| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3026311 = | 118 (1.680) | 3 (0.050) | 3/140 | 8.3 | 3.0% | coding (492/1377 nt) | ECB_02826 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3026805 = | 87 (1.330) | intergenic (‑3/+206) | ECB_02826/ECB_02827 | hypothetical protein/Polysialic acid transport ATP‑binding KpsT | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
GTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCCACA > REL606/3026238‑3026386 | gTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAAt < 1:1224580/76‑1 (MQ=255) tCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAAtt < 2:1900814/76‑1 (MQ=255) ccTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTg > 2:1234855/1‑76 (MQ=255) ccTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTg > 1:1574809/1‑76 (MQ=255) cTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGc > 2:1086190/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCtt > 2:1322931/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCtt > 2:2169629/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCtt < 2:2112992/76‑1 (MQ=255) aaaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCttt < 1:636532/76‑1 (MQ=255) aaaTATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTa > 2:497207/1‑76 (MQ=255) atatatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAg < 1:1031052/76‑1 (MQ=255) atatatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAg > 1:1320071/1‑76 (MQ=255) tatatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGa > 1:1672156/1‑76 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGtta < 1:1607664/76‑1 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGata < 2:1196751/76‑1 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGata < 2:72980/76‑1 (MQ=255) tatGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGata > 2:2028927/1‑76 (MQ=255) atGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGatat < 1:1736573/76‑1 (MQ=255) ttGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGt > 2:1203733/1‑76 (MQ=255) ttGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGt > 1:797910/1‑76 (MQ=255) tGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTa > 1:787369/1‑76 (MQ=255) ggTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTaa > 1:456235/1‑76 (MQ=255) gTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAAc > 2:876815/1‑76 (MQ=255) gTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAAc > 1:30468/1‑76 (MQ=255) tAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTATCt < 1:1591686/76‑1 (MQ=255) tAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACt < 1:1591709/76‑1 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAAGTg < 2:1491972/76‑1 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg < 2:1771965/76‑1 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg > 1:1369623/1‑76 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg > 2:1929811/1‑76 (MQ=255) aaaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTg > 2:1847914/1‑76 (MQ=255) aaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGa > 2:426545/1‑76 (MQ=255) aaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGa > 1:1585729/1‑76 (MQ=255) aaTATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGa < 1:1562241/76‑1 (MQ=255) atatTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGAt > 1:896556/1‑76 (MQ=255) tattatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGAtt < 2:1832981/76‑1 (MQ=255) attatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTc > 1:2105983/1‑76 (MQ=255) attatATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTc > 1:1947223/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa > 2:1891987/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa > 1:2116052/1‑76 (MQ=255) atatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGa < 2:728131/76‑1 (MQ=255) tatCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGaa > 1:1485938/1‑76 (MQ=255) atCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAAc < 1:2240093/76‑1 (MQ=255) atCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAAc > 1:504909/1‑76 (MQ=255) tCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAAcc < 2:750150/76‑1 (MQ=255) cTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCt > 1:1471004/1‑76 (MQ=255) cTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCt > 1:636382/1‑76 (MQ=255) ttAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTACTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTg > 1:327978/1‑76 (MQ=255) tAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGt > 2:152087/1‑76 (MQ=255) agagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGtt < 2:1542003/76‑1 (MQ=255) agagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGtt < 2:1564862/76‑1 (MQ=255) gagTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTc < 1:854315/76‑1 (MQ=255) agTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTcc < 1:49624/76‑1 (MQ=255) agTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTcc > 1:1206513/1‑76 (MQ=255) acnaTGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTcc > 2:1587806/4‑76 (MQ=255) gTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCa < 1:925620/76‑1 (MQ=255) tGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTg > 1:595028/1‑76 (MQ=255) cAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATg < 2:1258973/76‑1 (MQ=255) cAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATg < 1:30838/76‑1 (MQ=255) cAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATg < 2:611529/76‑1 (MQ=255) cAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATg < 1:1220647/76‑1 (MQ=255) aaaTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATgg > 2:590020/1‑76 (MQ=255) aaaTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATgg > 1:1179452/1‑76 (MQ=255) aaTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGc > 1:33416/1‑76 (MQ=255) aTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCt < 2:900859/76‑1 (MQ=255) aTTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCt < 2:1698347/76‑1 (MQ=255) ttACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTg < 2:1252225/76‑1 (MQ=255) tACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGa > 2:2180592/1‑76 (MQ=255) tACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGa < 2:896556/76‑1 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc > 2:1964857/1‑76 (MQ=255) aCCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGAc > 1:1043949/1‑76 (MQ=255) aGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACttt > 1:204594/1‑76 (MQ=255) aGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACttt < 2:1946495/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg < 2:675034/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg < 2:2192393/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg < 2:504909/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg < 2:1070736/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg < 1:1143760/76‑1 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg > 1:1817541/1‑76 (MQ=255) gTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTg > 1:1838598/1‑76 (MQ=255) tATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGc > 2:32735/1‑76 (MQ=255) aTTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCa > 1:675781/1‑76 (MQ=255) ttAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCAt > 2:1093556/1‑76 (MQ=255) tAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATa > 2:1543111/1‑76 (MQ=255) tAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATa > 1:123416/1‑76 (MQ=255) aaaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATacac > 2:1785909/1‑76 (MQ=255) aaGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATAcaca > 2:754972/1‑76 (MQ=255) aGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACaa > 2:1838955/1‑76 (MQ=255) aGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACaa < 2:239081/76‑1 (MQ=255) tAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAatat < 1:1038057/76‑1 (MQ=255) gTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGATTTTGCATACACAATATcc > 1:666971/1‑76 (MQ=255) gTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATcc > 1:459086/1‑76 (MQ=255) gTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATcc > 1:478725/1‑76 (MQ=255) gTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATcc > 1:1494845/1‑76 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 1:2103730/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca < 2:1666954/76‑1 (MQ=255) tAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCca > 1:1068900/1‑76 (MQ=255) aaaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcac > 2:1256092/1‑76 (MQ=255) aaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcaca > 2:2163110/1‑76 (MQ=255) aaTTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCcaca > 2:1912278/1‑76 (MQ=255) | GTCCTAAAAATATATGTTGGTAAATATTATATCTTAGAGTATGAATCAAATTACCAGTATTAGAAAGATAGTAAATTGCTTTAAGATATGGTAACTGATTCAGAACCTGTTCCACTGCGATGGCTGACTTTGCATACACAATATCCACA > REL606/3026238‑3026386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |