New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 2036228 = | 64 (1.070) | 7 (0.130) | 4/130 | 6.9 | 10.7% | coding (731/1113 nt) | wbbC | putative glycosyltransferase WbbC |
? | REL606 | 2036759 = | 62 (1.190) | coding (200/1113 nt) | wbbC | putative glycosyltransferase WbbC | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACTATTA > REL606/2036684‑2036834 | ttACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGAt < 1:702930/76‑1 (MQ=255) tACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGAtt < 1:1251381/76‑1 (MQ=255) gAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATtata < 2:214581/76‑1 (MQ=255) aaaTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAg > 1:920075/1‑76 (MQ=255) aTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGt < 2:1576559/76‑1 (MQ=255) aTTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGt < 1:1603507/76‑1 (MQ=255) tttAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTa < 1:1875735/76‑1 (MQ=255) ttAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTaa < 2:362879/76‑1 (MQ=255) tAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAat > 1:1435136/1‑76 (MQ=255) aaTCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAata > 2:726637/1‑76 (MQ=255) cATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTg < 1:509530/76‑1 (MQ=255) cATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTg < 1:509528/76‑1 (MQ=255) cATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTg > 1:911815/1‑76 (MQ=255) aaaTATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGttt < 1:276534/76‑1 (MQ=255) atatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTc > 2:94013/1‑76 (MQ=255) tatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCt > 1:214866/1‑76 (MQ=255) tatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCt < 1:29361/76‑1 (MQ=255) tatCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCt < 1:29371/76‑1 (MQ=255) tCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTgg > 2:1080778/1‑76 (MQ=255) tCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTgg < 1:694215/76‑1 (MQ=255) cTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGa > 1:502877/1‑76 (MQ=255) cTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGa > 1:21276/1‑76 (MQ=255) cTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGa > 1:487381/1‑76 (MQ=255) cTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGa > 1:1157013/1‑76 (MQ=255) cTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGa > 1:1157026/1‑76 (MQ=255) gTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGaaa > 1:1379803/1‑76 (MQ=255) ttCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGaaaa < 1:1111553/76‑1 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt < 1:300392/76‑1 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt < 1:300426/76‑1 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt < 1:300404/76‑1 (MQ=255) tCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAAt > 2:1274830/1‑76 (MQ=255) tAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGa > 2:145506/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa > 2:547174/1‑76 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa < 1:1090679/76‑1 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa < 1:169697/76‑1 (MQ=255) aaaTAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGaa < 1:169708/76‑1 (MQ=255) acacGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAAtt < 1:821680/76‑1 (MQ=255) acacGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAAtt < 2:1671265/76‑1 (MQ=255) cacGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTc < 1:208444/76‑1 (MQ=255) cgcgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCtt > 1:1422746/1‑76 (MQ=255) cgAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTa < 2:1228692/76‑1 (MQ=255) gAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTaa < 2:917070/76‑1 (MQ=255) gAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTaa > 2:445747/1‑76 (MQ=255) gAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTaa < 2:1749245/76‑1 (MQ=255) gAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTaa < 1:1516427/76‑1 (MQ=255) aTTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAgg > 1:845677/1‑76 (MQ=255) tttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAggg > 1:749889/1‑76 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa > 1:1066730/1‑76 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa > 1:1416581/1‑76 (MQ=255) ttCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGa > 1:1416589/1‑76 (MQ=255) ccATTAATGCCTTTTACAGGA‑TATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATAtt < 2:1866138/76‑1 (MQ=255) aTTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTa < 1:837985/76‑1 (MQ=255) aTTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTa < 2:1536821/76‑1 (MQ=255) aTTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTa > 2:1657110/1‑76 (MQ=255) ttAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAg > 2:293142/1‑76 (MQ=255) tAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGc < 2:1156921/76‑1 (MQ=255) tAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGc < 2:354462/76‑1 (MQ=255) tAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGc > 1:893132/1‑76 (MQ=255) aaTGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGcc < 2:1744249/76‑1 (MQ=255) aaTGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGcc > 2:837272/1‑76 (MQ=255) gCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGCTATTAGCCTgg > 2:881859/1‑76 (MQ=255) gCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTgg > 2:881850/1‑76 (MQ=255) ttttACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGa > 1:674782/1‑76 (MQ=255) ttACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGaac < 1:1231245/76‑1 (MQ=255) aCAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGaacaa < 1:344708/76‑1 (MQ=255) aCAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGaacaa < 1:791577/76‑1 (MQ=255) cAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGaacaac > 2:1260878/1‑76 (MQ=255) cAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGaacaac > 2:54509/1‑76 (MQ=255) gATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtat > 1:471571/1‑76 (MQ=255) gATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtat > 1:471566/1‑76 (MQ=255) gATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtat < 2:110730/76‑1 (MQ=255) gATTATAGGTAATATGATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtat < 2:744480/76‑1 (MQ=255) aTTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatt < 2:1513343/76‑1 (MQ=255) aTTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatt > 2:1552733/1‑76 (MQ=255) aTTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatt < 1:582196/76‑1 (MQ=255) ttATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatta < 2:55789/76‑1 (MQ=255) ttATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatta > 1:443455/1‑76 (MQ=255) ttATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACtatta < 2:915995/76‑1 (MQ=255) | TTACGAAATTTAATCGGCATAAATATCTGTTCGTAAATAACACGCGAAAATTTCCCATTAATGCCTTTTACAGGATTATAGGTAATATTATTGTTTTCTGGAAAATTGAACAATTCTTTAACAGGGATATTAGCCTGGTGAACAACTATTA > REL606/2036684‑2036834 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |