New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | REL606 | 3303564 = | 53 (1.030) | 3 (0.070) | 3/134 | 5.0 | 5.8% | coding (798/1368 nt) | dcuD | predicted transporter |
? | REL606 | 3303584 = | 50 (1.080) | coding (818/1368 nt) | dcuD | predicted transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAAC > REL606/3303512‑3303659 | tgATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggt > 1:220047/1‑76 (MQ=255) tgATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggt > 1:657581/1‑76 (MQ=255) ccGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCtggtggtgg < 2:34048/76‑1 (MQ=255) cGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTggtggtggt > 2:1005384/1‑76 (MQ=255) ttAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGa > 1:492438/1‑76 (MQ=255) tAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGAt < 1:1333171/76‑1 (MQ=255) tAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCCGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGGGAt > 1:73349/1‑76 (MQ=255) aaTCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATg < 2:647875/76‑1 (MQ=255) tCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGtt < 1:1397849/76‑1 (MQ=255) tCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGtt < 1:1645805/76‑1 (MQ=255) cTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTAc < 1:1298203/76‑1 (MQ=255) gATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTg < 2:699071/76‑1 (MQ=255) gATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGGGGTGAGGTTGCTg > 2:240185/1‑76 (MQ=255) tGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAg < 1:1552222/76‑1 (MQ=255) tcggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGttt < 1:680208/76‑1 (MQ=255) tcggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGttt < 1:777774/76‑1 (MQ=255) tcggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGttt > 2:1548903/1‑76 (MQ=255) cggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTg > 2:86649/1‑76 (MQ=255) cggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTg > 2:60086/1‑76 (MQ=255) cggctcgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGGGGTGATGTTACTGAGTTTg > 2:896324/1‑76 (MQ=255) cgCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACtgt < 1:29563/76‑1 (MQ=255) gCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACtgtg > 1:1145968/1‑76 (MQ=255) gCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACtgtg < 2:1526113/76‑1 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCCGAACTGCATCTGGTGGGGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:914835/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:1318705/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:772954/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 1:900152/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:529258/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:866571/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:249813/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:1625647/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:1149339/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGAGATGTTACTGAGCTTGACTGTGACg > 2:1609375/1‑76 (MQ=255) gTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGGGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACg > 2:1471338/1‑76 (MQ=255) cGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCCTCTGGCGGTGGCGATGTTACTGAGTTTGCCTGCGCCGAcgttt > 2:185804/1‑76 (MQ=255) cGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGAtgttgtgt > 2:1657220/1‑74 (MQ=255) cGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGAtgttt > 2:791475/1‑76 (MQ=255) cGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGAtgttt > 2:976079/1‑76 (MQ=255) cACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTttgttg < 1:959906/76‑1 (MQ=255) cGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGttc < 2:586141/76‑1 (MQ=255) cTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTcc < 1:1140740/76‑1 (MQ=255) gATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGc > 2:1358507/1‑76 (MQ=255) aTGCAGTCAGAACTTCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCa < 2:477438/76‑1 (MQ=255) aTGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCa < 2:1325122/76‑1 (MQ=255) aTGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCAGCa < 2:9419/76‑1 (MQ=255) cAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGc < 2:1246247/76‑1 (MQ=255) cAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGc < 2:99131/76‑1 (MQ=255) tCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATa < 2:707977/76‑1 (MQ=255) cAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATaa > 1:956379/1‑76 (MQ=255) aGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAAc < 2:133586/76‑1 (MQ=255) cTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTgc < 2:73349/76‑1 (MQ=255) tGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTgcg < 1:1585087/76‑1 (MQ=255) aTCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGa > 1:548255/1‑76 (MQ=255) aTCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGa < 2:436091/76‑1 (MQ=255) tggtggtggTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAAc < 1:821834/76‑1 (MQ=255) tggtggtggTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAAc < 2:223266/76‑1 (MQ=255) | TGATGCCGTTAATCCTGATGCTCGGCTCGCTGTTCCTCGCCCACGTCGGGCTGATGCAGTCAGAACTGCATCTGGTGGTGGTGATGTTACTGAGTTTGACTGTGACGATGTTTGTTGAGTTCTTCCGCAAGCATAACTTGCGCGAAAC > REL606/3303512‑3303659 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |