| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 2039179 = | 30 (0.480) | 6 (0.100) | 5/140 | 6.5 | 11.3% | coding (516/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA |
| ? | REL606 | 2039571 = | 66 (1.140) | coding (124/747 nt) | wbbA | putative glycosyltransferase WbbA | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGATTATTTTT > REL606/2039496‑2039646 | gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 1:94793/76‑1 (MQ=255)gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 1:760179/76‑1 (MQ=255)gtTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTtata < 1:760164/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat > 2:349183/1‑76 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat < 1:487194/76‑1 (MQ=255) ttGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTatat > 1:1767563/1‑76 (MQ=255) tGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATAtt < 1:223302/76‑1 (MQ=255) aaCGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGAtt < 1:428674/76‑1 (MQ=255) cGGATCTAAGAAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCt < 1:1056993/76‑1 (MQ=255) gATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCttt < 1:167439/76‑1 (MQ=255) tCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTa > 2:1920033/1‑76 (MQ=255) tCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTa < 2:1159677/76‑1 (MQ=255) cTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAt < 1:666609/76‑1 (MQ=255) tAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTAtt > 1:777353/1‑76 (MQ=255) aaGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTg < 1:935693/76‑1 (MQ=255) aGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGt < 1:1936955/76‑1 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt > 2:1563870/1‑76 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt > 2:1644015/1‑76 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt < 1:959521/76‑1 (MQ=255) gAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAt < 1:1030269/76‑1 (MQ=255) aaGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAtt > 2:1800971/1‑76 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 1:1244039/76‑1 (MQ=255) aGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTAttt < 2:718941/76‑1 (MQ=255) gCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTta < 1:706976/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:255445/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 1:255465/76‑1 (MQ=255) cAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTtat < 2:1966982/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 2:883985/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 2:403732/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCGATTTGGTCTGTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 1:1789800/76‑1 (MQ=255) aCGTTTAATGAGCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATaa < 1:1789783/76‑1 (MQ=255) tttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAt > 2:1291228/1‑76 (MQ=255) tttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAt > 1:380074/1‑76 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt < 1:1534287/76‑1 (MQ=255) ttAATGATCCATCAAAAATAAAACTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAtt < 1:1534270/76‑1 (MQ=255) tAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGAttt < 1:973987/76‑1 (MQ=255) aaTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTta > 1:1626483/1‑76 (MQ=255) aTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTtat < 1:179209/76‑1 (MQ=255) aTGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATCtat > 1:459321/1‑76 (MQ=255) aTCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATaaa > 1:593645/1‑76 (MQ=255) ccATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAAc > 1:735454/1‑76 (MQ=255) tgtaaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACaa > 2:926852/4‑76 (MQ=255) tgtaaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACaa > 2:926828/4‑76 (MQ=255) aTCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACaa > 1:839466/1‑76 (MQ=255) aaaaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAAttt > 2:1793150/1‑76 (MQ=255) aaaTAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTc > 1:607250/1‑76 (MQ=255) aaaaGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGa > 2:1992740/1‑76 (MQ=255) gTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaa < 1:1963721/76‑1 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaaa < 2:824881/76‑1 (MQ=255) tAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTaaa < 1:584907/76‑1 (MQ=255) aaaTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAAc > 2:271141/1‑76 (MQ=255) aTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCa > 2:1450308/1‑76 (MQ=255) aTGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCa > 2:1629703/1‑76 (MQ=255) cTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTc > 1:1924777/1‑76 (MQ=255) cTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTc > 2:1718798/1‑76 (MQ=255) tATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCa > 1:967123/1‑76 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg > 2:245443/1‑76 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg < 1:752043/76‑1 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg > 1:432665/1‑76 (MQ=255) aTTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAg < 1:217184/76‑1 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc > 1:1250281/1‑76 (MQ=255) ttGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGc > 1:1250296/1‑76 (MQ=255) ggTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCg > 1:1052599/1‑76 (MQ=255) ggTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCg > 1:1867670/1‑76 (MQ=255) cTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatt > 1:556887/1‑76 (MQ=255) cTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatt > 1:457597/1‑76 (MQ=255) tttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatta > 1:516175/1‑76 (MQ=255) tttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatta > 1:227965/1‑76 (MQ=255) tttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatta > 1:1615432/1‑76 (MQ=255) tttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGatta > 1:1419719/1‑76 (MQ=255) ttATATTTAGTTTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGattat > 1:627792/1‑76 (MQ=255) ttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGattat > 1:627812/1‑76 (MQ=255) ttATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGattat > 1:334966/1‑76 (MQ=255) atatTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGATTAttt > 2:566831/1‑76 (MQ=255) atTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGATTAttttt < 2:1326816/76‑1 (MQ=255) | GTTGATATAACGGATCTAAGGAAGCAACGTTTAATGATCCATCAAAAATAAAAGTAAATGCTATTTGGTCTTTATATTTAGATTCTTTTATTGTATTTATAAGATTTATAAAACAATTTTCATGACTAAACCACTCAGGCCGATTATTTTT > REL606/2039496‑2039646 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |