| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 1,875,483 | 0 | G | C | 32.7% | 203.8 / 108.2 | 113 | intergenic (+156/‑28) | yeaB/sdaA | predicted NUDIX hydrolase/L‑serine deaminase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/37); new base C (37/0); total (76/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.39e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCT > REL606/1875408‑1875558 | tAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAg < 2:1474172/76‑1 (MQ=255) aaTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGt < 2:34996/76‑1 (MQ=255) aaTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGt > 2:192813/1‑76 (MQ=255) aaTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGt > 1:2023373/1‑76 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTc > 1:794632/1‑76 (MQ=255) ttCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTcc > 1:166712/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:192334/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:128172/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:1945806/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTTGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:251516/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAg > 1:280618/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAg > 1:26913/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:949717/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:681727/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:1196135/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:1609568/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTAAACTATGCGCTGTTATTAGTTTGTTTCTGGAACTCCAg > 1:1358300/1‑76 (MQ=255) aTGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGt > 1:489225/1‑76 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTcc > 1:219679/1‑75 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:738668/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAc > 2:1285901/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAc > 2:1838797/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:1808298/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:801017/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:1143220/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:961336/1‑76 (MQ=255) ngAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:1957623/2‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:1493329/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:1828673/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:1388753/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:141529/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCt < 1:1316722/76‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:951381/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCtt < 2:1446115/76‑1 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTg > 1:1065556/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTg > 1:1248611/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTg > 1:1091484/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTg > 1:1450164/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTg > 1:1468320/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCAAGTCACCTTg > 1:416773/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCCTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCCCCTTg > 1:1682630/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTGGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGt > 1:420320/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGt < 1:1100006/76‑1 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGt > 1:1385810/1‑76 (MQ=255) gTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGta > 1:154133/1‑75 (MQ=255) gTTAAGCCAGTCGCCGCGCTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGta > 1:1403235/1‑75 (MQ=255) ttAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCa > 1:1140078/1‑76 (MQ=255) ttAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaa > 1:489273/1‑74 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGGACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:1064340/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:2025149/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:807516/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:1100707/1‑73 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg < 1:1923084/76‑1 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 1:740367/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 2:580450/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg < 1:1283871/76‑1 (MQ=255) aGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGa < 2:1714573/76‑1 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat < 1:891735/76‑1 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat > 1:57347/1‑76 (MQ=255) tCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtatta < 1:638460/76‑1 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat > 1:60655/1‑76 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat > 1:1844336/1‑76 (MQ=255) gccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATc < 2:181090/76‑1 (MQ=255) cgcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGt < 1:125695/76‑1 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg < 2:538606/76‑1 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg > 1:1732498/1‑76 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg < 2:1318317/76‑1 (MQ=255) gTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAt > 1:721352/1‑76 (MQ=255) gTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAt > 1:1755591/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 2:603112/1‑76 (MQ=255) ccTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGt > 1:333573/1‑76 (MQ=255) ccTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGGCCAGTCACCTTGTCAGGGGGATTATCGTGATTAGt > 1:333583/1‑76 (MQ=255) tctTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCt > 1:1938967/1‑76 (MQ=255) ctTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTa < 2:297429/76‑1 (MQ=255) ttACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAt < 1:1550566/76‑1 (MQ=255) ttACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAt < 2:809126/76‑1 (MQ=255) acacTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTc < 1:1841111/76‑1 (MQ=255) acacTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTc < 2:1140078/76‑1 (MQ=255) acacTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTc < 1:1465859/76‑1 (MQ=255) cacTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCg < 2:144644/76‑1 (MQ=255) cTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGAc < 2:885388/76‑1 (MQ=255) tATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACa < 1:1019925/76‑1 (MQ=255) tGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATg > 1:1777487/1‑76 (MQ=255) gcgcTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGt < 1:716643/76‑1 (MQ=255) cgcTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGtt > 2:1016019/1‑76 (MQ=255) gcTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGttt < 2:280443/76‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGGAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 2:1689293/76‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa > 1:1089724/1‑76 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa > 1:436430/1‑76 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 1:1830046/76‑1 (MQ=255) tattaGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGt < 2:663973/76‑1 (MQ=255) taGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTggg > 1:678086/1‑76 (MQ=255) gTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGa > 1:310349/1‑76 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |