| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 8 (0.220) | 28 (0.810) | 22/146 | 0.6 | 81.4% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 5 (0.140) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
AGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733222‑1733370 | ngCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATgga < 1:977485/75‑3 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg > 2:271482/1‑72 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:271482/72‑1 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGGGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt < 1:482866‑M2/76‑6 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt > 2:759992‑M2/1‑71 (MQ=255) tGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgt > 1:571718‑M2/1‑71 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:508038‑M1/18‑1 (MQ=255) caccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTg < 1:563490‑M1/23‑1 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaattggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa > 1:911439‑M1/53‑76 (MQ=255) accactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGa < 1:1021004‑M1/24‑1 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:508038‑M2/76‑19 (MQ=255) ctgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg < 1:751351‑M1/28‑1 (MQ=255) tgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgt > 2:508038‑M1/48‑76 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 1:574945‑M1/30‑1 (MQ=255) gataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtc < 2:782415‑M1/30‑1 (MQ=255) gataaatctgatatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGCCctgtc < 1:160442‑M1/30‑1 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg < 1:563490‑M2/76‑24 (MQ=255) 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cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 2:874543‑M1/24‑76 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 1:395345‑M2/76‑49 (MQ=255) aaCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtact < 2:89768‑M2/76‑49 (MQ=255) tttcgttaaggtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGt < 2:127566‑M1/61‑1 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 2:874543‑M2/1‑23 (MQ=255) cggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACCGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTg > 2:768982‑M1/13‑76 (MQ=255) gtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGAt < 2:807229‑M1/66‑1 (MQ=255) tttCGTTAAGGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt < 2:127566‑M2/76‑62 (MQ=255) cGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactaccgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctg > 2:768982‑M2/1‑12 (MQ=255) atgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg < 1:418131‑M1/73‑1 (MQ=255) gTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgat < 2:807229‑M2/76‑67 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa < 2:1115330‑M1/76‑1 (MQ=255) AACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGaa > 1:48716‑M1/1‑76 (MQ=255) cGTATGAAGGTTTCACTTCTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCCGTATGGAAGt > 1:169693/1‑76 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:304925/76‑1 (MQ=255) gTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGtt < 1:412344/76‑1 (MQ=255) tATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTa > 1:580307/1‑76 (MQ=255) atgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcggtatg < 1:418131‑M2/76‑74 (MQ=255) gAAGGTTTTACTACTGAACTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCg > 2:99136/1‑76 (MQ=255) | AGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAAGTTACCG > REL606/1733222‑1733370 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |