Missing coverage evidence... | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
* | * | ÷ | REL606 | 589608–590469 | 593379 | 2911–3772 | 23 [20] | [20] 21 | [insK‑1]–[fepA] | [insK‑1],[insB‑7],insA‑7,insK‑1,hokE,insL‑3,entD,[fepA] |
CGGAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC > REL606/589532‑589627 | cGGAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 2:960327/76‑1 (MQ=255) cGGAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa < 2:1340899/76‑1 (MQ=255) cGGAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGa > 1:899590/1‑76 (MQ=255) ggAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGAc < 2:312333/76‑1 (MQ=255) gAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACt > 1:605335/1‑76 (MQ=255) aaaGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 1:515738/1‑76 (MQ=255) aaaGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 2:1503394/1‑76 (MQ=255) aaaGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACtt > 2:1023412/1‑76 (MQ=255) aGACCAGTGATGAAGATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 2:1919241/76‑1 (MQ=255) aGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTg < 2:1168312/76‑1 (MQ=255) gACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt < 2:1619097/76‑1 (MQ=255) gACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:735034/1‑76 (MQ=255) gACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGt > 1:1435311/1‑76 (MQ=255) aCCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc > 2:180722/1‑76 (MQ=255) aCCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc < 2:1852563/76‑1 (MQ=255) aCCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTc > 2:808103/1‑76 (MQ=255) cAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:1022108/76‑1 (MQ=255) cAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:81293/76‑1 (MQ=255) cAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCAt < 1:1670883/76‑1 (MQ=255) aGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATg < 1:747947/76‑1 (MQ=255) gaACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTc > 2:1661656/1‑76 (MQ=38) aTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc > 2:1116192/1‑76 (MQ=31) aTGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAcc > 2:286887/1‑76 (MQ=31) | CGGAAAGACCAGTGATGAACATGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACC > REL606/589532‑589627 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |