| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | REL606 | 4,134,769 | Δ3 bp | intergenic (‑61/‑91) | argE ← / → argC | acetylornithine deacetylase/N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | = 4134768 | 7 (0.110) | 73 (1.180) | 52/150 | 0.1 | 91.8% | intergenic (‑60/‑94) | argE/argC | acetylornithine deacetylase/N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase |
| ? | REL606 | 4134772 = | 6 (0.100) | intergenic (‑64/‑90) | argE/argC | acetylornithine deacetylase/N‑acetyl‑gamma‑glutamyl‑phosphate reductase | |||||
TTTTTCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAACGTTGAGCGTAATAAAACCCACCAGCCGTAAGGTGAATGTTTTACGTTTAACCTGGCAACCAGACATAAGA > REL606/4134701‑4134846 | tttttCATTGTTGACACACCTCTGGTCATGATAGTATCAATATTCATGCAGTATTTATGAATAAAAATACACTAAc > 1:1348900/1‑76 (MQ=255)tttgtttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAAc > 1:1438628‑M2/72‑76 (MQ=255) ttgtttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACg < 1:1422292‑M2/6‑1 (MQ=255) tgtttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACGt > 1:80172‑M2/70‑76 (MQ=255) tttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACGTTg < 1:1639394‑M2/9‑1 (MQ=255) tttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACGTTg < 1:617602‑M2/9‑1 (MQ=255) tttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACGTTg > 1:293631‑M2/68‑76 (MQ=255) ttttcattgttgacacacctctggtcatgatagtatcaatattcatgcagtatttatgaataaaatCTAACGTTGa < 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REL606/4134701‑4134846 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |