| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 1,733,297 | (CGTATGAA)1→2 | coding (333/1413 nt) | pykF → | pyruvate kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1733288 = | 8 (0.150) | 59 (1.100) | 43/146 | 0.2 | 90.9% | coding (324/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase |
| ? | REL606 | = 1733295 | 4 (0.070) | coding (331/1413 nt) | pykF | pyruvate kinase | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 | ttCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTa < 2:746788/76‑1 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 2:312104‑M1/1‑1 (MQ=255)aagctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatga < 1:1356029‑M1/1‑1 (MQ=255) tctcTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTaa < 1:1080579/76‑1 (MQ=255) tctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACg < 1:326591/76‑1 (MQ=255) ctggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacg < 1:1277752‑M1/4‑1 (MQ=255) tggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgt < 2:115357‑M1/5‑1 (MQ=255) ctGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGt > 2:787821/1‑76 (MQ=255) tGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTa > 2:969300/1‑76 (MQ=255) ggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 2:979978‑M1/71‑76 (MQ=255) ggtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgaacgta > 2:979976‑M1/71‑76 (MQ=255) gtcagacctttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggtttcggtaacgtatgaacgtat < 1:531623‑M1/7‑1 (MQ=255) gAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTAt > 1:1719388/1‑76 (MQ=255) aaaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATg < 1:1222732/76‑1 (MQ=255) aaGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGa < 1:1356029‑M2/76‑2 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:1277745‑M2/76‑5 (MQ=255) cTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacg < 1:1277752‑M2/76‑5 (MQ=255) ggTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgta > 2:979978‑M2/1‑70 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc < 2:1628485‑M1/16‑1 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:365183‑M1/61‑76 (MQ=255) ttactttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTc > 2:370323‑M1/61‑76 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:1176110‑M1/18‑1 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:635158‑M1/18‑1 (MQ=255) actttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCac < 1:420479‑M1/18‑1 (MQ=255) ctttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCact < 2:1190568‑M1/19‑1 (MQ=255) tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCacta < 1:678372‑M1/20‑1 (MQ=255) tttcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCacta > 1:918520‑M1/57‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:274613‑M1/55‑76 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact < 1:1152182‑M1/22‑1 (MQ=255) tcaccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCactact > 1:1341295‑M1/55‑76 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:365183‑M2/1‑60 (MQ=255) ttACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttc > 2:370323‑M2/1‑60 (MQ=255) ccactgataaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGAc < 2:493845‑M1/25‑1 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:635158‑M2/76‑19 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:1176110‑M2/76‑19 (MQ=255) aCTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcac < 1:420479‑M2/76‑19 (MQ=255) cTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcact < 2:1190568‑M2/76‑20 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 1:1425367‑M2/76‑21 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta < 1:678372‑M2/76‑21 (MQ=255) tttCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcacta > 1:918520‑M2/1‑56 (MQ=255) ctgataaatctgtgatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctg > 2:1160372‑M1/49‑76 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:1341295‑M2/1‑54 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact < 1:1152182‑M2/76‑23 (MQ=255) tCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactact > 1:274613‑M2/1‑54 (MQ=255) caccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactg > 2:740629‑M2/1‑53 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctg < 2:860357‑M1/32‑1 (MQ=255) taaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCAATACTGACctgtctg < 2:1056676‑M1/32‑1 (MQ=255) ccacTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgac < 2:493845‑M2/76‑26 (MQ=255) aaatctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACctgtctgt > 2:1279657‑M1/44‑76 (MQ=255) cTGATAAATCTGTGATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctg > 2:1160372‑M2/1‑48 (MQ=255) ctgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGc < 2:992520‑M1/37‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa < 2:189470‑M1/38‑1 (MQ=255) tgttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCa > 2:54079‑M1/39‑76 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 1:838796‑M1/40‑1 (MQ=255) ttatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAac < 2:1611556‑M1/40‑1 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctg < 2:860357‑M2/76‑33 (MQ=255) tAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcaatactgacctgtctg < 2:1056676‑M2/76‑33 (MQ=255) tatcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAaca < 1:712128‑M1/41‑1 (MQ=255) aaaTCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgt > 2:1279657‑M2/1‑43 (MQ=255) tcggcaacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACAcc > 1:1514126‑M1/34‑76 (MQ=255) cTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggc > 1:321916‑M2/1‑39 (MQ=255) tGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggca < 2:189470‑M2/76‑39 (MQ=255) gcaacagcgaaatggttgcgttaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTa < 1:634445‑M1/46‑1 (MQ=255) gTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaa < 2:490837‑M2/76‑40 (MQ=255) caacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTAc < 2:587863‑M1/47‑1 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:1611556‑M2/76‑41 (MQ=255) ttATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaac < 2:1579842‑M2/76‑41 (MQ=255) aacagcgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACt < 1:1313639‑M1/48‑1 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 2:1188147‑M2/76‑42 (MQ=255) tATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaaca < 1:712128‑M2/76‑42 (MQ=255) tCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacacc > 1:1514126‑M2/1‑33 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg < 1:515254‑M1/53‑1 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 1:1035279‑M1/24‑76 (MQ=255) cgaaatggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTg > 1:923089‑M1/24‑76 (MQ=255) gCAACAGCGAAATGGTTGCGTTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgta < 1:634445‑M2/76‑47 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac < 2:587863‑M2/76‑48 (MQ=255) cAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtac < 1:656325‑M2/76‑48 (MQ=255) aCAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactg > 1:115357‑M2/1‑27 (MQ=255) ggttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATg > 2:1176110‑M1/18‑76 (MQ=255) ttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGt < 2:1278713‑M1/61‑1 (MQ=255) ttgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGt > 1:1588649‑M1/16‑76 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 1:1035279‑M2/1‑23 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg > 1:923089‑M2/1‑23 (MQ=255) cGAAATGGTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttg < 1:515254‑M2/76‑54 (MQ=255) tgcggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTc < 2:83780‑M1/62‑1 (MQ=255) ggtaacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGa < 1:1524107‑M1/65‑1 (MQ=255) taacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATc < 1:1147485‑M1/67‑1 (MQ=255) ggTTGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatg > 2:1176110‑M2/1‑17 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 2:1558073‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 1:699036‑M1/68‑1 (MQ=255) aacgtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCAGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCg < 2:650934‑M1/68‑1 (MQ=255) ttGCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggt > 1:1588649‑M2/1‑15 (MQ=255) gtatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTa < 1:251227‑M1/71‑1 (MQ=255) gCGGTAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtct > 1:515187‑M2/1‑13 (MQ=255) tatgAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTAt < 1:1111167‑M1/72‑1 (MQ=255) attAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATg > 1:1611682/3‑76 (MQ=255) tAACGTATGaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatc < 1:1147485‑M2/76‑68 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 2:1054614‑M2/76‑69 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtctgttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 2:1558073‑M2/76‑69 (MQ=255) aacgtatgaacgtatgaaggtttcactactgacctgtcagttggcaacaccgtactggttgacgatggtctgatcg < 2:650934‑M2/76‑69 (MQ=255) | TTCTCTGAAAGCTGGTCAGACCTTTACTTTCACCACTGATAAATCTGTTATCGGCAACAGCGAAATGGTTGCGGTAACGTATGAAGGTTTCACTACTGACCTGTCTGTTGGCAACACCGTACTGGTTGACGATGGTCTGATCGGTATGGAA > REL606/1733213‑1733363 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |