| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | REL606 | 1,875,483 | 0 | G | C | 22.7% | 332.8 / 83.2 | 128 | intergenic (+156/‑28) | yeaB/sdaA | predicted NUDIX hydrolase/L‑serine deaminase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/48); new base C (29/0); total (80/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.29e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCT > REL606/1875408‑1875558 | tAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAg > 1:1730514/1‑76 (MQ=255)tAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAg < 2:283628/76‑1 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTc < 2:111512/76‑1 (MQ=255) aTTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTc > 1:645988/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCa > 2:616917/1‑76 (MQ=255) tCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCa > 1:1314326/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:1371097/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:205877/1‑76 (MQ=255) cATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAg > 1:500693/1‑76 (MQ=255) aTGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGt > 1:1047636/1‑76 (MQ=255) tgtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTc > 1:1576704/1‑76 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTcc > 2:323091/1‑75 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCa < 1:834995/76‑1 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:912868/1‑76 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:1447012/1‑76 (MQ=255) gtgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCa > 1:1072129/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAc > 2:866592/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAc > 1:18697/1‑76 (MQ=255) tgAATAGTTAAGCCAGTAGCCGCGCTCGCTCTTACACTATGCGCTGATCTTAGCTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAc > 2:100335/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCAcc > 2:1652734/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:1680031/1‑76 (MQ=255) gAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCAcc > 1:200816/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCt < 2:634810/76‑1 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:437485/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:901984/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:837150/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:771574/1‑76 (MQ=255) aaTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGCTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCt > 1:1365635/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCtt > 1:423957/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCtt < 1:1290220/76‑1 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCtt > 1:808636/1‑76 (MQ=255) aTAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCtt > 1:1212734/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTg < 1:1028726/76‑1 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTg < 1:1506163/76‑1 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTg > 1:115592/1‑76 (MQ=255) tAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTg > 1:161173/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGt > 1:244319/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGt > 2:6956/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGt > 1:1755127/1‑76 (MQ=255) aGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGt > 1:1668000/1‑76 (MQ=255) gTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTc < 2:1795380/76‑1 (MQ=255) gTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGta > 1:24446/1‑75 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACGCTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAg < 1:146634/76‑1 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAg > 2:1422538/1‑76 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAg > 2:170836/1‑76 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:562642/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:747414/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:21851/1‑73 (MQ=255) tAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAACTCCAGTCACCTTGtaat > 1:1790958/1‑73 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACCCTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 2:464005/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 2:1138051/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg < 1:203097/76‑1 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 2:169819/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAgg > 2:1480456/1‑76 (MQ=255) aaGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGACACCTTGTCAgg > 1:528283/1‑76 (MQ=255) ccAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGt < 2:851079/76‑1 (MQ=255) aGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtat > 2:1466787/1‑76 (MQ=255) gTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtatt < 2:265714/76‑1 (MQ=255) gTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtatt < 1:1805314/76‑1 (MQ=255) tCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtatta > 2:1348419/1‑76 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat < 1:891298/76‑1 (MQ=255) cgccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGtattat < 1:219908/76‑1 (MQ=255) gccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATc > 2:1897759/1‑76 (MQ=255) gccgcGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATc > 1:341629/1‑76 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg < 2:59730/76‑1 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg > 1:432708/1‑76 (MQ=255) gcgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTg < 2:130444/76‑1 (MQ=255) cgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGa > 2:693371/1‑76 (MQ=255) cgTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGa > 2:73655/1‑76 (MQ=255) gTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAt > 1:783931/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 2:215050/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 1:1650480/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt < 1:357046/76‑1 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 2:1173490/1‑76 (MQ=255) ttCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGAtt > 1:679173/1‑76 (MQ=255) tCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTa > 2:1498255/1‑76 (MQ=255) tACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTAtt < 1:929140/76‑1 (MQ=255) aTGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACAt > 1:1123114/1‑76 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 2:484057/76‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 2:498704/76‑1 (MQ=255) cTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTa < 1:638491/76‑1 (MQ=255) gTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAg > 1:44814/1‑76 (MQ=255) gTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAg > 1:177566/1‑76 (MQ=255) ttattaGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAgg < 1:690279/76‑1 (MQ=255) gTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGa < 1:1188466/76‑1 (MQ=255) ttCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAt > 2:1193422/1‑76 (MQ=255) tCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAtt < 1:201050/76‑1 (MQ=255) tCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAtt < 2:1382358/76‑1 (MQ=255) tCGTTAATGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGAtt < 2:1768169/76‑1 (MQ=255) gTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGt > 2:1210407/1‑60 (MQ=255) gTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGt < 1:1210407/60‑1 (MQ=255) ttACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGt > 2:1671487/1‑76 (MQ=255) tACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTc < 1:1891658/76‑1 (MQ=255) tACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTc < 1:1276302/76‑1 (MQ=255) aCTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTcc > 1:1853383/1‑76 (MQ=255) ggAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTc < 2:1429639/76‑1 (MQ=255) gAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCa < 1:128878/76‑1 (MQ=255) aaGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCAt < 1:1705764/76‑1 (MQ=255) aaGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCAt < 2:1085193/76‑1 (MQ=255) gTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCt < 2:1003932/76‑1 (MQ=255) | TAATTCATGTGAATAGTTAAGCCAGTCGCCGCGTTCCCTCTTACACTATGCGCTGTTATTAGTTCGTTACTGGAAGTCCAGTCACCTTGTCAGGAGTATTATCGTGATTAGTCTATTCGACATGTTTAAGGTGGGGATTGGTCCCTCATCT > REL606/1875408‑1875558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |