| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | REL606 | 23979 = | NA (NA) | 3 (0.060) | 3/142 | 6.6 | 3.6% | noncoding (689/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | REL606 | 24489 = | 86 (1.640) | intergenic (‑85/+212) | ECB_00025/ECB_00026 | conserved hypothetical protein/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TGAAGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGATATT > REL606/24415‑24564 | tGAAGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTaag > 2:588780/1‑76 (MQ=255)tGAAGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTaag < 1:1189122/76‑1 (MQ=255) gAAGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTaaga > 1:534905/1‑76 (MQ=255) aaGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTaagaa > 1:1016357/1‑76 (MQ=255) ttGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTa < 2:953075/76‑1 (MQ=255) tgatgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTAc > 1:23235/1‑76 (MQ=255) tgatgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTAc > 1:1543585/1‑76 (MQ=255) gatgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACa < 2:43006/76‑1 (MQ=255) gatgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACa < 1:562757/76‑1 (MQ=255) atgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACaa < 1:524077/76‑1 (MQ=255) atgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACaa > 1:1088439/1‑76 (MQ=255) atgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACaa < 1:959379/76‑1 (MQ=255) atgaATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACaa < 1:1661787/76‑1 (MQ=255) tttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaa < 2:1151750/76‑1 (MQ=255) tttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaa > 1:489348/1‑76 (MQ=255) tttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaa > 1:438077/1‑76 (MQ=255) tttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaa < 2:1151747/76‑1 (MQ=255) ttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaaa < 2:829903/76‑1 (MQ=255) ttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaaa < 2:829906/76‑1 (MQ=255) ttttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATaaa < 2:829911/76‑1 (MQ=255) tttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAAt < 1:974809/76‑1 (MQ=255) tttATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAAt < 1:974790/76‑1 (MQ=255) ttattaATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATa > 1:1175314/1‑76 (MQ=255) tattaATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAg > 2:188209/1‑76 (MQ=255) tattaATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAg < 2:484220/76‑1 (MQ=255) ttaatttaatTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGt < 2:1276675/76‑1 (MQ=255) taatttaattTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTa > 2:835885/1‑76 (MQ=255) aatttaatttATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTAt > 2:1601640/1‑76 (MQ=255) atttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTAtt > 1:1483019/1‑76 (MQ=255) tttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTAttt < 1:1470947/76‑1 (MQ=255) tttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTAttt > 2:400059/1‑76 (MQ=255) tttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTAttt > 2:400049/1‑76 (MQ=255) ttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa > 2:381692/1‑76 (MQ=255) ttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa < 2:486872/76‑1 (MQ=255) ttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa > 2:58283/1‑76 (MQ=255) ttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa < 2:730182/76‑1 (MQ=255) ttaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa < 2:930298/76‑1 (MQ=255) ttaatttaTGAGCGAATGCGACTAATATCAAAAATCGCTAAAAAATTATACGAAGTACAATATACATAAGAATTTa > 2:58331/1‑76 (MQ=255) ntaatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTa > 1:1185046/2‑76 (MQ=255) taatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTaa < 1:679854/76‑1 (MQ=255) taatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTaa < 1:653771/76‑1 (MQ=255) taatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTaa < 1:1303783/76‑1 (MQ=255) taatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTaa < 1:1303764/76‑1 (MQ=255) aatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAAc > 2:1611533/1‑76 (MQ=255) aatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAAc < 1:250242/76‑1 (MQ=255) aatttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAAc < 2:1067585/76‑1 (MQ=255) atttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAAcc > 2:196910/1‑76 (MQ=255) atttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAAcc > 2:1443888/1‑76 (MQ=255) atttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTCAAcc < 1:1016002/76‑1 (MQ=255) tttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAATCt < 1:380369/76‑1 (MQ=255) tttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCt < 1:380383/76‑1 (MQ=255) ttaTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCtg < 2:1551202/76‑1 (MQ=255) taTGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCtgt > 2:1443904/1‑76 (MQ=255) gTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGa > 1:80145/1‑76 (MQ=255) tGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGAt < 1:1173317/76‑1 (MQ=255) gAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGAtt < 2:302147/76‑1 (MQ=255) aaTGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTg > 2:157955/1‑76 (MQ=255) aaTGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTg > 2:157933/1‑76 (MQ=255) aTGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGc < 1:692805/76‑1 (MQ=255) gtgACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTg > 1:1389849/1‑76 (MQ=255) gtgACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTg > 1:1389857/1‑76 (MQ=255) actaTCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTtaata > 2:140084/1‑76 (MQ=255) aTCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAAtt > 2:1509966/1‑76 (MQ=255) tCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAAttt < 1:491580/76‑1 (MQ=255) aaaaTCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACa > 2:1300479/1‑76 (MQ=255) aTCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAgg < 1:1582828/76‑1 (MQ=255) aTCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAgg < 1:1582846/76‑1 (MQ=255) cTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTa < 1:825126/76‑1 (MQ=255) cTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTa < 1:613640/76‑1 (MQ=255) cTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTa < 1:333437/76‑1 (MQ=255) tCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTaa > 1:1435049/1‑76 (MQ=255) aTTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATg < 2:1190000/76‑1 (MQ=255) aTTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATg < 2:850303/76‑1 (MQ=255) aTTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATg < 2:1189992/76‑1 (MQ=255) ttAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATga < 1:744776/76‑1 (MQ=255) tAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATgag < 1:858784/76‑1 (MQ=255) aaTTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATgagg > 2:823198/1‑76 (MQ=255) aTTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATgagga > 2:306643/1‑76 (MQ=255) ttttAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATgaggag < 1:1134401/76‑1 (MQ=255) ttttAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATgaggag > 1:57951/1‑76 (MQ=255) tttAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGgaga < 1:1646694/76‑1 (MQ=255) ttAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGat > 2:594022/1‑76 (MQ=255) tAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGata < 2:1023908/76‑1 (MQ=255) aagaagTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGatat > 2:483589/1‑76 (MQ=255) aagaagTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGatat > 2:1079704/1‑76 (MQ=255) aagaagTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGatat > 1:703317/1‑76 (MQ=255) agaagTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGATAtt > 2:13701/1‑76 (MQ=255) | TGAAGTTGATGAATTTTTATTAATTTAATTTATGAGTGAATGTGACTACTATCAAAAATCGCTCATTAATTTTAAGAAGTACAATATAAATAGGTATTTAACCTGTGTTGATTGCTGTTAATAATTTACAAGGTCTAATGAGGAGATATT > REL606/24415‑24564 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |