| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 3 (0.080) | 53 (1.440) | 40/146 | 0.0 | 97.3% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 0 (0.000) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGA > REL606/1733214‑1733362 | tcgctGATACCTGGTCTGACCTTTACCATCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTGGCGGTaa < 2:770421/73‑1 (MQ=255) gtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtntgaacgtat > 1:31219‑M1/70‑76 (MQ=255) gtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtat > 2:626615‑M1/70‑76 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg > 1:705729‑M1/69‑76 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 2:405504‑M1/8‑1 (MQ=255) tcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatg < 2:79248‑M1/8‑1 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:648798/76‑1 (MQ=255) tagacctttacttncaccactgatgaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga > 1:162685‑M1/68‑76 (MQ=255) cagacctttactttcactactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga > 1:128136‑M1/68‑76 (MQ=255) aatacctttacttncaccactgattaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgtatga > 1:162682‑M1/68‑76 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg > 1:596412‑M1/66‑76 (MQ=255) gacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAg < 2:345334‑M1/11‑1 (MQ=255) acctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAgg < 1:950856‑M1/12‑1 (MQ=255) ctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGtt < 1:387758‑M1/14‑1 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTNTGaacgtat > 1:31219‑M2/1‑69 (MQ=255) gTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtat > 2:626615‑M2/1‑69 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 1:925636‑M1/16‑1 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:79248‑M2/76‑9 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg > 1:705729‑M2/1‑68 (MQ=255) tCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatg < 2:405504‑M2/76‑9 (MQ=255) tagACCTTTACTTNCACCACTGATGAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga > 1:162685‑M2/2‑67 (MQ=255) cAGACCTTTACTTTCACTACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga > 1:128136‑M2/1‑67 (MQ=255) aatacctTTACTTNCACCACTGATTAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatga > 1:162682‑M2/4‑67 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 2:1178718‑M1/18‑1 (MQ=255) gACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag < 2:345334‑M2/76‑12 (MQ=255) gACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaag > 1:596412‑M2/1‑65 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact > 1:292067‑M1/58‑76 (MQ=255) aCCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaagg < 1:950856‑M2/76‑13 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 1:1185692‑M1/56‑76 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac < 2:726334‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac < 1:474380‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactac > 2:218239‑M1/56‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:1010526‑M1/55‑76 (MQ=255) cTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtt < 1:387758‑M2/76‑15 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc < 1:925636‑M2/76‑17 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 2:1178718‑M2/76‑19 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact > 1:292067‑M2/1‑57 (MQ=255) actgataaatctgttatcggcaacatcgaaaaggttgcgannacgtatgAACNNACGAAGGTTTCACTACTGACct < 1:1087929‑M1/27‑1 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 2:726334‑M2/76‑22 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 2:218239‑M2/1‑55 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac < 1:474380‑M2/76‑22 (MQ=255) ttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactac > 1:1185692‑M2/1‑55 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:1010526‑M2/1‑54 (MQ=255) ataaatatgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtct < 2:17764‑M1/31‑1 (MQ=255) aatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGtt < 1:492670‑M1/34‑1 (MQ=255) atctgttatcggcaacagcgaaatggtcgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGACTGTTg < 1:1196984‑M1/35‑1 (MQ=255) acTGATAAATCTGTTATCGGCAACATCGAAAAGGTTGCGANNACGTATGaacnnacgaaggtttcactactgacct < 1:1087929‑M2/76‑28 (MQ=255) tctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTgg > 1:792138‑M1/41‑76 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 1:790373‑M1/37‑1 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc > 1:416047‑M1/40‑76 (MQ=255) gttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCaa > 2:1179772‑M1/38‑76 (MQ=255) aTAAATATGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtct < 2:17764‑M2/76‑32 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 1:999623‑M1/40‑1 (MQ=255) aaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtt < 1:492670‑M2/76‑35 (MQ=255) tcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACAcc < 1:532733‑M1/43‑1 (MQ=255) aTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTCGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgactgttg < 1:1196984‑M2/76‑36 (MQ=255) tCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttgg > 1:792138‑M2/1‑40 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc > 1:416047‑M2/1‑39 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc < 1:790373‑M2/76‑38 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 2:284688‑M1/46‑1 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa > 2:1179772‑M2/1‑37 (MQ=255) caacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATTAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc > 1:946761‑M1/30‑76 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 1:999623‑M2/76‑41 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 1:386846‑M1/48‑1 (MQ=255) acagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTg > 1:995055‑M1/28‑76 (MQ=255) cagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTgg > 1:532709‑M1/27‑76 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacacc < 1:532733‑M2/76‑44 (MQ=255) cgaaatggtcgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 1:41376‑M1/24‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 2:284688‑M2/76‑47 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtattaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac > 1:946761‑M2/1‑29 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 2:761071‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTCGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 1:1140667‑M1/55‑1 (MQ=255) aaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCCGTCGGCAACACCGTACTGGTTGAc < 1:1140657‑M1/55‑1 (MQ=255) aattgttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGgttgtcg > 1:249443‑M1/21‑73 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 1:386846‑M2/76‑49 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg > 1:662592‑M2/1‑27 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg > 1:995055‑M2/1‑27 (MQ=255) cAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactgg > 1:532709‑M2/1‑26 (MQ=255) ttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGt > 1:288481‑M1/16‑76 (MQ=255) cGAAATGGTCGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 1:41376‑M2/1‑23 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgac < 2:761071‑M2/76‑56 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgtcggcaacaccgtactggttgac < 1:1140667‑M2/76‑56 (MQ=255) aaaTGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtccgtcggcaacaccgtactggttgac < 1:1140657‑M2/76‑56 (MQ=255) aaTTGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgtcg > 1:249443‑M2/1‑20 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt < 1:720321‑M1/66‑1 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt > 1:220290‑M1/11‑76 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc > 2:888500‑M1/10‑76 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc > 1:854683‑M1/10‑76 (MQ=255) ttGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt > 1:288481‑M2/1‑15 (MQ=255) acgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCgg < 1:453113‑M1/69‑1 (MQ=255) cgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGt < 2:320240‑M1/70‑1 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa > 1:909118‑M1/6‑76 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa > 2:432581‑M1/6‑76 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATgg > 1:250091‑M1/3‑76 (MQ=255) tgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATgg > 1:526306‑M1/3‑76 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat > 1:220290‑M2/1‑10 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat < 1:720321‑M2/76‑67 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc > 1:854683‑M2/1‑9 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc > 2:888500‑M2/1‑9 (MQ=255) gAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGa > 2:265108‑M1/2‑76 (MQ=255) | TCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGA > REL606/1733214‑1733362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |