| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022392 = | 45 (0.920) | 14 (0.320) | 8/136 | 3.6 | 18.8% | coding (293/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022865 = | 80 (1.810) | intergenic (‑181/+393) | ECB_02821/ECB_02822 | hypothetical protein/bifunctional Ribulose 5‑phosphate reductase/CDP‑ribitol pyrophosphorylase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAC > REL606/3022790‑3022940 | cTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt > 1:242516/1‑76 (MQ=255)cTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTAtt > 1:242497/1‑76 (MQ=255) tttAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTc > 1:1388954/1‑76 (MQ=255) tAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCtt < 1:349621/76‑1 (MQ=255) aaCAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTta < 2:387269/76‑1 (MQ=255) aCAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaa < 1:349204/76‑1 (MQ=255) aCAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTtaa < 1:349216/76‑1 (MQ=255) ttATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaa < 1:243407/76‑1 (MQ=255) ttATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaa < 1:243395/76‑1 (MQ=255) ttATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaa < 1:243421/76‑1 (MQ=255) ttATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaa < 1:1257161/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 2:518436/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:1246487/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:659603/76‑1 (MQ=255) taAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATaaaaaa < 1:659624/76‑1 (MQ=255) aaaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAAt < 1:1352411/76‑1 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATg < 1:474929/76‑1 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATg < 1:474910/76‑1 (MQ=255) aaaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATg > 1:1525238/1‑76 (MQ=255) aaaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgt > 2:303971/1‑76 (MQ=255) aaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgta < 1:1086755/76‑1 (MQ=255) aaCACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgta < 1:971001/76‑1 (MQ=255) acacAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtag < 1:1206637/76‑1 (MQ=255) acacAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtag < 1:1495075/76‑1 (MQ=255) acacAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtag < 1:1495066/76‑1 (MQ=255) acacAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtag < 1:1206634/76‑1 (MQ=255) acaAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATgtagta < 1:93677/76‑1 (MQ=255) aaaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaa < 1:436307/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 1:211786/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 1:1218984/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGCaaaa < 1:211807/76‑1 (MQ=255) aaCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCCTAATAAAAAATGTAGTaaaa < 1:211808/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 1:286064/76‑1 (MQ=255) aCCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAAt < 1:1036885/76‑1 (MQ=255) cAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCt < 1:1444299/76‑1 (MQ=255) tAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGt < 2:734482/76‑1 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa < 2:1259235/76‑1 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa < 1:414434/76‑1 (MQ=255) aaCTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTa > 1:431988/1‑76 (MQ=255) cTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaa < 1:924075/76‑1 (MQ=255) tATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaa > 2:441926/1‑76 (MQ=255) aTTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaaa > 1:117708/1‑76 (MQ=255) aTTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTaaaaa < 1:1401136/76‑1 (MQ=255) ggTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaata < 1:152077/76‑1 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa > 1:1102337/1‑76 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa > 1:1492456/1‑76 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa < 1:1070583/76‑1 (MQ=255) gTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataa < 1:477478/76‑1 (MQ=255) tGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaa > 1:110553/1‑76 (MQ=255) tGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaa < 1:1307050/76‑1 (MQ=255) gCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaat > 1:319550/1‑76 (MQ=255) cAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAAtt < 2:1067528/76‑1 (MQ=255) cAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAAtt < 2:1067523/76‑1 (MQ=255) aTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAaaataaataga < 2:1480459/76‑4 (MQ=255) aTTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAAttgc < 2:319550/76‑3 (MQ=255) tttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtat < 2:395279/76‑1 (MQ=255) tttATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTtat < 1:354444/76‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa < 1:575370/76‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa < 1:1030305/76‑1 (MQ=255) tATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATGCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATaa < 1:1030328/76‑1 (MQ=255) aTCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAAt > 1:1069886/1‑76 (MQ=255) aTCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAAt > 1:678332/1‑76 (MQ=255) aTCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAAt < 1:91643/76‑1 (MQ=255) aTCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAAt < 1:91660/76‑1 (MQ=255) tCTGGAGCAATGGTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATg < 1:90092/76‑1 (MQ=255) tCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATg < 1:819024/76‑1 (MQ=255) tCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATg < 1:777980/76‑1 (MQ=255) cAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATg > 2:552613/1‑76 (MQ=255) cAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATg < 1:499332/76‑1 (MQ=255) cAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATg > 2:483912/1‑76 (MQ=255) aTGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGa < 1:300486/76‑1 (MQ=255) cTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGaaaa < 1:166255/76‑1 (MQ=255) tATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTAGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAc < 1:447290/76‑1 (MQ=255) aTTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAAcc > 2:485175/1‑76 (MQ=255) tttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCt < 1:214739/76‑1 (MQ=255) tttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCt > 2:1162519/1‑76 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa > 1:971203/1‑76 (MQ=255) ttAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTa > 1:1459216/1‑76 (MQ=255) aaaaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaaa < 1:445099/76‑1 (MQ=255) aaaaTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTaaa < 1:1536008/76‑1 (MQ=255) aTCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGa < 1:494626/76‑1 (MQ=255) aTTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAatat > 1:517172/1‑76 (MQ=255) aTTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAatat > 1:98458/1‑76 (MQ=255) ttCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAAtata < 1:1179433/76‑1 (MQ=255) tCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAc < 2:1519722/76‑1 (MQ=255) | CTTTAACAATTATAAAAACACAAACCAATAACTATTGGTGCAATTTATCTGGAGCAATGCTATTTAAAATCTTATTCTTAATAAAAAATGTAGTAAAATCTTGTAAAAAATAAATTTATAATGCTTTATGGAAAACCTAAATGAAATATAC > REL606/3022790‑3022940 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |