| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 891259 | 102 (1.570) | 5 (0.080) | 4/142 | 7.8 | 5.2% | coding (282/963 nt) | ECB_00831 | protein similar to RNA‑directed DNA polymerase from retron EC86 |
| ? | REL606 | = 891492 | 85 (1.390) | coding (515/963 nt) | ECB_00831 | protein similar to RNA‑directed DNA polymerase from retron EC86 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGTTTTGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGCCG > REL606/891418‑891566 | aGTTTTGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGctaatcta < 1:1817224/76‑1 (MQ=255)aGTTTTGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGctaatcta < 2:1465615/76‑1 (MQ=255) ttttGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGctaatctaat < 2:1198571/76‑1 (MQ=255) tttGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAata > 2:1707501/1‑76 (MQ=255) ttGACAAACATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTaatataatat > 2:579019/1‑76 (MQ=255) tGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATg > 2:1313359/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCt > 2:1793003/1‑76 (MQ=255) aaaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCt < 1:243497/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCt < 2:786384/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCt < 1:1459362/76‑1 (MQ=255) aaaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCt < 1:1459357/76‑1 (MQ=255) aaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTa < 2:146700/76‑1 (MQ=255) aaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTa < 2:1502197/76‑1 (MQ=255) aaaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTa < 2:1665742/76‑1 (MQ=255) aaaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTaa < 1:1012119/76‑1 (MQ=255) aaTATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTaaa < 1:121085/76‑1 (MQ=255) atGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACtt > 1:2091500/1‑76 (MQ=255) tgttgtTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTg < 1:170159/76‑1 (MQ=255) gttgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGa < 1:1578291/76‑1 (MQ=255) gttgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGa < 1:1098083/76‑1 (MQ=255) ttgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAt > 1:1854438/1‑76 (MQ=255) ttgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAt > 2:1952581/1‑76 (MQ=255) tgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAtt < 1:813216/76‑1 (MQ=255) tgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAtt > 1:1996631/1‑76 (MQ=255) tgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAtt > 1:762484/1‑76 (MQ=255) tgttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGAtt > 1:1601003/1‑76 (MQ=255) ttATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTAt > 1:1770837/1‑76 (MQ=255) tataAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATc < 2:1343717/76‑1 (MQ=255) ataAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCg < 1:379311/76‑1 (MQ=255) ataAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCg > 2:2095692/1‑76 (MQ=255) taAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGt < 2:291378/76‑1 (MQ=255) taAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGt > 1:1168330/1‑76 (MQ=255) taAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGt < 1:200354/76‑1 (MQ=255) aaaaaTCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTa > 1:303706/1‑76 (MQ=255) aaaaaTCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTa > 2:1971913/1‑76 (MQ=255) aaaTCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTAtt < 1:1897127/76‑1 (MQ=255) aaTCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTAtta < 2:297919/76‑2 (MQ=255) aaTCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTc < 1:1818656/76‑1 (MQ=255) cTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAgg > 2:378465/1‑76 (MQ=255) tGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAggg < 1:1107243/76‑1 (MQ=255) cTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGtt > 1:201494/1‑76 (MQ=255) cTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGtt < 1:963117/76‑1 (MQ=255) tACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTa > 2:1836869/1‑76 (MQ=255) tACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTa > 2:1903727/1‑76 (MQ=255) aCCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTAt < 2:795141/76‑1 (MQ=255) aCCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTAt > 2:1300126/1‑76 (MQ=255) aCCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTAt > 2:1559904/1‑76 (MQ=255) aCCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTAt > 2:1381585/1‑76 (MQ=255) ccACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATg < 2:1546572/76‑1 (MQ=255) cacaAGGTGCTCCATTATCGCCTAAATTGGCTAATGTACTATGTTCCAAACTTGGTTATTGTATTCAGGGTTCTGc > 2:719466/1‑76 (MQ=255) cacaAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGc < 2:1181426/76‑1 (MQ=255) cacaAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGc < 1:1644856/76‑1 (MQ=255) cacaAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGc < 1:1140813/76‑1 (MQ=255) acaAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCa > 2:643503/1‑76 (MQ=255) aaGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAgg > 2:136789/1‑76 (MQ=255) aaGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAgg < 1:847616/76‑1 (MQ=255) aGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGt < 2:1922623/76‑1 (MQ=255) aGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGt < 2:1644639/76‑1 (MQ=255) aGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGt < 2:512433/76‑1 (MQ=255) aGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGt < 2:1922610/76‑1 (MQ=255) gTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAg < 1:482539/76‑1 (MQ=255) gTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAg > 2:689366/1‑76 (MQ=255) gTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGCTATGCAGGTAg > 2:1292727/1‑76 (MQ=255) tGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGt > 1:366383/1‑76 (MQ=255) gCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTc < 1:776723/76‑1 (MQ=255) cTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCg < 1:1052486/76‑1 (MQ=255) cTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCg < 1:1033250/76‑1 (MQ=255) catcatCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCgggg < 1:1924923/76‑1 (MQ=255) atcatcACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGc > 2:1841814/1‑76 (MQ=255) atcatcACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGc > 2:1444626/1‑76 (MQ=255) tcatcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCt > 2:1770773/1‑76 (MQ=255) catcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCtt > 1:1793016/1‑76 (MQ=255) catcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCtt < 1:1787827/76‑1 (MQ=255) atcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTg < 2:9204/76‑1 (MQ=255) atcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTg < 2:1973000/76‑1 (MQ=255) atcaCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTg < 2:1320510/76‑1 (MQ=255) caCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGat > 1:1768737/1‑76 (MQ=255) aCCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGata > 2:298268/1‑76 (MQ=255) ccTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGatat > 2:561474/1‑76 (MQ=255) ccTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGatat > 2:1264856/1‑76 (MQ=255) cTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGatata > 2:263517/1‑76 (MQ=255) tAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGatatat < 1:303568/76‑1 (MQ=255) aaaTTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGAtatata < 1:1202989/76‑1 (MQ=255) aTTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACg > 2:472500/1‑76 (MQ=255) taatctaatATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGatat > 2:846283/1‑76 (MQ=255) tctaatATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGcc > 1:990250/1‑76 (MQ=255) tctaatATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGcc > 1:375798/1‑76 (MQ=255) ctaatATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGCCg > 2:769342/1‑76 (MQ=255) ctaatATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGCCg > 1:1549718/1‑76 (MQ=255) | AGTTTTGACAAAAATATGTTGTTATAAAAATCTGCTACCACAAGGTGCTCCATCATCACCTAAATTAGCTAATCTAATATGTTCTAAACTTGATTATCGTATTCAGGGTTATGCAGGTAGTCGGGGCTTGATATATACGAGATATGCCG > REL606/891418‑891566 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |