| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 1219498 = | 70 (1.080) | 5 (0.080) | 5/138 | 7.1 | 6.9% | intergenic (+136/‑264) | ymgF/ycgH | hypothetical protein/predicted protein; b4491 |
| ? | REL606 | 1219720 = | 71 (1.190) | intergenic (+358/‑42) | ymgF/ycgH | hypothetical protein/predicted protein; b4491 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTTAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGTTTGG > REL606/1219650‑1219795 | aTTTAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAg > 2:1807350/1‑76 (MQ=255)aTTTAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAg > 2:1807369/1‑76 (MQ=255) tttAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAgg > 1:24805/1‑76 (MQ=255) tttAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAgg > 1:1254708/1‑76 (MQ=255) tttAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAgg < 1:1489238/76‑1 (MQ=255) ttAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGa > 1:628624/1‑76 (MQ=255) ttAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGa > 1:1686335/1‑76 (MQ=255) aTTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgt < 1:312297/76‑1 (MQ=255) ttttttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtt < 2:1533/76‑1 (MQ=255) tttttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgttt < 1:933947/76‑1 (MQ=255) ttttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttg < 2:262736/76‑1 (MQ=255) ttttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttg > 1:2042851/1‑76 (MQ=255) ttttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttg > 2:1307781/1‑76 (MQ=255) tttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttgt < 1:1605298/76‑1 (MQ=255) ttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttgtt > 1:1483576/1‑76 (MQ=255) ttGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAAtgtttgtt > 1:1483562/1‑76 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa < 1:285889/76‑1 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa > 1:364594/1‑76 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa < 1:1867476/76‑1 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa > 2:1088357/1‑76 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa > 2:1224953/1‑76 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa < 1:1069688/76‑1 (MQ=255) tgtgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTa < 2:25603/76‑1 (MQ=255) gtgCTTTTGTTTTTGTCTTTCCCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTaa < 1:1358406/76‑1 (MQ=255) tgCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAAt < 1:172404/76‑1 (MQ=255) tgCTTTTGTTTTAATCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAAt > 1:771740/1‑76 (MQ=255) gCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATc > 2:1948198/1‑76 (MQ=255) gCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATc > 1:1896821/1‑76 (MQ=255) cTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATcc > 1:637073/1‑76 (MQ=255) ttttgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCa < 2:1376034/76‑1 (MQ=255) ttttgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCa > 2:1436598/1‑76 (MQ=255) ttttgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCa > 1:741044/1‑76 (MQ=255) ttttgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCa > 1:1975323/1‑76 (MQ=255) ttgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaat > 1:526903/1‑76 (MQ=255) tgtttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatg > 2:1075020/1‑76 (MQ=255) tttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaa < 1:383978/76‑1 (MQ=255) ttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaat < 1:847078/76‑1 (MQ=255) ttttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaat > 2:93265/1‑76 (MQ=255) tttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaatg < 1:1723099/76‑1 (MQ=255) tttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaatg > 1:185902/1‑76 (MQ=255) tttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCaatgaatg < 1:1608886/76‑1 (MQ=255) ttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatgg > 2:216432/1‑76 (MQ=255) ttgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatgg > 1:1518397/1‑76 (MQ=255) tgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatgga > 1:500758/1‑76 (MQ=255) tgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatgga < 1:1780789/76‑1 (MQ=255) tgtCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatgga < 1:2072036/76‑1 (MQ=255) cTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatggatgg > 1:1305375/1‑76 (MQ=255) cTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatggatgg > 1:586990/1‑76 (MQ=255) cTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAatggatgg > 1:343487/1‑76 (MQ=255) attACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGt > 2:354728/2‑76 (MQ=255) ttACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGtt > 1:1252473/1‑76 (MQ=255) ttACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGtt > 2:242478/1‑76 (MQ=255) cccTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAAt < 1:694076/76‑1 (MQ=255) ccTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATc < 1:1805563/76‑1 (MQ=255) cTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCt < 1:1052717/76‑1 (MQ=255) cTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCt < 1:1923849/76‑1 (MQ=255) tCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTa < 1:224476/76‑1 (MQ=255) cGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATg < 2:221881/76‑1 (MQ=255) gTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGa < 2:1749171/76‑1 (MQ=255) ttttGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGaa > 1:44699/1‑76 (MQ=255) tGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACt > 1:523139/1‑76 (MQ=255) ggTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTg > 1:740955/1‑76 (MQ=255) ggTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTg > 1:740963/1‑76 (MQ=255) ggTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTg < 2:2092377/76‑1 (MQ=255) gTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGa > 2:608089/1‑76 (MQ=255) tCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGaaaaa < 1:2041354/76‑1 (MQ=255) gAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACt > 2:2086608/1‑76 (MQ=255) cTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTccc < 2:2049313/76‑1 (MQ=255) tCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTcccc > 2:1239921/1‑76 (MQ=255) cATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCg > 1:1537006/1‑76 (MQ=255) ggTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGtt < 2:637073/76‑1 (MQ=255) ttATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTa < 1:726658/76‑1 (MQ=255) tATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAg > 2:1959927/1‑76 (MQ=255) aTTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGt < 2:1518397/76‑1 (MQ=255) aTTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGt > 2:1226939/1‑76 (MQ=255) tttGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTaaa > 1:718482/1‑42 (MQ=255) tttGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTaaa < 2:718482/43‑2 (MQ=255) tttGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGtt < 2:523139/76‑1 (MQ=255) gACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGTTTgg < 2:2031926/76‑1 (MQ=255) gACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGTTTgg < 2:1953826/76‑1 (MQ=255) | ATTTAAATTTTTTGTGCTTTTGTTTTTGTCTTTACCCTCCGTTTTGGTAATCTGAGCTCATAGGTTATTTGACCAGGAATGTTTGTTAATCCAATGAATGGATGGTTAATCTATGAAACTGAAAAAACTCCCCGGGTTTAGTTTGG > REL606/1219650‑1219795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |