| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 3022429 = | 76 (1.270) | 6 (0.110) | 6/136 | 6.1 | 7.9% | coding (256/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein |
| ? | REL606 | 3022636 = | 71 (1.310) | coding (49/1140 nt) | ECB_02821 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGT > REL606/3022561‑3022709 | tACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCAcc > 1:563912/1‑76 (MQ=255) aCAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCt < 1:406709/76‑1 (MQ=255) aCAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCt > 1:225670/1‑76 (MQ=255) aaaaaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCtttt > 2:58771/1‑76 (MQ=255) aaaaaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCtttt < 2:1569647/76‑1 (MQ=255) aaaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTAt > 2:1673648/1‑76 (MQ=255) aaaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTAt > 2:1673628/1‑76 (MQ=255) aaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATc > 1:84522/1‑76 (MQ=255) aaCACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATc < 1:1148469/76‑1 (MQ=255) acacTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCt < 2:596881/76‑1 (MQ=255) acacTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCt < 1:922887/76‑1 (MQ=255) cacTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCtt < 2:476665/76‑1 (MQ=255) tAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGt < 2:1039048/76‑1 (MQ=255) tAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGt < 1:384036/76‑1 (MQ=255) aaTACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTa > 1:1599068/1‑76 (MQ=255) tACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATc > 1:254232/1‑76 (MQ=255) aCAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTagag < 2:226242/76‑4 (MQ=255) aCAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTagag < 2:226227/76‑4 (MQ=255) aaTCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCttt < 2:1547521/68‑1 (MQ=255) aaTCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCttt > 1:1547521/1‑68 (MQ=255) ccTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatata < 1:1637469/76‑1 (MQ=255) ccTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatata < 1:22179/76‑1 (MQ=255) ccTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatata < 1:1637443/76‑1 (MQ=255) cTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatat > 1:889625/1‑76 (MQ=255) tGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatat < 2:331506/76‑1 (MQ=255) tGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatat > 2:1086780/1‑76 (MQ=255) ttattaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatatat < 1:1247775/76‑1 (MQ=255) tattaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCtatatatatata > 2:1690369/1‑76 (MQ=255) tattaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTCTTATCTTTGTATCtatatatatata > 1:184277/1‑76 (MQ=255) attaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataa < 2:1248459/76‑1 (MQ=255) ttaAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataat < 1:1846269/76‑1 (MQ=255) taAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataata > 2:919128/1‑76 (MQ=255) taAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataata > 2:919112/1‑76 (MQ=255) aaaTACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataatat > 2:736658/1‑76 (MQ=255) aaTACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATatataatata > 2:312582/1‑76 (MQ=255) tACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAgg > 1:1463007/1‑76 (MQ=255) aCTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATC‑‑TATATATATAATATAGGCta > 2:261885/1‑76 (MQ=255) cTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCt > 2:1376177/1‑76 (MQ=255) ttGTGATTTTGAGTAACGAATAAATTGCTCACATGCGCCTTTTATCTTTGTATATATATATATATAATATAGGCta < 2:858336/76‑1 (MQ=255) ttGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCta < 2:858340/76‑1 (MQ=255) gtgATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCtatt < 1:337757/76‑1 (MQ=255) tgATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCtatta > 2:939587/1‑76 (MQ=255) aTTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTattatt < 1:268204/76‑1 (MQ=255) aTTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTattatt > 2:836055/1‑76 (MQ=255) tGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTgg < 2:574593/76‑1 (MQ=255) tGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTgg > 1:597105/1‑76 (MQ=255) tGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTgg > 1:597119/1‑76 (MQ=255) gAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGa < 1:1734586/76‑1 (MQ=255) aaaGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGAc < 2:654256/76‑1 (MQ=255) aaaGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATC‑‑TATATATATAATATAGGCTATTATTGGACAt > 1:129161/1‑76 (MQ=255) aGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACAt > 1:34647/1‑76 (MQ=255) gTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATa < 1:58771/76‑1 (MQ=255) tAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATaa < 2:1553992/76‑1 (MQ=255) aaCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAAt > 2:1571100/1‑76 (MQ=255) aaCGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAAt > 1:1152208/1‑76 (MQ=255) cGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGt < 1:1409754/76‑1 (MQ=255) gAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTa < 1:895628/76‑1 (MQ=255) aaTAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTAt < 1:82354/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATg < 1:1517959/76‑1 (MQ=255) aTAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATg > 2:1087530/1‑76 (MQ=255) tAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTGGTATCTATATATATATAATATGGGCTATTATTGGACATAATGTATGc < 1:1074301/76‑1 (MQ=255) gCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTg < 1:298157/76‑1 (MQ=255) cTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGt < 1:1642953/76‑1 (MQ=255) cTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGt > 2:1604589/1‑76 (MQ=255) tCAAATGTACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGta < 2:1200684/76‑1 (MQ=255) tCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGta < 2:1200673/76‑1 (MQ=255) cAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtat > 2:1310111/1‑76 (MQ=255) cAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtat > 2:1040476/1‑76 (MQ=255) cAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtat < 2:8794/76‑1 (MQ=255) cAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtat < 2:889625/76‑1 (MQ=255) aaaTGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtatt > 1:827542/1‑76 (MQ=255) aTGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtattta < 2:656314/76‑1 (MQ=255) tGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGtatttat > 1:1018761/1‑76 (MQ=255) cACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTg > 1:228231/1‑76 (MQ=255) aCCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGt > 1:1295155/1‑76 (MQ=255) aCCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGt > 1:1701645/1‑76 (MQ=255) | TACAAAAAACACTAATACAATCCTTGTTATTAAATACTTGTGATTGAAAGTAACGAATAAGTTGCTCAAATGCACCTTTTATCTTTGTATCTATATATATATAATATAGGCTATTATTGGACATAATGTATGCCCCTTGTATTTATTGT > REL606/3022561‑3022709 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |