164/1‑76 (MQ=255)       aaGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTc                                                       <  2:889083/76‑1 (MQ=255)                gTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGgcggcg                                              >  2:636144/1‑76 (MQ=255)                 tCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGcggcgg                                             >  2:107749/1‑76 (MQ=255)                   tGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTg                                           <  1:916269/76‑1 (MQ=255)                    gACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGa                                          <  1:283663/76‑1 (MQ=255)                         ggTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCt                                     <  1:45819/76‑1 (MQ=255)                           ttcaaGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTNCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACATGt                                   >  2:836417/4‑76 (MQ=255)                            tAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGtt                                  <  2:127922/76‑1 (MQ=255)                              aaGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGa                                >  2:7864/1‑76 (MQ=255)                               aGTTTATGTCCCGGCTTCCNGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACCCCTGTGNAt                               >  1:849249/1‑76 (MQ=255)                                   tATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTg                           >  1:584868/1‑76 (MQ=255)                                   tATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGGGGCACCCGTTGATGGTg                           >  2:763390/1‑76 (MQ=255)                                      gCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCAt                        <  2:893563/76‑1 (MQ=255)                                           ggCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTc                   <  2:267597/76‑1 (MQ=255)                                           ggCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGATCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTc                   <  1:683640/76‑1 (MQ=255)                                            gCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCg                  <  2:251856/76‑1 (MQ=255)                                             cTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGTGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCgg                 <  2:424998/76‑1 (MQ=255)                                                ccAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGgaga              >  2:349684/1‑76 (MQ=255)                                                ccAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGgaga              >  2:594888/1‑76 (MQ=255)                                                 cAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGAt             <  1:628699/76‑1 (MQ=255)                                                   ntGCCAATATGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGt           <  1:820345/75‑1 (MQ=255)                                                         atatGAGCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCAc     >  2:453098/1‑76 (MQ=255)                                                            tgcgCGTCGGGTGTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGt  <  1:453098/73‑1 (MQ=255)                                                                        |                                                                TCATGGAAGTTAGGAGTCTGACATGGTTAAAGTTTATGCCCCGGCTTCCAGTGCCAATATGAGCGTCGGGTTTGATGTGCTCGGGGCGGCGGTGACACCTGTTGATGGTGCATTGCTCGGAGATGTAGTCACGGT  >  REL606/2778‑2912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑