Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC | REL606 | 474,608 | (GCCAGC)2→1 | coding (693‑698/1677 nt) | ybaL ← | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 474607 = | 1 (0.020) | 50 (0.880) | 36/136 | 0.5 | 98.1% | coding (699/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
? | REL606 | = 474600 | 1 (0.020) | coding (706/1677 nt) | ybaL | predicted transporter with NAD(P)‑binding Rossmann‑fold domain |
GTCGCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/474686‑474607 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggcgTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTTGCCGGGATGGTA < REL606/474600‑474526 GTCGCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCg > 2:18221/1‑75 GTCGCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCT < 2:978067/76‑1 TCGCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTG < 1:776768/76‑1 GCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGC < 2:1277418/76‑1 GCCGGCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGC < 2:1149885/76‑1 CGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGT < 1:989728/76‑1 CGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGT < 1:108723/76‑1 GTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTT < 2:1838016/76‑1 GTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTT < 2:1010470/76‑1 CTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAG > 1:615465/1‑76 CTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAG > 2:548970/1‑76 TGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGG < 2:844482/76‑1 TGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGG < 2:1610279/76‑1 TGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGG < 2:1344606/76‑1 GCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTT < 1:282053/76‑1 GCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTT > 1:602559/1‑76 GCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTT > 1:1672286/1‑76 GCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTT > 1:926225/1‑76 TGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGCGCTGGCGTTAGGGGGGGCCT > 1:752309/1‑76 GGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGGGCTGGCGTTAGGGGGTGGCTT > 2:622095/1‑76 GATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTT < 1:147652/76‑1 ATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTG < 2:45374/76‑1 GGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCG > 1:138155/1‑76 CACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGT > 1:1518987/1‑76 ACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTA < 1:1478368/76‑1 CGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGgcg > 1:828375/1‑73 AGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGC > 1:312376/1‑76 CGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTG < 1:349365/76‑1 CGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTG < 2:79612/76‑1 CGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTT < 2:312117/76‑1 CAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGA > 1:1769355/1‑76 AACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGAT > 2:1465649/1‑76 AACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGAT < 2:438509/76‑1 CCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGT < 2:45967/76‑1 TCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCT < 2:59136/76‑1 CTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTT < 2:869862/76‑1 CTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTT < 1:1234562/76‑1 CTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTT < 2:26955/76‑1 CTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTT < 1:1777007/76‑1 TCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTT < 2:782815/76‑1 GCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTTGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGC < 1:1501312/76‑1 CGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCA < 2:1064242/76‑1 GAGCTGTTTACCCTGTCAGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCAC > 2:26413/1‑76 CTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCG < 1:576410/76‑1 TGTTCACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGG > 2:465878/1‑76 TTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTG < 1:1748714/76‑1 TTTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTG > 2:1342065/1‑76 TTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGC > 2:212037/1‑76 TTACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGC > 2:615265/1‑76 TACCCTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCG > 2:498038/1‑76 CTGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCT > 2:325858/1‑76 TGTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTT < 2:458076/76‑1 GTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTT < 2:1017415/76‑1 GTCGGTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTT < 2:1881527/76‑1 GTGCTGGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTTGCCG < 2:1697533/76‑1 GGCGTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTTGCCGGGATG < 1:175019/76‑1 GTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTTGCCGGGATGGTA > 2:1071402/1‑76 GTCGCCGTCTGGTGCCGTGGATTATGGCACGCAGCGCGGCAACCGGTTCTCGCGAGCTGTTTACCCTGTCGGTGCTGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < REL606/474686‑474607 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gctggcgTTAGGGGTTGCCTTTGGTGCGGTAGAGCTGTTTGATGTCTCCTTTGCACTCGGTGCGTTCTTTGCCGGGATGGTA < REL606/474600‑474526 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |