| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3026311 = | 83 (1.530) | 8 (0.160) | 3/140 | 6.3 | 9.3% | coding (492/1377 nt) | ECB_02826 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3026805 = | 79 (1.560) | intergenic (‑3/+206) | ECB_02826/ECB_02827 | hypothetical protein/Polysialic acid transport ATP‑binding KpsT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATGTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCCAC > REL606/3026236‑3026385 | aTGTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTaa < 2:352145/76‑1 (MQ=255)aTGTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTaa < 2:837994/76‑1 (MQ=255)aTGTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTaa < 2:1683850/76‑1 (MQ=255) gTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAAt < 1:321795/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCtt > 2:741725/1‑76 (MQ=255) aaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCttt > 2:623137/1‑76 (MQ=255) aaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTa < 1:1107153/76‑1 (MQ=255) atatatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAg > 2:492669/1‑76 (MQ=255) tatatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGa > 1:453269/1‑76 (MQ=255) atatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGat < 1:1064272/76‑1 (MQ=255) atatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGat > 2:702669/1‑76 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGata < 2:220799/76‑1 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGata < 2:93482/76‑1 (MQ=255) atGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGatat > 1:1592776/1‑76 (MQ=255) tGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTa > 2:560180/1‑76 (MQ=255) tAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACt > 1:707804/1‑76 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg > 1:74410/1‑76 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg < 1:1635404/76‑1 (MQ=255) atatTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGAt > 1:135330/1‑76 (MQ=255) atatTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGAt > 1:1445832/1‑76 (MQ=255) tattatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGAtt < 1:1495476/76‑1 (MQ=255) attatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTc > 2:480970/1‑76 (MQ=255) attatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTc > 2:480954/1‑76 (MQ=255) ttatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCa < 1:914980/76‑1 (MQ=255) tataTCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAg > 1:1205450/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa < 1:658681/76‑1 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa > 1:1011833/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa > 1:1090324/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa < 1:1020675/76‑1 (MQ=255) tatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGaa < 2:300680/76‑1 (MQ=255) tatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGaa > 2:1074995/1‑76 (MQ=255) atCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAAc > 2:1294765/1‑76 (MQ=255) cTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCt < 2:1182112/76‑1 (MQ=255) ttAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTg > 1:1072974/1‑76 (MQ=255) ttAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTg < 2:966013/76‑1 (MQ=255) agagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGtt > 2:302160/1‑76 (MQ=255) agagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGtt > 2:302137/1‑76 (MQ=255) agagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGtt > 2:1010449/1‑76 (MQ=255) gagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTc > 1:1102178/1‑76 (MQ=255) gagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTc > 1:1102193/1‑76 (MQ=255) gagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTc < 2:1095231/76‑1 (MQ=255) agTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTcc > 1:248613/1‑76 (MQ=255) gTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCa < 2:1558069/76‑1 (MQ=255) aTGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACt > 1:1295165/1‑76 (MQ=255) aTGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACt < 1:1077314/76‑1 (MQ=255) aTGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACt > 1:29875/1‑76 (MQ=255) aTCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGa > 2:1131378/1‑76 (MQ=255) aTCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGa > 2:1395816/1‑76 (MQ=255) cAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATg > 1:516023/1‑76 (MQ=255) aaaTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATgg > 2:437501/1‑76 (MQ=255) aaaTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATgg < 1:275223/76‑1 (MQ=255) aTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCANAACCTGTTCCACTGCGATGGCt < 2:227117/76‑1 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc > 1:92147/1‑76 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc < 1:1271007/76‑1 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc > 1:859051/1‑76 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc > 1:90439/1‑76 (MQ=255) aGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACttt < 2:641839/76‑1 (MQ=255) tATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGc > 1:1330031/1‑76 (MQ=255) aGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATac > 1:1720596/1‑76 (MQ=255) aaaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATacac > 2:1579532/1‑76 (MQ=255) aaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGNGATGGCTGACTTTGCATAcaca < 2:227152/76‑1 (MQ=255) aaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATAcaca < 2:1376325/76‑1 (MQ=255) aaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATAcaca < 1:1479884/76‑1 (MQ=255) aaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATAcaca < 2:1145434/76‑1 (MQ=255) aGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACaa > 1:1611893/1‑76 (MQ=255) aGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACaa > 1:135266/1‑76 (MQ=255) gATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAat > 2:115856/1‑76 (MQ=255) aTAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAata < 2:1195618/76‑1 (MQ=255) aTAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAata < 1:178059/76‑1 (MQ=255) aGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATc < 2:857279/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:943301/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:978127/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:892956/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:176660/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:681899/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:426079/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:1450570/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:1423354/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca > 2:1123208/1‑76 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcac > 1:1076910/1‑76 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcac < 1:1398497/76‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcac < 1:924745/76‑1 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcac < 1:486170/76‑1 (MQ=255) | ATGTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCCAC > REL606/3026236‑3026385 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |