| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | REL606 | 1,690,717 | +GT | coding (755/1503 nt) | ydgR → | putative tripeptide transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 1,690,714 | 1 | . | T | 100.0% | 184.8 / NA | 46 | V251? (GTT→GNT) | ydgR | putative tripeptide transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (23/23); total (23/23) | |||||||||||
| * | REL606 | 1,690,714 | 2 | . | G | 100.0% | 190.5 / NA | 46 | V251G (GTT→GGT) | ydgR | putative tripeptide transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base G (23/23); total (23/23) | |||||||||||
GGTGTTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGT‑‑TGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGTGCTGCGCGTCG > REL606/1690641‑1690780 || ggTGTTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTTCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tg > 1:1160180/1‑76 (MQ=255)ggTGTTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tg < 1:1896034/76‑1 (MQ=255) gtgtTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgt < 2:336011/76‑1 (MQ=255) gtgtTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgt < 2:1144855/76‑1 (MQ=255) tgttgtGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgtg < 2:61637/76‑2 (MQ=255) tgttgtGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgtg < 2:141705/76‑2 (MQ=255) tgttgtGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgtg > 1:73132/1‑75 (MQ=255) ttgtGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgtgtt < 2:131357/76‑4 (MQ=255) ttgtGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCgt‑‑tgtgtt < 1:957743/76‑4 (MQ=255) gATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTa > 2:869663/1‑76 (MQ=255) tCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATc < 1:1286422/76‑1 (MQ=255) cGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCg > 2:1670122/1‑76 (MQ=255) cTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTg > 2:520400/1‑76 (MQ=255) cTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTg < 2:1151803/76‑1 (MQ=255) cTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTAGGTATCGTg < 2:8508/76‑1 (MQ=255) aTCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGt > 1:1801065/1‑76 (MQ=255) aTCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGt > 1:1553914/1‑76 (MQ=255) cGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTa > 2:1306661/1‑76 (MQ=255) gCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTAt < 2:508612/76‑1 (MQ=255) tGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCgg < 1:175002/76‑1 (MQ=255) ggCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGt > 1:1500837/1‑76 (MQ=255) ggCTGCGGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGt < 2:797929/76‑1 (MQ=255) gctgctGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTa < 2:591753/76‑1 (MQ=255) gctgcACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAaag > 2:803608/1‑76 (MQ=255) gctgcACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAaag > 1:1109852/1‑76 (MQ=255) tgcACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAaagaa < 2:39165/76‑1 (MQ=255) gcACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAaagaag < 1:721155/76‑1 (MQ=255) gcACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAaagaag < 1:561430/76‑1 (MQ=255) acaATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGcc > 2:1831374/1‑76 (MQ=255) aaTCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCtt < 2:660711/76‑1 (MQ=255) aTCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTc < 1:1671360/76‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTcgc > 2:1487253/1‑76 (MQ=255) cAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTcgc > 2:503313/1‑76 (MQ=255) aGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTcgcg > 2:1268804/1‑76 (MQ=255) aGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGCATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTcgcg > 2:147556/1‑76 (MQ=255) aaGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATg < 2:1621263/76‑1 (MQ=255) aaGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATg > 2:811310/1‑76 (MQ=255) aGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGa > 2:1183735/1‑76 (MQ=255) gTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGaa < 1:1541069/76‑1 (MQ=255) gTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGaa > 2:1905605/1‑76 (MQ=255) gTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGaa < 1:521094/76‑1 (MQ=255) ttGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGaaa < 2:866759/76‑1 (MQ=255) ttGCGCGTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGaaa < 1:1576846/76‑1 (MQ=255) cgcgTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGt < 1:979938/76‑1 (MQ=255) cgTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgc > 2:1376300/1‑76 (MQ=255) gTATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgct > 1:34500/1‑76 (MQ=255) gTAGGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgct < 1:518982/76‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg > 2:1053988/1‑76 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg < 1:1861659/76‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg > 2:1697430/1‑76 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg < 1:1514413/76‑1 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg > 2:449613/1‑76 (MQ=255) tATGGCGCTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGtgctg < 2:239346/76‑1 (MQ=255) gcTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGTGCTGCGcgtc > 2:1607468/1‑76 (MQ=255) cTGGGCGTTGTGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGTGCTGCGcgtcg < 2:1160180/76‑1 (MQ=255) || GGTGTTGTGGCACTGATCGCTATCGCCACCTGGCTGCTGCACAATCAGGAAGTTGCGCGTATGGCGCTGGGCGT‑‑TGTTGCCTTCGGTATCGTGGTTATCTTCGGTAAAGAAGCCTTCGCGATGAAAGGTGCTGCGCGTCG > REL606/1690641‑1690780 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |